Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G112632.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJ12
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g14500.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G531000 expressed protein -
2 Sobic.005G114600 tyrosine aminotransferase, putative, expressed K03263: translation initiation factor 5A
3 Sobic.003G328400 indole-3-acetate beta-glucosyltransferase, putative, expressed -
4 Sobic.004G357900 GHMP kinases ATP-binding protein, putative, expressed K00872: homoserine kinase
5 Sobic.007G163600 expressed protein -
6 Sobic.003G010500 protein kinase domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G296100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
8 Sobic.006G073150 - -
9 Sobic.006G146900 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G023666 - -
11 Sobic.001G193900 - -
12 Sobic.004G049800 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
13 Sobic.005G112566 - -
14 Sobic.010G153532 - -
15 Sobic.008G166050 - -
16 Sobic.005G007900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@protein phosphatase 2c, putative, expressed -
17 Sobic.003G290600 stress-induced protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G534300 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@AT-GTL1, putative, expressed -
19 Sobic.009G070000 "GW5/qSW5(Ortholog in rice:Liu et al., 2017)"(PubMedID : 31659922)@IQ calmodulin-binding motif family protein, expressed -
20 Sobic.008G144300 cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G112632 Sobic005G112632 Sobic001G531000 Sobic001G531000 Sobic005G112632--Sobic001G531000 Sobic005G114600 Sobic005G114600 Sobic005G112632--Sobic005G114600 Sobic003G328400 Sobic003G328400 Sobic005G112632--Sobic003G328400 Sobic004G357900 Sobic004G357900 Sobic005G112632--Sobic004G357900 Sobic007G163600 Sobic007G163600 Sobic005G112632--Sobic007G163600 Sobic003G010500 Sobic003G010500 Sobic005G112632--Sobic003G010500 Sobic004G296100 Sobic004G296100 Sobic005G112632--Sobic004G296100 Sobic006G073150 Sobic006G073150 Sobic005G112632--Sobic006G073150 Sobic006G146900 Sobic006G146900 Sobic005G112632--Sobic006G146900 Sobic005G036500 Sobic005G036500 Sobic001G531000--Sobic005G036500 Sobic007G136600 Sobic007G136600 Sobic001G531000--Sobic007G136600 Sobic003G095000 Sobic003G095000 Sobic001G531000--Sobic003G095000 Sobic006G074100 Sobic006G074100 Sobic001G531000--Sobic006G074100 Sobic001G347800 Sobic001G347800 Sobic001G531000--Sobic001G347800 Sobic005G218700 Sobic005G218700 Sobic001G531000--Sobic005G218700 Sobic008G136500 Sobic008G136500 Sobic001G531000--Sobic008G136500 Sobic003G229700 Sobic003G229700 Sobic001G531000--Sobic003G229700 Sobic002G025300 Sobic002G025300 Sobic001G531000--Sobic002G025300 Sobic005G114600--Sobic003G328400 Sobic005G114600--Sobic006G073150 Sobic002G416200 Sobic002G416200 Sobic005G114600--Sobic002G416200 Sobic005G114600--Sobic006G146900 Sobic001G374800 Sobic001G374800 Sobic005G114600--Sobic001G374800 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic005G114600--Sobic006G066000 Sobic005G114600--Sobic005G112632 Sobic003G257200 Sobic003G257200 Sobic005G114600--Sobic003G257200 Sobic008G090300 Sobic008G090300 Sobic005G114600--Sobic008G090300 Sobic003G328400--Sobic005G114600 Sobic003G328400--Sobic005G112632 Sobic003G328400--Sobic006G073150 Sobic006G004000 Sobic006G004000 Sobic003G328400--Sobic006G004000 Sobic008G067301 Sobic008G067301 Sobic003G328400--Sobic008G067301 Sobic001G267266 Sobic001G267266 Sobic003G328400--Sobic001G267266 Sobic001G451200 Sobic001G451200 Sobic003G328400--Sobic001G451200 Sobic006G019600 Sobic006G019600 Sobic003G328400--Sobic006G019600 Sobic003G048700 Sobic003G048700 Sobic003G328400--Sobic003G048700 Sobic008G086401 Sobic008G086401 Sobic004G357900--Sobic008G086401 Sobic006G212000 Sobic006G212000 Sobic004G357900--Sobic006G212000 Sobic002G120200 Sobic002G120200 Sobic004G357900--Sobic002G120200 Sobic001G256900 Sobic001G256900 Sobic004G357900--Sobic001G256900 Sobic001G362400 Sobic001G362400 Sobic004G357900--Sobic001G362400 Sobic003G022800 Sobic003G022800 Sobic004G357900--Sobic003G022800 Sobic010G153532 Sobic010G153532 Sobic004G357900--Sobic010G153532 Sobic003G219400 Sobic003G219400 Sobic004G357900--Sobic003G219400 Sobic004G357900--Sobic005G112632 Sobic003G245900 Sobic003G245900 Sobic007G163600--Sobic003G245900 Sobic006G146800 Sobic006G146800 Sobic007G163600--Sobic006G146800 Sobic010G123300 Sobic010G123300 Sobic007G163600--Sobic010G123300 Sobic001G131700 Sobic001G131700 Sobic007G163600--Sobic001G131700 Sobic003G052600 Sobic003G052600 Sobic007G163600--Sobic003G052600 Sobic001G471600 Sobic001G471600 Sobic007G163600--Sobic001G471600 Sobic003G273300 Sobic003G273300 Sobic007G163600--Sobic003G273300 Sobic008G125100 Sobic008G125100 Sobic007G163600--Sobic008G125100 Sobic003G332200 Sobic003G332200 Sobic007G163600--Sobic003G332200 Sobic005G111600 Sobic005G111600 Sobic003G010500--Sobic005G111600 Sobic005G007900 Sobic005G007900 Sobic003G010500--Sobic005G007900 Sobic003G010500--Sobic006G146900 Sobic002G237700 Sobic002G237700 Sobic003G010500--Sobic002G237700 Sobic003G231900 Sobic003G231900 Sobic003G010500--Sobic003G231900 Sobic003G400600 Sobic003G400600 Sobic003G010500--Sobic003G400600 Sobic003G010500--Sobic002G120200 Sobic003G023666 Sobic003G023666 Sobic003G010500--Sobic003G023666 Sobic003G010500--Sobic005G112632 Sobic004G049800 Sobic004G049800 Sobic004G296100--Sobic004G049800 Sobic003G047300 Sobic003G047300 Sobic004G296100--Sobic003G047300 Sobic009G070000 Sobic009G070000 Sobic004G296100--Sobic009G070000 Sobic006G271100 Sobic006G271100 Sobic004G296100--Sobic006G271100 Sobic004G296100--Sobic005G111600 Sobic004G296100--Sobic002G025300 Sobic002G206400 Sobic002G206400 Sobic004G296100--Sobic002G206400 Sobic008G144300 Sobic008G144300 Sobic004G296100--Sobic008G144300 Sobic007G169000 Sobic007G169000 Sobic004G296100--Sobic007G169000 Sobic006G073150--Sobic001G451200 Sobic007G072800 Sobic007G072800 Sobic006G073150--Sobic007G072800 Sobic006G073150--Sobic002G416200 Sobic006G073150--Sobic001G267266 Sobic006G073150--Sobic003G048700 Sobic003G290600 Sobic003G290600 Sobic006G073150--Sobic003G290600 Sobic002G018901 Sobic002G018901 Sobic006G073150--Sobic002G018901 Sobic006G073150--Sobic002G120200 Sobic006G073150--Sobic010G153532 Sobic006G146900--Sobic002G120200 Sobic002G200500 Sobic002G200500 Sobic006G146900--Sobic002G200500 Sobic006G146900--Sobic002G237700 Sobic006G240300 Sobic006G240300 Sobic006G146900--Sobic006G240300 Sobic003G182100 Sobic003G182100 Sobic006G146900--Sobic003G182100 Sobic001G404000 Sobic001G404000 Sobic006G146900--Sobic001G404000 Sobic006G146900--Sobic001G362400 Sobic001G193900 Sobic001G193900 Sobic006G146900--Sobic001G193900 Sobic009G233600 Sobic009G233600 Sobic006G146900--Sobic009G233600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.