Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G080000.1
Synonym
Functional annotation VAMP-like protein YKT62, putative, expressed
UniProt A0A1B6PQW2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g64650.2 : VAMP-like protein YKT62, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3B02G410300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G138401 - -
2 Sobic.004G032600 - -
3 Sobic.001G226900 zinc finger family protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G099700 OsFBX195 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G141600 - -
6 Sobic.003G392275 - -
7 Sobic.003G183200 OsFBX249 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G490950 - -
9 Sobic.008G057600 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
10 Sobic.008G056800 expressed protein -
11 Sobic.002G102300 - -
12 Sobic.006G254400 expressed protein -
13 Sobic.010G064200 1,3-beta-glucan synthase component domain containing protein, expressed K11000: callose synthase
14 Sobic.004G074900 serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B subunitbeta, putative, expressed K11583: serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B''
15 Sobic.005G134000 expressed protein -
16 Sobic.003G238250 - -
17 Sobic.002G304801 - -
18 Sobic.010G006800 auxin-induced protein 5NG4, putative, expressed -
19 Sobic.002G368100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@COBRA, putative, expressed -
20 Sobic.001G210600 RIPER3 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G080000 Sobic005G080000 Sobic009G138401 Sobic009G138401 Sobic005G080000--Sobic009G138401 Sobic004G032600 Sobic004G032600 Sobic005G080000--Sobic004G032600 Sobic001G226900 Sobic001G226900 Sobic005G080000--Sobic001G226900 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic005G080000--Sobic002G099700 Sobic003G141600 Sobic003G141600 Sobic005G080000--Sobic003G141600 Sobic003G392275 Sobic003G392275 Sobic005G080000--Sobic003G392275 Sobic003G183200 Sobic003G183200 Sobic005G080000--Sobic003G183200 Sobic001G490950 Sobic001G490950 Sobic005G080000--Sobic001G490950 Sobic008G057600 Sobic008G057600 Sobic005G080000--Sobic008G057600 Sobic001G210600 Sobic001G210600 Sobic009G138401--Sobic001G210600 Sobic008G002201 Sobic008G002201 Sobic009G138401--Sobic008G002201 Sobic003G356800 Sobic003G356800 Sobic009G138401--Sobic003G356800 Sobic001G457500 Sobic001G457500 Sobic009G138401--Sobic001G457500 Sobic010G064200 Sobic010G064200 Sobic009G138401--Sobic010G064200 Sobic010G263700 Sobic010G263700 Sobic009G138401--Sobic010G263700 Sobic003G183100 Sobic003G183100 Sobic009G138401--Sobic003G183100 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic009G138401--Sobic007G209900 Sobic009G246600 Sobic009G246600 Sobic009G138401--Sobic009G246600 Sobic004G032600--Sobic001G490950 Sobic004G098800 Sobic004G098800 Sobic004G032600--Sobic004G098800 Sobic004G032600--Sobic001G226900 Sobic004G032600--Sobic003G392275 Sobic002G102300 Sobic002G102300 Sobic004G032600--Sobic002G102300 Sobic010G006800 Sobic010G006800 Sobic004G032600--Sobic010G006800 Sobic006G219900 Sobic006G219900 Sobic004G032600--Sobic006G219900 Sobic002G368100 Sobic002G368100 Sobic004G032600--Sobic002G368100 Sobic004G032600--Sobic003G141600 Sobic001G226900--Sobic008G057600 Sobic001G226900--Sobic003G392275 Sobic001G226900--Sobic001G490950 Sobic008G056800 Sobic008G056800 Sobic001G226900--Sobic008G056800 Sobic002G304801 Sobic002G304801 Sobic001G226900--Sobic002G304801 Sobic001G226900--Sobic002G102300 Sobic001G226900--Sobic002G099700 Sobic001G226900--Sobic010G006800 Sobic004G074900 Sobic004G074900 Sobic001G226900--Sobic004G074900 Sobic002G099700--Sobic002G304801 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic002G099700--Sobic001G136000 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic002G099700--Sobic002G080450 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic002G099700--Sobic009G060100 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic002G099700--Sobic010G129450 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic002G099700--Sobic007G128000 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic002G099700--Sobic007G081100 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic002G099700--Sobic007G082100 Sobic004G168200 Sobic004G168200 Sobic002G099700--Sobic004G168200 Sobic003G141600--Sobic004G098800 Sobic008G041450 Sobic008G041450 Sobic003G141600--Sobic008G041450 Sobic003G141600--Sobic003G392275 Sobic003G141600--Sobic010G006800 Sobic003G141600--Sobic001G490950 Sobic003G141600--Sobic002G102300 Sobic003G141600--Sobic002G368100 Sobic010G134700 Sobic010G134700 Sobic003G141600--Sobic010G134700 Sobic004G178700 Sobic004G178700 Sobic003G141600--Sobic004G178700 Sobic003G392275--Sobic002G102300 Sobic003G392275--Sobic001G226900 Sobic003G392275--Sobic001G490950 Sobic003G392275--Sobic010G006800 Sobic007G101600 Sobic007G101600 Sobic003G392275--Sobic007G101600 Sobic003G392275--Sobic004G074900 Sobic003G238250 Sobic003G238250 Sobic003G392275--Sobic003G238250 Sobic003G392275--Sobic004G098800 Sobic003G392275--Sobic008G057600 Sobic005G055501 Sobic005G055501 Sobic003G183200--Sobic005G055501 Sobic003G183200--Sobic005G080000 Sobic003G183200--Sobic001G210600 Sobic003G183200--Sobic009G138401 Sobic003G183200--Sobic008G002201 Sobic009G020300 Sobic009G020300 Sobic003G183200--Sobic009G020300 Sobic003G183200--Sobic003G183100 Sobic001G538350 Sobic001G538350 Sobic003G183200--Sobic001G538350 Sobic002G285001 Sobic002G285001 Sobic003G183200--Sobic002G285001 Sobic001G490950--Sobic002G102300 Sobic001G490950--Sobic010G006800 Sobic001G490950--Sobic004G074900 Sobic001G490950--Sobic007G101600 Sobic001G490950--Sobic003G392275 Sobic001G490950--Sobic003G238250 Sobic001G490950--Sobic001G226900 Sobic001G490950--Sobic002G368100 Sobic007G138000 Sobic007G138000 Sobic001G490950--Sobic007G138000 Sobic008G057600--Sobic002G304801 Sobic010G141201 Sobic010G141201 Sobic008G057600--Sobic010G141201 Sobic008G057600--Sobic008G056800 Sobic008G057600--Sobic010G064200 Sobic002G188300 Sobic002G188300 Sobic008G057600--Sobic002G188300 Sobic002G204500 Sobic002G204500 Sobic008G057600--Sobic002G204500 Sobic008G057600--Sobic001G226900 Sobic008G057600--Sobic002G099700 Sobic006G170500 Sobic006G170500 Sobic008G057600--Sobic006G170500
Octagon: transcription factors


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