Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G010500.1
Synonym Sb05g000950
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y349
Pfam -
Panther DB PTHR35740 PTHR35740:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G56250 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g02050.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053666
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G052400 proline-rich family protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G207500 expressed protein -
3 Sobic.002G148300 - -
4 Sobic.010G045833 - -
5 Sobic.002G348600 zinc finger family protein, putative, expressed -
6 Sobic.010G099200 viral-response family protein, expressed -
7 Sobic.001G408100 Yip1 domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G105100 neighbor of COX4, putative, expressed -
9 Sobic.002G272600 TBC domain containing protein, expressed -
10 Sobic.007G038800 expressed protein -
11 Sobic.003G405700 exo70 exocyst complex subunit domain containing protein, expressed K07195: EXOC7, exocyst complex component 7
12 Sobic.008G046600 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
13 Sobic.009G031200 expressed protein -
14 Sobic.003G038600 phosducin-like protein 3, putative, expressed -
15 Sobic.010G105600 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12881: THOC4, THO complex subunit 4
16 Sobic.003G030800 prenylated rab acceptor, putative, expressed -
17 Sobic.002G254650 - -
18 Sobic.004G347900 protein kinase APK1A, chloroplast precursor, putative, expressed -
19 Sobic.001G119700 transcription regulator, putative, expressed -
20 Sobic.003G361500 zinc finger family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G010500 Sobic005G010500 Sobic003G052400 Sobic003G052400 Sobic005G010500--Sobic003G052400 Sobic006G207500 Sobic006G207500 Sobic005G010500--Sobic006G207500 Sobic002G148300 Sobic002G148300 Sobic005G010500--Sobic002G148300 Sobic010G045833 Sobic010G045833 Sobic005G010500--Sobic010G045833 Sobic002G348600 Sobic002G348600 Sobic005G010500--Sobic002G348600 Sobic010G099200 Sobic010G099200 Sobic005G010500--Sobic010G099200 Sobic001G408100 Sobic001G408100 Sobic005G010500--Sobic001G408100 Sobic001G105100 Sobic001G105100 Sobic005G010500--Sobic001G105100 Sobic002G272600 Sobic002G272600 Sobic005G010500--Sobic002G272600 Sobic010G017000 Sobic010G017000 Sobic003G052400--Sobic010G017000 Sobic003G052400--Sobic001G408100 Sobic003G052400--Sobic002G348600 Sobic001G067900 Sobic001G067900 Sobic003G052400--Sobic001G067900 Sobic008G003600 Sobic008G003600 Sobic003G052400--Sobic008G003600 Sobic003G217100 Sobic003G217100 Sobic003G052400--Sobic003G217100 Sobic009G160200 Sobic009G160200 Sobic003G052400--Sobic009G160200 Sobic006G257001 Sobic006G257001 Sobic003G052400--Sobic006G257001 Sobic001G237500 Sobic001G237500 Sobic003G052400--Sobic001G237500 Sobic010G267500 Sobic010G267500 Sobic006G207500--Sobic010G267500 Sobic010G065400 Sobic010G065400 Sobic006G207500--Sobic010G065400 Sobic009G031200 Sobic009G031200 Sobic006G207500--Sobic009G031200 Sobic006G183000 Sobic006G183000 Sobic006G207500--Sobic006G183000 Sobic006G222400 Sobic006G222400 Sobic006G207500--Sobic006G222400 Sobic007G097900 Sobic007G097900 Sobic006G207500--Sobic007G097900 Sobic006G207500--Sobic003G052400 Sobic001G061700 Sobic001G061700 Sobic006G207500--Sobic001G061700 Sobic008G137600 Sobic008G137600 Sobic006G207500--Sobic008G137600 Sobic001G503400 Sobic001G503400 Sobic002G148300--Sobic001G503400 Sobic002G148300--Sobic002G272600 Sobic002G143900 Sobic002G143900 Sobic002G148300--Sobic002G143900 Sobic001G119700 Sobic001G119700 Sobic002G148300--Sobic001G119700 Sobic007G162800 Sobic007G162800 Sobic002G148300--Sobic007G162800 Sobic010G219100 Sobic010G219100 Sobic002G148300--Sobic010G219100 Sobic009G193850 Sobic009G193850 Sobic002G148300--Sobic009G193850 Sobic002G148300--Sobic005G010500 Sobic002G180000 Sobic002G180000 Sobic002G148300--Sobic002G180000 Sobic010G066300 Sobic010G066300 Sobic010G045833--Sobic010G066300 Sobic010G045833--Sobic006G207500 Sobic007G136700 Sobic007G136700 Sobic010G045833--Sobic007G136700 Sobic010G045833--Sobic009G031200 Sobic010G045833--Sobic005G010500 Sobic007G079700 Sobic007G079700 Sobic010G045833--Sobic007G079700 Sobic009G156300 Sobic009G156300 Sobic010G045833--Sobic009G156300 Sobic003G361500 Sobic003G361500 Sobic010G045833--Sobic003G361500 Sobic002G365100 Sobic002G365100 Sobic010G045833--Sobic002G365100 Sobic002G348600--Sobic003G052400 Sobic001G323000 Sobic001G323000 Sobic002G348600--Sobic001G323000 Sobic002G348600--Sobic009G160200 Sobic001G005600 Sobic001G005600 Sobic002G348600--Sobic001G005600 Sobic001G206900 Sobic001G206900 Sobic002G348600--Sobic001G206900 Sobic001G015800 Sobic001G015800 Sobic002G348600--Sobic001G015800 Sobic001G105500 Sobic001G105500 Sobic002G348600--Sobic001G105500 Sobic010G094600 Sobic010G094600 Sobic002G348600--Sobic010G094600 Sobic001G311100 Sobic001G311100 Sobic002G348600--Sobic001G311100 Sobic002G254650 Sobic002G254650 Sobic010G099200--Sobic002G254650 Sobic010G099200--Sobic009G156300 Sobic004G352900 Sobic004G352900 Sobic010G099200--Sobic004G352900 Sobic010G099200--Sobic001G237500 Sobic010G099200--Sobic006G257001 Sobic010G099200--Sobic003G217100 Sobic008G132800 Sobic008G132800 Sobic010G099200--Sobic008G132800 Sobic010G099200--Sobic005G010500 Sobic010G099200--Sobic001G408100 Sobic001G408100--Sobic003G217100 Sobic001G408100--Sobic003G052400 Sobic009G171100 Sobic009G171100 Sobic001G408100--Sobic009G171100 Sobic001G408100--Sobic010G017000 Sobic003G043400 Sobic003G043400 Sobic001G408100--Sobic003G043400 Sobic001G408100--Sobic006G222400 Sobic001G214200 Sobic001G214200 Sobic001G408100--Sobic001G214200 Sobic004G025300 Sobic004G025300 Sobic001G408100--Sobic004G025300 Sobic003G038600 Sobic003G038600 Sobic001G408100--Sobic003G038600 Sobic001G105100--Sobic001G067900 Sobic001G105100--Sobic003G217100 Sobic001G105100--Sobic008G132800 Sobic001G105100--Sobic006G257001 Sobic006G034800 Sobic006G034800 Sobic001G105100--Sobic006G034800 Sobic010G105600 Sobic010G105600 Sobic001G105100--Sobic010G105600 Sobic001G105100--Sobic001G237500 Sobic001G105100--Sobic006G222400 Sobic001G105100--Sobic008G137600 Sobic002G272600--Sobic001G061700 Sobic001G080000 Sobic001G080000 Sobic002G272600--Sobic001G080000 Sobic001G143500 Sobic001G143500 Sobic002G272600--Sobic001G143500 Sobic003G405700 Sobic003G405700 Sobic002G272600--Sobic003G405700 Sobic002G272600--Sobic010G105600 Sobic007G205000 Sobic007G205000 Sobic002G272600--Sobic007G205000 Sobic002G272600--Sobic003G038600 Sobic003G350600 Sobic003G350600 Sobic002G272600--Sobic003G350600 Sobic002G272600--Sobic010G219100
Octagon: transcription factors


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