Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G182000.2
Synonym Sb04g023155
Functional annotation harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RNY3
Pfam PF03168
Panther DB PTHR31852 PTHR31852:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G36970 : NDR1/HIN1-like 25
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g58090.1 : harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017511 , Zm00025a006511
Brachypodium KQJ97240
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G065800 Cupin domain containing protein, expressed -
2 Sobic.004G023500 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G292001 - -
4 Sobic.009G021900 - -
5 Sobic.009G099400 peptidase, T1 family, putative, expressed -
6 Sobic.004G278400 DUF581 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G364950 - -
8 Sobic.001G236050 - -
9 Sobic.003G249050 - -
10 Sobic.002G044800 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed -
11 Sobic.007G065900 Cupin domain containing protein, expressed -
12 Sobic.008G157800 BURP domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G130601 - -
14 Sobic.002G389301 - -
15 Sobic.001G253000 - -
16 Sobic.003G112300 expressed protein -
17 Sobic.006G227750 - -
18 Sobic.006G019200 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR4 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
19 Sobic.007G108200 - -
20 Sobic.004G061701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G182000 Sobic004G182000 Sobic007G065800 Sobic007G065800 Sobic004G182000--Sobic007G065800 Sobic004G023500 Sobic004G023500 Sobic004G182000--Sobic004G023500 Sobic004G292001 Sobic004G292001 Sobic004G182000--Sobic004G292001 Sobic009G021900 Sobic009G021900 Sobic004G182000--Sobic009G021900 Sobic009G099400 Sobic009G099400 Sobic004G182000--Sobic009G099400 Sobic004G278400 Sobic004G278400 Sobic004G182000--Sobic004G278400 Sobic003G364950 Sobic003G364950 Sobic004G182000--Sobic003G364950 Sobic001G236050 Sobic001G236050 Sobic004G182000--Sobic001G236050 Sobic003G249050 Sobic003G249050 Sobic004G182000--Sobic003G249050 Sobic007G065800--Sobic004G292001 Sobic007G065800--Sobic004G023500 Sobic002G130601 Sobic002G130601 Sobic007G065800--Sobic002G130601 Sobic007G065900 Sobic007G065900 Sobic007G065800--Sobic007G065900 Sobic008G157800 Sobic008G157800 Sobic007G065800--Sobic008G157800 Sobic004G061701 Sobic004G061701 Sobic007G065800--Sobic004G061701 Sobic005G217300 Sobic005G217300 Sobic007G065800--Sobic005G217300 Sobic002G150100 Sobic002G150100 Sobic007G065800--Sobic002G150100 Sobic004G023500--Sobic004G061701 Sobic004G023500--Sobic008G157800 Sobic004G023500--Sobic009G099400 Sobic004G023500--Sobic007G065900 Sobic003G344050 Sobic003G344050 Sobic004G023500--Sobic003G344050 Sobic004G023500--Sobic002G150100 Sobic002G220800 Sobic002G220800 Sobic004G023500--Sobic002G220800 Sobic004G292001--Sobic007G065900 Sobic004G292001--Sobic007G065800 Sobic004G292001--Sobic002G130601 Sobic004G292001--Sobic003G364950 Sobic004G292001--Sobic008G157800 Sobic005G213500 Sobic005G213500 Sobic004G292001--Sobic005G213500 Sobic004G292001--Sobic004G278400 Sobic004G292001--Sobic004G023500 Sobic007G030400 Sobic007G030400 Sobic004G292001--Sobic007G030400 Sobic008G076300 Sobic008G076300 Sobic009G021900--Sobic008G076300 Sobic002G044800 Sobic002G044800 Sobic009G021900--Sobic002G044800 Sobic009G079925 Sobic009G079925 Sobic009G021900--Sobic009G079925 Sobic002G389301 Sobic002G389301 Sobic009G021900--Sobic002G389301 Sobic009G021900--Sobic004G182000 Sobic009G009700 Sobic009G009700 Sobic009G021900--Sobic009G009700 Sobic009G021800 Sobic009G021800 Sobic009G021900--Sobic009G021800 Sobic003G199101 Sobic003G199101 Sobic009G021900--Sobic003G199101 Sobic009G071100 Sobic009G071100 Sobic009G021900--Sobic009G071100 Sobic009G099400--Sobic004G023500 Sobic009G099400--Sobic002G150100 Sobic009G099400--Sobic003G344050 Sobic007G108200 Sobic007G108200 Sobic009G099400--Sobic007G108200 Sobic009G099400--Sobic002G220800 Sobic009G099400--Sobic004G061701 Sobic009G099400--Sobic003G249050 Sobic004G278400--Sobic003G364950 Sobic006G214600 Sobic006G214600 Sobic004G278400--Sobic006G214600 Sobic004G278400--Sobic004G292001 Sobic003G364000 Sobic003G364000 Sobic004G278400--Sobic003G364000 Sobic003G364300 Sobic003G364300 Sobic004G278400--Sobic003G364300 Sobic004G352301 Sobic004G352301 Sobic004G278400--Sobic004G352301 Sobic004G278400--Sobic005G213500 Sobic001G433900 Sobic001G433900 Sobic004G278400--Sobic001G433900 Sobic005G005600 Sobic005G005600 Sobic004G278400--Sobic005G005600 Sobic003G364950--Sobic006G214600 Sobic010G043900 Sobic010G043900 Sobic003G364950--Sobic010G043900 Sobic003G364950--Sobic004G292001 Sobic003G364950--Sobic004G278400 Sobic003G364950--Sobic005G213500 Sobic003G364950--Sobic003G364300 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic003G364950--Sobic002G422300 Sobic003G364950--Sobic003G364000 Sobic002G004900 Sobic002G004900 Sobic003G364950--Sobic002G004900 Sobic001G236050--Sobic007G065800 Sobic001G236050--Sobic004G292001 Sobic001G236050--Sobic003G364950 Sobic001G236050--Sobic004G023500 Sobic001G236050--Sobic002G422300 Sobic006G099001 Sobic006G099001 Sobic001G236050--Sobic006G099001 Sobic001G236050--Sobic002G130601 Sobic001G236050--Sobic006G214600 Sobic001G236050--Sobic007G065900 Sobic003G249050--Sobic002G150100 Sobic003G249050--Sobic003G344050 Sobic003G249050--Sobic002G220800 Sobic003G249050--Sobic007G108200 Sobic008G039501 Sobic008G039501 Sobic003G249050--Sobic008G039501 Sobic003G249050--Sobic004G061701 Sobic003G249050--Sobic004G023500
Octagon: transcription factors


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