Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G183200.1
Synonym
Functional annotation OsFBX249 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6Q436
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF87
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G03360 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g36530.1 : OsFBX249 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028820
Brachypodium PNT77178
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G055501 - -
2 Sobic.005G080000 VAMP-like protein YKT62, putative, expressed -
3 Sobic.001G210600 RIPER3 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
4 Sobic.009G138401 - -
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8 Sobic.001G538350 - -
9 Sobic.002G285001 - -
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11 Sobic.001G155100 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
12 Sobic.007G209900 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
13 Sobic.005G220680 - -
14 Sobic.007G090439 - -
15 Sobic.001G252151 - -
16 Sobic.003G158000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@PHS1, putative, expressed K14165: atypical dual specificity phosphatase
17 Sobic.003G347800 KIP1, putative, expressed -
18 Sobic.004G128700 AGC_PVPK_like_kin82y.5 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
19 Sobic.005G166432 - -
20 Sobic.003G391000 lipase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G183200 Sobic003G183200 Sobic005G055501 Sobic005G055501 Sobic003G183200--Sobic005G055501 Sobic005G080000 Sobic005G080000 Sobic003G183200--Sobic005G080000 Sobic001G210600 Sobic001G210600 Sobic003G183200--Sobic001G210600 Sobic009G138401 Sobic009G138401 Sobic003G183200--Sobic009G138401 Sobic008G002201 Sobic008G002201 Sobic003G183200--Sobic008G002201 Sobic009G020300 Sobic009G020300 Sobic003G183200--Sobic009G020300 Sobic003G183100 Sobic003G183100 Sobic003G183200--Sobic003G183100 Sobic001G538350 Sobic001G538350 Sobic003G183200--Sobic001G538350 Sobic002G285001 Sobic002G285001 Sobic003G183200--Sobic002G285001 Sobic005G055501--Sobic003G183200 Sobic003G017000 Sobic003G017000 Sobic005G055501--Sobic003G017000 Sobic005G055501--Sobic002G285001 Sobic007G090439 Sobic007G090439 Sobic005G055501--Sobic007G090439 Sobic007G038366 Sobic007G038366 Sobic005G055501--Sobic007G038366 Sobic008G025550 Sobic008G025550 Sobic005G055501--Sobic008G025550 Sobic002G050000 Sobic002G050000 Sobic005G055501--Sobic002G050000 Sobic008G076100 Sobic008G076100 Sobic005G055501--Sobic008G076100 Sobic003G022400 Sobic003G022400 Sobic005G055501--Sobic003G022400 Sobic005G080000--Sobic009G138401 Sobic004G032600 Sobic004G032600 Sobic005G080000--Sobic004G032600 Sobic001G226900 Sobic001G226900 Sobic005G080000--Sobic001G226900 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic005G080000--Sobic002G099700 Sobic003G141600 Sobic003G141600 Sobic005G080000--Sobic003G141600 Sobic003G392275 Sobic003G392275 Sobic005G080000--Sobic003G392275 Sobic005G080000--Sobic003G183200 Sobic001G490950 Sobic001G490950 Sobic005G080000--Sobic001G490950 Sobic008G057600 Sobic008G057600 Sobic005G080000--Sobic008G057600 Sobic001G210600--Sobic008G002201 Sobic001G210600--Sobic003G183100 Sobic001G210600--Sobic009G020300 Sobic001G210600--Sobic001G538350 Sobic001G155100 Sobic001G155100 Sobic001G210600--Sobic001G155100 Sobic005G220680 Sobic005G220680 Sobic001G210600--Sobic005G220680 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic001G210600--Sobic007G209900 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic001G210600--Sobic010G030500 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic001G210600--Sobic004G168150 Sobic009G138401--Sobic001G210600 Sobic009G138401--Sobic008G002201 Sobic003G356800 Sobic003G356800 Sobic009G138401--Sobic003G356800 Sobic001G457500 Sobic001G457500 Sobic009G138401--Sobic001G457500 Sobic010G064200 Sobic010G064200 Sobic009G138401--Sobic010G064200 Sobic010G263700 Sobic010G263700 Sobic009G138401--Sobic010G263700 Sobic009G138401--Sobic003G183100 Sobic009G138401--Sobic007G209900 Sobic009G246600 Sobic009G246600 Sobic009G138401--Sobic009G246600 Sobic008G002201--Sobic001G210600 Sobic008G002201--Sobic001G155100 Sobic008G002201--Sobic003G183100 Sobic008G002201--Sobic005G220680 Sobic008G002201--Sobic010G030500 Sobic008G002201--Sobic004G168150 Sobic001G370200 Sobic001G370200 Sobic008G002201--Sobic001G370200 Sobic007G195000 Sobic007G195000 Sobic008G002201--Sobic007G195000 Sobic008G002201--Sobic001G538350 Sobic009G020300--Sobic001G210600 Sobic009G020300--Sobic003G183100 Sobic009G020300--Sobic008G002201 Sobic009G020300--Sobic001G538350 Sobic009G020300--Sobic007G209900 Sobic009G020300--Sobic009G138401 Sobic010G086100 Sobic010G086100 Sobic009G020300--Sobic010G086100 Sobic008G183600 Sobic008G183600 Sobic009G020300--Sobic008G183600 Sobic009G020300--Sobic001G155100 Sobic003G183100--Sobic001G210600 Sobic003G183100--Sobic008G002201 Sobic003G183100--Sobic009G020300 Sobic003G183100--Sobic001G538350 Sobic003G183100--Sobic001G155100 Sobic003G183100--Sobic005G220680 Sobic003G183100--Sobic009G138401 Sobic003G183100--Sobic010G030500 Sobic003G183100--Sobic001G370200 Sobic001G538350--Sobic008G002201 Sobic001G538350--Sobic001G210600 Sobic001G538350--Sobic003G183100 Sobic001G135700 Sobic001G135700 Sobic001G538350--Sobic001G135700 Sobic001G538350--Sobic005G220680 Sobic001G538350--Sobic001G155100 Sobic001G538350--Sobic001G457500 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic001G538350--Sobic007G063800 Sobic001G506400 Sobic001G506400 Sobic001G538350--Sobic001G506400 Sobic002G285001--Sobic002G050000 Sobic002G285001--Sobic008G025550 Sobic008G059700 Sobic008G059700 Sobic002G285001--Sobic008G059700 Sobic002G285001--Sobic008G076100 Sobic001G325850 Sobic001G325850 Sobic002G285001--Sobic001G325850 Sobic004G036400 Sobic004G036400 Sobic002G285001--Sobic004G036400 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic002G285001--Sobic002G384900 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic002G285001--Sobic001G188100 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic002G285001--Sobic006G017700
Octagon: transcription factors


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