Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G187300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q470
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.003G187300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G167700 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
2 Sobic.004G317050 - -
3 Sobic.001G293666 - -
4 Sobic.002G319766 - K08900: mitochondrial chaperone BCS1
5 Sobic.005G110517 - -
6 Sobic.003G301050 - -
7 Sobic.010G124100 - -
8 Sobic.001G251750 - K03935: NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 2
9 Sobic.003G411150 - -
10 Sobic.004G140900 - -
11 Sobic.006G199601 - -
12 Sobic.003G296250 - -
13 Sobic.K043600 - -
14 Sobic.001G288500 expressed protein K10756: replication factor C subunit 3/5
15 Sobic.010G061400 expressed protein -
16 Sobic.002G118000 ATP synthase, putative, expressed -
17 Sobic.010G055900 - -
18 Sobic.004G246000 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K14780: DHX37, ATP-dependent RNA helicase DHX37/DHR1
19 Sobic.001G451150 - -
20 Sobic.003G168600 cytochrome b6-f complex subunit 4, putative, expressed K02637: cytochrome b6-f complex subunit 4


Gene co-expression network
sample Sobic003G187300 Sobic003G187300 Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic003G187300--Sobic010G167700 Sobic004G317050 Sobic004G317050 Sobic003G187300--Sobic004G317050 Sobic001G293666 Sobic001G293666 Sobic003G187300--Sobic001G293666 Sobic002G319766 Sobic002G319766 Sobic003G187300--Sobic002G319766 Sobic005G110517 Sobic005G110517 Sobic003G187300--Sobic005G110517 Sobic003G301050 Sobic003G301050 Sobic003G187300--Sobic003G301050 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic003G187300--Sobic010G124100 Sobic001G251750 Sobic001G251750 Sobic003G187300--Sobic001G251750 Sobic003G411150 Sobic003G411150 Sobic003G187300--Sobic003G411150 Sobic010G167700--Sobic003G301050 Sobic010G167700--Sobic003G411150 Sobic010G167700--Sobic005G110517 Sobic006G199601 Sobic006G199601 Sobic010G167700--Sobic006G199601 Sobic001G288500 Sobic001G288500 Sobic010G167700--Sobic001G288500 SobicK043600 SobicK043600 Sobic010G167700--SobicK043600 Sobic010G167700--Sobic001G251750 Sobic010G167700--Sobic010G124100 Sobic003G012750 Sobic003G012750 Sobic010G167700--Sobic003G012750 Sobic003G296250 Sobic003G296250 Sobic004G317050--Sobic003G296250 Sobic004G194600 Sobic004G194600 Sobic004G317050--Sobic004G194600 Sobic004G215650 Sobic004G215650 Sobic004G317050--Sobic004G215650 Sobic003G414200 Sobic003G414200 Sobic004G317050--Sobic003G414200 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic004G317050--Sobic001G504300 Sobic002G118000 Sobic002G118000 Sobic004G317050--Sobic002G118000 Sobic007G163200 Sobic007G163200 Sobic004G317050--Sobic007G163200 Sobic001G449300 Sobic001G449300 Sobic004G317050--Sobic001G449300 Sobic001G045100 Sobic001G045100 Sobic004G317050--Sobic001G045100 Sobic001G293666--Sobic005G110517 Sobic003G229650 Sobic003G229650 Sobic001G293666--Sobic003G229650 Sobic009G202101 Sobic009G202101 Sobic001G293666--Sobic009G202101 Sobic004G203666 Sobic004G203666 Sobic001G293666--Sobic004G203666 Sobic001G293666--Sobic006G199601 Sobic001G293666--Sobic001G288500 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic001G293666--Sobic010G025600 Sobic001G293666--Sobic010G167700 Sobic004G143000 Sobic004G143000 Sobic001G293666--Sobic004G143000 Sobic002G319766--Sobic004G317050 Sobic002G319766--Sobic010G167700 Sobic002G319766--Sobic001G288500 Sobic002G319766--Sobic003G414200 Sobic002G319766--Sobic001G251750 Sobic002G319766--Sobic005G110517 Sobic004G140900 Sobic004G140900 Sobic002G319766--Sobic004G140900 Sobic002G319766--Sobic006G199601 Sobic002G319766--Sobic002G118000 Sobic005G110517--Sobic006G199601 Sobic005G110517--Sobic001G288500 Sobic005G110517--Sobic010G025600 Sobic005G110517--Sobic003G012750 Sobic005G110517--Sobic010G167700 Sobic005G110517--Sobic003G229650 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic005G110517--Sobic008G053500 Sobic010G127700 Sobic010G127700 Sobic005G110517--Sobic010G127700 Sobic005G110517--Sobic003G411150 Sobic003G301050--Sobic010G167700 Sobic003G301050--SobicK043600 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic003G301050--Sobic003G072000 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic003G301050--Sobic001G527550 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic003G301050--Sobic005G187700 Sobic003G301050--Sobic004G140900 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic003G301050--Sobic002G074700 Sobic003G301050--Sobic001G251750 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic003G301050--Sobic007G079901 Sobic002G112200 Sobic002G112200 Sobic010G124100--Sobic002G112200 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic010G124100--Sobic001G401750 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic010G124100--Sobic005G119400 Sobic010G124100--SobicK043600 Sobic010G061400 Sobic010G061400 Sobic010G124100--Sobic010G061400 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic010G124100--Sobic001G050650 Sobic010G124100--Sobic010G167700 Sobic010G124100--Sobic003G301050 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic010G124100--Sobic003G168600 Sobic001G251750--Sobic004G140900 Sobic001G251750--SobicK043600 Sobic001G251750--Sobic002G074700 Sobic001G251750--Sobic003G301050 Sobic001G251750--Sobic010G167700 Sobic001G251750--Sobic008G053500 Sobic001G251750--Sobic006G199601 Sobic001G251750--Sobic003G012750 Sobic002G365200 Sobic002G365200 Sobic001G251750--Sobic002G365200 Sobic003G411150--Sobic010G167700 Sobic003G411150--Sobic005G110517 Sobic003G411150--Sobic001G288500 Sobic003G411150--Sobic003G301050 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic003G411150--Sobic006G099400 Sobic003G411150--Sobic006G199601 Sobic010G055900 Sobic010G055900 Sobic003G411150--Sobic010G055900 Sobic003G411150--Sobic010G124100 Sobic003G411150--Sobic001G527550
Octagon: transcription factors


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