Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G021900.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R0H0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G076300 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
2 Sobic.002G044800 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.009G079925 - -
4 Sobic.002G389301 - -
5 Sobic.004G182000 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.009G009700 expressed protein -
7 Sobic.009G021800 - -
8 Sobic.003G199101 - -
9 Sobic.009G071100 acid phosphatase, putative, expressed -
10 Sobic.006G011900 dirigent, putative -
11 Sobic.010G176101 - -
12 Sobic.009G009600 expressed protein -
13 Sobic.004G240600 tRNA synthetase, putative, expressed K01866: YARS, tyrosyl-tRNA synthetase
14 Sobic.004G333150 - -
15 Sobic.006G068300 RCN4 Centroradialis-like1 homologous to TFL1 gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed -
16 Sobic.002G040900 VQ domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.005G203100 tropinone reductase 2, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
18 Sobic.004G023500 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
19 Sobic.007G065800 Cupin domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G112300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G021900 Sobic009G021900 Sobic008G076300 Sobic008G076300 Sobic009G021900--Sobic008G076300 Sobic002G044800 Sobic002G044800 Sobic009G021900--Sobic002G044800 Sobic009G079925 Sobic009G079925 Sobic009G021900--Sobic009G079925 Sobic002G389301 Sobic002G389301 Sobic009G021900--Sobic002G389301 Sobic004G182000 Sobic004G182000 Sobic009G021900--Sobic004G182000 Sobic009G009700 Sobic009G009700 Sobic009G021900--Sobic009G009700 Sobic009G021800 Sobic009G021800 Sobic009G021900--Sobic009G021800 Sobic003G199101 Sobic003G199101 Sobic009G021900--Sobic003G199101 Sobic009G071100 Sobic009G071100 Sobic009G021900--Sobic009G071100 Sobic008G076300--Sobic009G079925 Sobic008G076300--Sobic009G021900 Sobic010G176101 Sobic010G176101 Sobic008G076300--Sobic010G176101 Sobic002G109800 Sobic002G109800 Sobic008G076300--Sobic002G109800 Sobic010G226400 Sobic010G226400 Sobic002G044800--Sobic010G226400 Sobic004G333150 Sobic004G333150 Sobic002G044800--Sobic004G333150 Sobic004G240600 Sobic004G240600 Sobic002G044800--Sobic004G240600 Sobic002G044800--Sobic009G021900 Sobic002G044800--Sobic002G389301 Sobic002G040900 Sobic002G040900 Sobic002G044800--Sobic002G040900 Sobic009G196400 Sobic009G196400 Sobic002G044800--Sobic009G196400 Sobic002G044800--Sobic009G009700 Sobic003G087300 Sobic003G087300 Sobic002G044800--Sobic003G087300 Sobic009G079925--Sobic008G076300 Sobic009G079925--Sobic009G021900 Sobic006G011900 Sobic006G011900 Sobic009G079925--Sobic006G011900 Sobic009G079925--Sobic002G044800 Sobic005G203100 Sobic005G203100 Sobic009G079925--Sobic005G203100 Sobic009G079925--Sobic003G199101 Sobic003G088500 Sobic003G088500 Sobic009G079925--Sobic003G088500 Sobic007G005700 Sobic007G005700 Sobic009G079925--Sobic007G005700 Sobic001G025101 Sobic001G025101 Sobic009G079925--Sobic001G025101 Sobic002G389301--Sobic002G044800 Sobic007G065800 Sobic007G065800 Sobic002G389301--Sobic007G065800 Sobic002G389301--Sobic004G333150 Sobic002G389301--Sobic004G240600 Sobic002G389301--Sobic009G009700 Sobic006G190700 Sobic006G190700 Sobic002G389301--Sobic006G190700 Sobic006G214600 Sobic006G214600 Sobic002G389301--Sobic006G214600 Sobic009G009600 Sobic009G009600 Sobic002G389301--Sobic009G009600 Sobic002G389301--Sobic009G021900 Sobic004G182000--Sobic007G065800 Sobic004G023500 Sobic004G023500 Sobic004G182000--Sobic004G023500 Sobic004G292001 Sobic004G292001 Sobic004G182000--Sobic004G292001 Sobic004G182000--Sobic009G021900 Sobic009G099400 Sobic009G099400 Sobic004G182000--Sobic009G099400 Sobic004G278400 Sobic004G278400 Sobic004G182000--Sobic004G278400 Sobic003G364950 Sobic003G364950 Sobic004G182000--Sobic003G364950 Sobic001G236050 Sobic001G236050 Sobic004G182000--Sobic001G236050 Sobic003G249050 Sobic003G249050 Sobic004G182000--Sobic003G249050 Sobic001G054500 Sobic001G054500 Sobic009G009700--Sobic001G054500 Sobic009G009700--Sobic002G040900 Sobic001G256200 Sobic001G256200 Sobic009G009700--Sobic001G256200 Sobic004G148100 Sobic004G148100 Sobic009G009700--Sobic004G148100 Sobic002G042000 Sobic002G042000 Sobic009G009700--Sobic002G042000 Sobic009G009700--Sobic009G009600 Sobic007G008100 Sobic007G008100 Sobic009G009700--Sobic007G008100 Sobic003G155600 Sobic003G155600 Sobic009G009700--Sobic003G155600 Sobic002G093700 Sobic002G093700 Sobic009G009700--Sobic002G093700 Sobic009G021800--Sobic009G021900 Sobic009G021800--Sobic002G044800 Sobic005G177500 Sobic005G177500 Sobic009G021800--Sobic005G177500 Sobic005G186200 Sobic005G186200 Sobic009G021800--Sobic005G186200 Sobic007G077600 Sobic007G077600 Sobic009G021800--Sobic007G077600 Sobic009G021800--Sobic009G071100 Sobic010G223800 Sobic010G223800 Sobic009G021800--Sobic010G223800 Sobic009G021800--Sobic008G076300 Sobic009G021800--Sobic002G389301 Sobic003G199101--Sobic008G076300 Sobic003G199101--Sobic009G079925 Sobic003G199101--Sobic009G021900 Sobic010G229075 Sobic010G229075 Sobic003G199101--Sobic010G229075 Sobic001G494650 Sobic001G494650 Sobic003G199101--Sobic001G494650 Sobic001G297966 Sobic001G297966 Sobic003G199101--Sobic001G297966 Sobic003G199101--Sobic006G011900 Sobic007G106050 Sobic007G106050 Sobic003G199101--Sobic007G106050 Sobic003G199101--Sobic004G182000 Sobic009G071000 Sobic009G071000 Sobic009G071100--Sobic009G071000 Sobic006G268500 Sobic006G268500 Sobic009G071100--Sobic006G268500 Sobic004G138900 Sobic004G138900 Sobic009G071100--Sobic004G138900 Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic009G071100--Sobic002G010900 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic009G071100--Sobic002G422300 Sobic008G140900 Sobic008G140900 Sobic009G071100--Sobic008G140900 Sobic002G150866 Sobic002G150866 Sobic009G071100--Sobic002G150866 Sobic005G110451 Sobic005G110451 Sobic009G071100--Sobic005G110451 Sobic005G110454 Sobic005G110454 Sobic009G071100--Sobic005G110454
Octagon: transcription factors


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