Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G079925.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R2F3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07180.1 : transposon protein, putative, Pong sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G076300 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
2 Sobic.009G021900 - -
3 Sobic.006G011900 dirigent, putative -
4 Sobic.002G044800 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.005G203100 tropinone reductase 2, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
6 Sobic.003G199101 - -
7 Sobic.003G088500 multicopper oxidase domain containing protein, expressed -
8 Sobic.007G005700 expressed protein -
9 Sobic.001G025101 - -
10 Sobic.004G245500 expressed protein -
11 Sobic.009G139700 - -
12 Sobic.007G166000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@regulation of Al tolerance genes and proton tolerance genes(PubMedID : 29541086)@ZOS8-14 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
13 Sobic.001G354200 O-methyltransferase, putative, expressed -
14 Sobic.009G209500 RING/U-box superfamily protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10664: E3 ubiquitin-protein ligase ATL6/9/15/31/42/55
15 Sobic.003G087300 nuclease PA3, putative, expressed -
16 Sobic.010G259233 - -
17 Sobic.002G115400 AP2 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.006G019200 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR4 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
19 Sobic.009G099400 peptidase, T1 family, putative, expressed -
20 Sobic.009G009700 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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