Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G087400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QA10
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
RAP-DB (Rice) -
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Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G132033 - -
2 Sobic.005G112033 - -
3 Sobic.004G285450 - -
4 Sobic.003G409000 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR3 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
5 Sobic.010G254300 Myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G003600 - -
7 Sobic.008G157600 BURP domain containing protein, expressed -
8 Sobic.008G029200 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@WRKY104, expressed -
9 Sobic.003G185700 zinc finger family protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G260350 - -
11 Sobic.003G406000 OsFBO2 - F-box and other domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G157300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
13 Sobic.006G038951 - -
14 Sobic.004G284001 - -
15 Sobic.001G038601 - -
16 Sobic.001G096450 - -
17 Sobic.007G189600 - -
18 Sobic.007G090445 - -
19 Sobic.001G261408 - -
20 Sobic.002G029400 no apical meristem protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G087400 Sobic002G087400 Sobic005G132033 Sobic005G132033 Sobic002G087400--Sobic005G132033 Sobic005G112033 Sobic005G112033 Sobic002G087400--Sobic005G112033 Sobic004G285450 Sobic004G285450 Sobic002G087400--Sobic004G285450 Sobic003G409000 Sobic003G409000 Sobic002G087400--Sobic003G409000 Sobic010G254300 Sobic010G254300 Sobic002G087400--Sobic010G254300 Sobic004G003600 Sobic004G003600 Sobic002G087400--Sobic004G003600 Sobic008G157600 Sobic008G157600 Sobic002G087400--Sobic008G157600 Sobic008G029200 Sobic008G029200 Sobic002G087400--Sobic008G029200 Sobic003G185700 Sobic003G185700 Sobic002G087400--Sobic003G185700 Sobic005G132033--Sobic002G087400 Sobic006G038951 Sobic006G038951 Sobic005G132033--Sobic006G038951 Sobic003G251400 Sobic003G251400 Sobic005G132033--Sobic003G251400 Sobic005G132033--Sobic004G285450 Sobic005G132033--Sobic005G112033 Sobic003G406000 Sobic003G406000 Sobic005G132033--Sobic003G406000 Sobic009G067600 Sobic009G067600 Sobic005G132033--Sobic009G067600 Sobic004G220700 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Sobic003G185700--Sobic001G158900 Sobic001G097100 Sobic001G097100 Sobic003G185700--Sobic001G097100 Sobic009G056700 Sobic009G056700 Sobic003G185700--Sobic009G056700
Octagon: transcription factors


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