Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G338500.1
Synonym PKDM7D, Sb04g036630
Functional annotation transcription factor jumonji, putative, expressed
UniProt C5XV72
Pfam PF05964 PF02928 PF02375 PF05965 PF02373
Panther DB PTHR10694 PTHR10694:SF53
NCBI CDD KOG1246; DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain
KEGG Orthology K11446; KDM5, [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase
Gene Ontology GO:0005634; nucleus


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G08620 : Transcription factor jumonji (jmj) family protein / zinc finger (C5HC2 type) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g10770.1 : transcription factor jumonji, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032847 , Zm00025a032851 , Zm00025a032850 , Zm00025a042687
Brachypodium KQK04607
Barley HORVU1Hr1G093770.1 , HORVU1Hr1G093770.3 , HORVU1Hr1G093770.2 , HORVU1Hr1G093770.5 , HORVU1Hr1G093770.4 , HORVU1Hr1G093770.7 , HORVU1Hr1G093770.6 , HORVU1Hr1G093770.9 , HORVU1Hr1G093770.8 , HORVU1Hr1G093770.20 , HORVU1Hr1G093770.15 , HORVU1Hr1G093770.14 , HORVU1Hr1G093770.17 , HORVU1Hr1G093770.16 , HORVU1Hr1G093770.11 , HORVU1Hr1G093770.13 , HORVU1Hr1G093770.12 , HORVU1Hr1G093770.19 , HORVU1Hr1G093770.18
Wheat TraesCS1A02G430400 , TraesCS1A02G430400 , TraesCS1A02G430400 , TraesCS1A02G430400 , TraesCS1D02G439600 , TraesCS1B02G465100 , TraesCS1B02G465100
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cDNA sequences
Sobic.004G338500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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19 Sobic.001G297700 expressed protein -
20 Sobic.005G178200 hypothetical protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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