Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G086250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RI04
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G184900 OsDegp8 - Putative Deg protease homologue, expressed -
2 Sobic.008G055300 UDP-N-acetylglucosamine transferase subunit ALG14, putative, expressed K07441: beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase
3 Sobic.003G187300 - -
4 Sobic.003G030500 - K12823: DDX5, ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2
5 Sobic.006G049200 violaxanthin de-epoxidase, putative, expressed K09839: VDE, violaxanthin de-epoxidase
6 Sobic.001G087800 expressed protein -
7 Sobic.003G334200 pentatricopeptide, putative, expressed -
8 Sobic.003G301400 DNA-directed polymerase, putative, expressed K03509: DNA polymerase eta
9 Sobic.004G246000 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K14780: DHX37, ATP-dependent RNA helicase DHX37/DHR1
10 Sobic.001G215700 - -
11 Sobic.005G119001 - -
12 Sobic.003G292500 ATP-dependent protease La, putative, expressed K11793: cereblon
13 Sobic.009G210800 expressed protein -
14 Sobic.001G291400 methyltransferase, putative, expressed -
15 Sobic.001G441300 expressed protein -
16 Sobic.007G179332 - -
17 Sobic.003G080000 Ser/Thr protein kinase, putative, expressed -
18 Sobic.003G411150 - -
19 Sobic.003G290800 starch binding domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G167700 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4


Gene co-expression network
sample Sobic005G086250 Sobic005G086250 Sobic009G184900 Sobic009G184900 Sobic005G086250--Sobic009G184900 Sobic008G055300 Sobic008G055300 Sobic005G086250--Sobic008G055300 Sobic003G187300 Sobic003G187300 Sobic005G086250--Sobic003G187300 Sobic003G030500 Sobic003G030500 Sobic005G086250--Sobic003G030500 Sobic006G049200 Sobic006G049200 Sobic005G086250--Sobic006G049200 Sobic001G087800 Sobic001G087800 Sobic005G086250--Sobic001G087800 Sobic003G334200 Sobic003G334200 Sobic005G086250--Sobic003G334200 Sobic003G301400 Sobic003G301400 Sobic005G086250--Sobic003G301400 Sobic004G246000 Sobic004G246000 Sobic005G086250--Sobic004G246000 Sobic009G210000 Sobic009G210000 Sobic009G184900--Sobic009G210000 Sobic007G020500 Sobic007G020500 Sobic009G184900--Sobic007G020500 Sobic009G184900--Sobic005G086250 Sobic001G359900 Sobic001G359900 Sobic009G184900--Sobic001G359900 Sobic009G184900--Sobic003G334200 Sobic003G290800 Sobic003G290800 Sobic009G184900--Sobic003G290800 Sobic007G202900 Sobic007G202900 Sobic009G184900--Sobic007G202900 Sobic009G008400 Sobic009G008400 Sobic009G184900--Sobic009G008400 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic009G184900--Sobic007G116200 Sobic008G055300--Sobic005G086250 Sobic008G055300--Sobic003G334200 Sobic008G055300--Sobic009G184900 Sobic003G216300 Sobic003G216300 Sobic008G055300--Sobic003G216300 Sobic005G095680 Sobic005G095680 Sobic008G055300--Sobic005G095680 Sobic008G055300--Sobic009G210000 Sobic003G334300 Sobic003G334300 Sobic008G055300--Sobic003G334300 Sobic008G055300--Sobic003G290800 Sobic003G434800 Sobic003G434800 Sobic008G055300--Sobic003G434800 Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic003G187300--Sobic010G167700 Sobic004G317050 Sobic004G317050 Sobic003G187300--Sobic004G317050 Sobic001G293666 Sobic001G293666 Sobic003G187300--Sobic001G293666 Sobic002G319766 Sobic002G319766 Sobic003G187300--Sobic002G319766 Sobic005G110517 Sobic005G110517 Sobic003G187300--Sobic005G110517 Sobic003G301050 Sobic003G301050 Sobic003G187300--Sobic003G301050 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic003G187300--Sobic010G124100 Sobic001G251750 Sobic001G251750 Sobic003G187300--Sobic001G251750 Sobic003G411150 Sobic003G411150 Sobic003G187300--Sobic003G411150 Sobic007G102600 Sobic007G102600 Sobic003G030500--Sobic007G102600 Sobic006G095100 Sobic006G095100 Sobic003G030500--Sobic006G095100 Sobic003G124000 Sobic003G124000 Sobic003G030500--Sobic003G124000 Sobic001G092250 Sobic001G092250 Sobic003G030500--Sobic001G092250 Sobic003G030500--Sobic005G086250 Sobic003G030500--Sobic004G246000 Sobic005G194400 Sobic005G194400 Sobic003G030500--Sobic005G194400 Sobic007G134300 Sobic007G134300 Sobic003G030500--Sobic007G134300 Sobic002G224800 Sobic002G224800 Sobic003G030500--Sobic002G224800 Sobic006G122500 Sobic006G122500 Sobic006G049200--Sobic006G122500 Sobic010G019200 Sobic010G019200 Sobic006G049200--Sobic010G019200 Sobic004G235100 Sobic004G235100 Sobic006G049200--Sobic004G235100 Sobic007G018900 Sobic007G018900 Sobic006G049200--Sobic007G018900 Sobic006G207700 Sobic006G207700 Sobic006G049200--Sobic006G207700 Sobic004G342500 Sobic004G342500 Sobic006G049200--Sobic004G342500 Sobic008G094150 Sobic008G094150 Sobic006G049200--Sobic008G094150 Sobic009G191900 Sobic009G191900 Sobic006G049200--Sobic009G191900 Sobic003G080000 Sobic003G080000 Sobic006G049200--Sobic003G080000 Sobic004G206050 Sobic004G206050 Sobic001G087800--Sobic004G206050 Sobic004G250000 Sobic004G250000 Sobic001G087800--Sobic004G250000 Sobic001G087800--Sobic007G134300 Sobic004G126050 Sobic004G126050 Sobic001G087800--Sobic004G126050 Sobic005G173100 Sobic005G173100 Sobic001G087800--Sobic005G173100 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic001G087800--Sobic003G416200 Sobic009G097400 Sobic009G097400 Sobic001G087800--Sobic009G097400 Sobic002G126700 Sobic002G126700 Sobic001G087800--Sobic002G126700 Sobic009G148400 Sobic009G148400 Sobic001G087800--Sobic009G148400 Sobic003G334200--Sobic009G184900 Sobic003G334200--Sobic008G055300 Sobic003G334200--Sobic005G086250 Sobic003G334200--Sobic009G210000 Sobic003G334200--Sobic003G301400 Sobic010G232200 Sobic010G232200 Sobic003G334200--Sobic010G232200 Sobic009G184600 Sobic009G184600 Sobic003G334200--Sobic009G184600 Sobic003G334200--Sobic003G434800 Sobic009G149700 Sobic009G149700 Sobic003G334200--Sobic009G149700 Sobic003G395600 Sobic003G395600 Sobic003G301400--Sobic003G395600 Sobic010G056100 Sobic010G056100 Sobic003G301400--Sobic010G056100 Sobic010G195100 Sobic010G195100 Sobic003G301400--Sobic010G195100 Sobic002G284600 Sobic002G284600 Sobic003G301400--Sobic002G284600 Sobic003G301400--Sobic009G184900 Sobic007G177700 Sobic007G177700 Sobic003G301400--Sobic007G177700 Sobic004G128100 Sobic004G128100 Sobic003G301400--Sobic004G128100 Sobic003G292500 Sobic003G292500 Sobic003G301400--Sobic003G292500 Sobic001G215700 Sobic001G215700 Sobic003G301400--Sobic001G215700 Sobic004G215650 Sobic004G215650 Sobic004G246000--Sobic004G215650 Sobic007G163200 Sobic007G163200 Sobic004G246000--Sobic007G163200 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic004G246000--Sobic001G504300 Sobic003G414200 Sobic003G414200 Sobic004G246000--Sobic003G414200 Sobic004G194600 Sobic004G194600 Sobic004G246000--Sobic004G194600 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic004G246000--Sobic010G123650 Sobic003G123950 Sobic003G123950 Sobic004G246000--Sobic003G123950 Sobic003G168700 Sobic003G168700 Sobic004G246000--Sobic003G168700 Sobic002G118000 Sobic002G118000 Sobic004G246000--Sobic002G118000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.