Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G053100.1
Synonym
Functional annotation pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RGV0
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155:SF550 PTHR23155
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g47780.1 : pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCSU02G061700 , TraesCS4B02G004900 , TraesCSU02G111000 , TraesCS4B02G004800 , TraesCS4B02G004800 , TraesCS7A02G568100 , TraesCS4D02G004100
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G235800 expressed protein -
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7 Sobic.002G081850 - -
8 Sobic.009G165100 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
9 Sobic.004G312500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@nitrate reductase, putative, expressed K10534: nitrate reductase (NAD(P)H)
10 Sobic.005G066366 - -
11 Sobic.005G182900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
12 Sobic.005G197350 - -
13 Sobic.005G066300 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.002G019000 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
15 Sobic.002G411000 AP2 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.008G033100 protein kinase domain containing protein, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
17 Sobic.006G009700 expressed protein -
18 Sobic.010G213600 histidine kinase, putative, expressed -
19 Sobic.008G138700 MLA12, putative, expressed -
20 Sobic.003G161400 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G053100 Sobic005G053100 Sobic002G235800 Sobic002G235800 Sobic005G053100--Sobic002G235800 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic005G053100--Sobic005G065700 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G053100--Sobic005G071900 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G053100--Sobic005G066500 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G053100--Sobic005G110511 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G053100--Sobic010G242800 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G053100--Sobic002G081850 Sobic009G165100 Sobic009G165100 Sobic005G053100--Sobic009G165100 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic005G053100--Sobic004G312500 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic002G235800--Sobic005G066300 Sobic006G117500 Sobic006G117500 Sobic002G235800--Sobic006G117500 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic002G235800--Sobic002G411000 Sobic010G096700 Sobic010G096700 Sobic002G235800--Sobic010G096700 Sobic009G015166 Sobic009G015166 Sobic002G235800--Sobic009G015166 Sobic005G104200 Sobic005G104200 Sobic002G235800--Sobic005G104200 Sobic001G506600 Sobic001G506600 Sobic002G235800--Sobic001G506600 Sobic001G238500 Sobic001G238500 Sobic002G235800--Sobic001G238500 Sobic006G205500 Sobic006G205500 Sobic002G235800--Sobic006G205500 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G065700--Sobic002G019000 Sobic005G065700--Sobic005G071900 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic005G065700--Sobic005G182900 Sobic005G065700--Sobic005G066500 Sobic005G065700--Sobic005G110511 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic005G065700--Sobic010G213600 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic005G065700--Sobic003G079100 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G065700--Sobic008G033100 Sobic005G065700--Sobic010G242800 Sobic005G071900--Sobic005G065700 Sobic005G071900--Sobic004G312500 Sobic005G071900--Sobic005G066500 Sobic005G071900--Sobic005G110511 Sobic006G108300 Sobic006G108300 Sobic005G071900--Sobic006G108300 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic005G071900--Sobic006G009700 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic005G071900--Sobic008G138700 Sobic005G071900--Sobic003G079100 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic005G071900--Sobic002G029600 Sobic005G066500--Sobic005G110511 Sobic005G066500--Sobic005G065700 Sobic005G066500--Sobic005G071900 Sobic005G066500--Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic004G312500 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G066500--Sobic005G197350 Sobic005G066500--Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic002G019000 Sobic005G066500--Sobic002G411000 Sobic005G110511--Sobic005G066500 Sobic005G110511--Sobic010G242800 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G110511--Sobic005G066366 Sobic005G110511--Sobic004G312500 Sobic005G110511--Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G071900 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic005G110511--Sobic002G029500 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic007G064900 Sobic005G110511--Sobic008G033100 Sobic010G242800--Sobic008G033100 Sobic010G242800--Sobic005G182900 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic010G242800--Sobic003G161400 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic010G242800--Sobic001G293100 Sobic010G242800--Sobic005G066366 Sobic010G242800--Sobic005G110511 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic010G242800--Sobic005G097900 Sobic010G242800--Sobic007G064900 Sobic010G242800--Sobic002G029500 Sobic002G081850--Sobic005G197350 Sobic002G081850--Sobic005G066366 Sobic002G081850--Sobic005G110511 Sobic002G081850--Sobic005G066500 Sobic002G081850--Sobic005G066300 Sobic002G081800 Sobic002G081800 Sobic002G081850--Sobic002G081800 Sobic002G081850--Sobic002G411000 Sobic002G081850--Sobic004G312500 Sobic002G081850--Sobic005G065700 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic009G165100--Sobic004G014600 Sobic003G441601 Sobic003G441601 Sobic009G165100--Sobic003G441601 Sobic009G165100--Sobic002G019000 Sobic002G391300 Sobic002G391300 Sobic009G165100--Sobic002G391300 Sobic009G165100--Sobic005G065700 Sobic009G165100--Sobic005G182900 Sobic009G165100--Sobic010G213600 Sobic002G111900 Sobic002G111900 Sobic009G165100--Sobic002G111900 Sobic002G289500 Sobic002G289500 Sobic009G165100--Sobic002G289500 Sobic004G312500--Sobic005G071900 Sobic004G312500--Sobic006G108300 Sobic004G312500--Sobic005G110511 Sobic004G312500--Sobic006G009700 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic004G312500--Sobic007G154100 Sobic004G312500--Sobic005G066500 Sobic004G312500--Sobic008G138700 Sobic004G312500--Sobic005G065700 Sobic004G312500--Sobic002G411000
Octagon: transcription factors


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