Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G044800.1
Synonym JMT, Sb02g003820
Functional annotation SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed
UniProt C5XAB4
Pfam PF03492
Panther DB PTHR31009 PTHR31009:SF16
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008168; methyltransferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G04370 : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g13310.1 : SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G364950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G044800 Sobic002G044800 Sobic010G226400 Sobic010G226400 Sobic002G044800--Sobic010G226400 Sobic004G333150 Sobic004G333150 Sobic002G044800--Sobic004G333150 Sobic004G240600 Sobic004G240600 Sobic002G044800--Sobic004G240600 Sobic009G021900 Sobic009G021900 Sobic002G044800--Sobic009G021900 Sobic002G389301 Sobic002G389301 Sobic002G044800--Sobic002G389301 Sobic002G040900 Sobic002G040900 Sobic002G044800--Sobic002G040900 Sobic009G196400 Sobic009G196400 Sobic002G044800--Sobic009G196400 Sobic009G009700 Sobic009G009700 Sobic002G044800--Sobic009G009700 Sobic003G087300 Sobic003G087300 Sobic002G044800--Sobic003G087300 Sobic010G226400--Sobic002G044800 Sobic010G063000 Sobic010G063000 Sobic010G226400--Sobic010G063000 Sobic005G014000 Sobic005G014000 Sobic010G226400--Sobic005G014000 Sobic010G158500 Sobic010G158500 Sobic010G226400--Sobic010G158500 Sobic006G078900 Sobic006G078900 Sobic010G226400--Sobic006G078900 Sobic008G144600 Sobic008G144600 Sobic010G226400--Sobic008G144600 Sobic002G125700 Sobic002G125700 Sobic010G226400--Sobic002G125700 Sobic007G204700 Sobic007G204700 Sobic010G226400--Sobic007G204700 Sobic003G280400 Sobic003G280400 Sobic010G226400--Sobic003G280400 Sobic004G333150--Sobic004G240600 Sobic010G052700 Sobic010G052700 Sobic004G333150--Sobic010G052700 Sobic004G333150--Sobic003G087300 Sobic009G106800 Sobic009G106800 Sobic004G333150--Sobic009G106800 Sobic005G203100 Sobic005G203100 Sobic004G333150--Sobic005G203100 Sobic004G273400 Sobic004G273400 Sobic004G333150--Sobic004G273400 Sobic002G421800 Sobic002G421800 Sobic004G333150--Sobic002G421800 Sobic004G333150--Sobic009G196400 Sobic001G100700 Sobic001G100700 Sobic004G333150--Sobic001G100700 Sobic006G190700 Sobic006G190700 Sobic004G240600--Sobic006G190700 Sobic004G240600--Sobic004G333150 Sobic002G139300 Sobic002G139300 Sobic004G240600--Sobic002G139300 Sobic004G240600--Sobic009G196400 Sobic004G240600--Sobic010G052700 Sobic001G333400 Sobic001G333400 Sobic004G240600--Sobic001G333400 Sobic005G011200 Sobic005G011200 Sobic004G240600--Sobic005G011200 Sobic004G240600--Sobic009G106800 Sobic008G158100 Sobic008G158100 Sobic004G240600--Sobic008G158100 Sobic008G076300 Sobic008G076300 Sobic009G021900--Sobic008G076300 Sobic009G021900--Sobic002G044800 Sobic009G079925 Sobic009G079925 Sobic009G021900--Sobic009G079925 Sobic009G021900--Sobic002G389301 Sobic004G182000 Sobic004G182000 Sobic009G021900--Sobic004G182000 Sobic009G021900--Sobic009G009700 Sobic009G021800 Sobic009G021800 Sobic009G021900--Sobic009G021800 Sobic003G199101 Sobic003G199101 Sobic009G021900--Sobic003G199101 Sobic009G071100 Sobic009G071100 Sobic009G021900--Sobic009G071100 Sobic002G389301--Sobic002G044800 Sobic007G065800 Sobic007G065800 Sobic002G389301--Sobic007G065800 Sobic002G389301--Sobic004G333150 Sobic002G389301--Sobic004G240600 Sobic002G389301--Sobic009G009700 Sobic002G389301--Sobic006G190700 Sobic006G214600 Sobic006G214600 Sobic002G389301--Sobic006G214600 Sobic009G009600 Sobic009G009600 Sobic002G389301--Sobic009G009600 Sobic002G389301--Sobic009G021900 Sobic004G148100 Sobic004G148100 Sobic002G040900--Sobic004G148100 Sobic001G054500 Sobic001G054500 Sobic002G040900--Sobic001G054500 Sobic001G256200 Sobic001G256200 Sobic002G040900--Sobic001G256200 Sobic002G042000 Sobic002G042000 Sobic002G040900--Sobic002G042000 Sobic006G113500 Sobic006G113500 Sobic002G040900--Sobic006G113500 Sobic007G008100 Sobic007G008100 Sobic002G040900--Sobic007G008100 Sobic005G177600 Sobic005G177600 Sobic002G040900--Sobic005G177600 Sobic006G162100 Sobic006G162100 Sobic002G040900--Sobic006G162100 Sobic007G144501 Sobic007G144501 Sobic002G040900--Sobic007G144501 Sobic001G444400 Sobic001G444400 Sobic009G196400--Sobic001G444400 Sobic009G196400--Sobic002G139300 Sobic006G153100 Sobic006G153100 Sobic009G196400--Sobic006G153100 Sobic009G196400--Sobic002G421800 Sobic009G196400--Sobic001G333400 Sobic009G196400--Sobic009G106800 Sobic009G196400--Sobic004G240600 Sobic009G196400--Sobic003G087300 Sobic007G141500 Sobic007G141500 Sobic009G196400--Sobic007G141500 Sobic009G009700--Sobic001G054500 Sobic009G009700--Sobic002G040900 Sobic009G009700--Sobic001G256200 Sobic009G009700--Sobic004G148100 Sobic009G009700--Sobic002G042000 Sobic009G009700--Sobic009G009600 Sobic009G009700--Sobic007G008100 Sobic003G155600 Sobic003G155600 Sobic009G009700--Sobic003G155600 Sobic002G093700 Sobic002G093700 Sobic009G009700--Sobic002G093700 Sobic002G416600 Sobic002G416600 Sobic003G087300--Sobic002G416600 Sobic003G087300--Sobic010G052700 Sobic010G239300 Sobic010G239300 Sobic003G087300--Sobic010G239300 Sobic003G087300--Sobic007G141500 Sobic006G039100 Sobic006G039100 Sobic003G087300--Sobic006G039100 Sobic004G166700 Sobic004G166700 Sobic003G087300--Sobic004G166700 Sobic009G231000 Sobic009G231000 Sobic003G087300--Sobic009G231000 Sobic003G087300--Sobic002G125700 Sobic001G252300 Sobic001G252300 Sobic003G087300--Sobic001G252300
Octagon: transcription factors


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