Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G086900.2,Sobic.005G086900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RHF8 , A0A1B6PR21
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.005G086900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G039401 - -
2 Sobic.006G066000 - -
3 Sobic.001G131500 - -
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6 Sobic.008G106600 - -
7 Sobic.008G099500 - -
8 Sobic.005G114600 tyrosine aminotransferase, putative, expressed K03263: translation initiation factor 5A
9 Sobic.003G060600 expressed protein -
10 Sobic.001G105600 OsFBDUF60 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G361000 OB-fold nucleic acid binding domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G244700 cytosolic phospholipase A2 beta, putative, expressed K19219: peptidyl-lysine (3S)-dioxygenase / protease
13 Sobic.001G078300 nucleoporin p58/p45, putative, expressed K14307: NUPL1, nucleoporin p58/p45
14 Sobic.005G079700 expressed protein -
15 Sobic.008G125100 Mur ligase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G072501 - -
17 Sobic.005G128000 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
18 Sobic.004G180500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@12-oxophytodienoate reductase, putative, expressed K05894: 12-oxophytodienoic acid reductase
19 Sobic.009G205400 RING-H2 finger protein ATL2M, putative, expressed -
20 Sobic.002G019750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G086900 Sobic005G086900 Sobic008G039401 Sobic008G039401 Sobic005G086900--Sobic008G039401 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic005G086900--Sobic006G066000 Sobic001G131500 Sobic001G131500 Sobic005G086900--Sobic001G131500 Sobic004G089500 Sobic004G089500 Sobic005G086900--Sobic004G089500 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic005G086900--Sobic001G261537 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic005G086900--Sobic008G106600 Sobic008G099500 Sobic008G099500 Sobic005G086900--Sobic008G099500 Sobic005G114600 Sobic005G114600 Sobic005G086900--Sobic005G114600 Sobic003G060600 Sobic003G060600 Sobic005G086900--Sobic003G060600 Sobic008G088839 Sobic008G088839 Sobic008G039401--Sobic008G088839 Sobic004G108501 Sobic004G108501 Sobic008G039401--Sobic004G108501 Sobic003G009400 Sobic003G009400 Sobic008G039401--Sobic003G009400 Sobic008G039401--Sobic008G106600 Sobic003G049600 Sobic003G049600 Sobic008G039401--Sobic003G049600 Sobic008G039401--Sobic004G089500 Sobic001G105600 Sobic001G105600 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Octagon: transcription factors


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