Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G028200.2
Synonym Sb05g002360
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RHJ8
Pfam PF12854 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF302
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G63130 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g01870.1 : Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G110550 - -
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20 Sobic.002G095800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G028200 Sobic005G028200 Sobic005G110550 Sobic005G110550 Sobic005G028200--Sobic005G110550 Sobic003G384100 Sobic003G384100 Sobic005G028200--Sobic003G384100 Sobic007G143900 Sobic007G143900 Sobic005G028200--Sobic007G143900 Sobic005G024600 Sobic005G024600 Sobic005G028200--Sobic005G024600 Sobic010G046200 Sobic010G046200 Sobic005G028200--Sobic010G046200 Sobic005G063800 Sobic005G063800 Sobic005G028200--Sobic005G063800 Sobic002G239800 Sobic002G239800 Sobic005G028200--Sobic002G239800 Sobic007G028766 Sobic007G028766 Sobic005G028200--Sobic007G028766 Sobic001G423900 Sobic001G423900 Sobic005G028200--Sobic001G423900 Sobic005G110550--Sobic010G046200 Sobic002G358900 Sobic002G358900 Sobic005G110550--Sobic002G358900 Sobic005G008700 Sobic005G008700 Sobic005G110550--Sobic005G008700 Sobic003G399900 Sobic003G399900 Sobic005G110550--Sobic003G399900 Sobic003G089900 Sobic003G089900 Sobic005G110550--Sobic003G089900 Sobic002G279200 Sobic002G279200 Sobic005G110550--Sobic002G279200 Sobic001G001066 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Octagon: transcription factors


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