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Transcriptome id Sobic.005G130001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIU4
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Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G262500 expressed protein -
2 Sobic.004G310700 glutaredoxin 2, putative, expressed -
3 Sobic.001G516200 expressed protein -
4 Sobic.009G028600 expressed protein -
5 Sobic.007G072400 phosphoribosyl transferase, putative, expressed -
6 Sobic.009G187500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@MONOCULM 1, putative, expressed -
7 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G048250 - -
9 Sobic.006G169300 - -
10 Sobic.008G023000 expressed protein -
11 Sobic.004G226300 expressed protein -
12 Sobic.001G527400 - -
13 Sobic.004G347866 - -
14 Sobic.003G173032 - -
15 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
16 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -
17 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
18 Sobic.007G157550 - -
19 Sobic.010G152700 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G209800 nodulin, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G130001 Sobic005G130001 Sobic001G262500 Sobic001G262500 Sobic005G130001--Sobic001G262500 Sobic004G310700 Sobic004G310700 Sobic005G130001--Sobic004G310700 Sobic001G516200 Sobic001G516200 Sobic005G130001--Sobic001G516200 Sobic009G028600 Sobic009G028600 Sobic005G130001--Sobic009G028600 Sobic007G072400 Sobic007G072400 Sobic005G130001--Sobic007G072400 Sobic009G187500 Sobic009G187500 Sobic005G130001--Sobic009G187500 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic005G130001--Sobic007G183000 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic005G130001--Sobic002G048250 Sobic006G169300 Sobic006G169300 Sobic005G130001--Sobic006G169300 Sobic006G212600 Sobic006G212600 Sobic001G262500--Sobic006G212600 Sobic010G267650 Sobic010G267650 Sobic001G262500--Sobic010G267650 Sobic005G076650 Sobic005G076650 Sobic001G262500--Sobic005G076650 Sobic001G262500--Sobic005G130001 Sobic004G043200 Sobic004G043200 Sobic001G262500--Sobic004G043200 Sobic007G016000 Sobic007G016000 Sobic001G262500--Sobic007G016000 Sobic003G284500 Sobic003G284500 Sobic001G262500--Sobic003G284500 Sobic001G262500--Sobic007G072400 Sobic001G262500--Sobic001G516200 Sobic003G397000 Sobic003G397000 Sobic004G310700--Sobic003G397000 Sobic004G310700--Sobic001G516200 Sobic003G191800 Sobic003G191800 Sobic004G310700--Sobic003G191800 Sobic001G460700 Sobic001G460700 Sobic004G310700--Sobic001G460700 Sobic004G310700--Sobic007G072400 Sobic010G152700 Sobic010G152700 Sobic004G310700--Sobic010G152700 Sobic003G142900 Sobic003G142900 Sobic004G310700--Sobic003G142900 Sobic005G102200 Sobic005G102200 Sobic004G310700--Sobic005G102200 Sobic007G139000 Sobic007G139000 Sobic004G310700--Sobic007G139000 Sobic001G516200--Sobic003G191800 Sobic001G516200--Sobic005G102200 Sobic001G516200--Sobic010G152700 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic001G516200--Sobic001G483700 Sobic001G516200--Sobic007G072400 Sobic001G516200--Sobic007G183000 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic001G516200--Sobic002G285525 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic001G516200--Sobic004G226300 Sobic001G516200--Sobic007G139000 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic009G028600--Sobic006G171000 Sobic009G028600--Sobic004G226300 Sobic009G028600--Sobic007G183000 Sobic009G028600--Sobic002G285525 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic009G028600--Sobic001G527400 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic009G028600--Sobic005G231800 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic009G028600--Sobic001G137200 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic009G028600--Sobic008G023000 Sobic009G028600--Sobic002G048250 Sobic007G072400--Sobic001G527400 Sobic007G072400--Sobic006G171000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic007G072400--Sobic008G002100 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic007G072400--Sobic005G209800 Sobic007G072400--Sobic007G183000 Sobic007G072400--Sobic008G023000 Sobic007G072400--Sobic004G226300 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic007G072400--Sobic003G173032 Sobic007G072400--Sobic001G137200 Sobic009G187500--Sobic002G048250 Sobic009G187500--Sobic008G002100 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic009G187500--Sobic004G089700 Sobic009G187500--Sobic007G183000 Sobic009G187500--Sobic001G527400 Sobic009G187500--Sobic008G023000 Sobic009G187500--Sobic005G209800 Sobic009G187500--Sobic004G226300 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic009G187500--Sobic004G224300 Sobic007G183000--Sobic004G226300 Sobic007G183000--Sobic001G527400 Sobic007G183000--Sobic002G048250 Sobic007G183000--Sobic008G023000 Sobic007G183000--Sobic008G002100 Sobic007G183000--Sobic005G231800 Sobic007G183000--Sobic005G209800 Sobic007G183000--Sobic003G173032 Sobic007G183000--Sobic006G171000 Sobic002G048250--Sobic007G183000 Sobic002G048250--Sobic001G527400 Sobic002G048250--Sobic004G226300 Sobic002G048250--Sobic008G023000 Sobic002G048250--Sobic008G002100 Sobic002G048250--Sobic005G231800 Sobic002G048250--Sobic005G209800 Sobic002G048250--Sobic003G173032 Sobic002G048250--Sobic004G224300 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic006G169300--Sobic009G223700 Sobic006G169300--Sobic002G285525 Sobic006G169300--Sobic004G224300 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic006G169300--Sobic010G002850 Sobic006G169300--Sobic004G226300 Sobic006G169300--Sobic007G183000 Sobic006G169300--Sobic006G171000 Sobic006G169300--Sobic001G527400 Sobic006G169300--Sobic002G048250
Octagon: transcription factors


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