Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G262500.3,Sobic.001G262500.2,Sobic.001G262500.4
Synonym Sb01g024673
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S873 , A0A1Z5S7P0
Pfam -
Panther DB PTHR31662 PTHR31662:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g01140.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040580 , Zm00025a040588
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G262500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G212600 M16 domain containing zinc peptidase, putative, expressed -
2 Sobic.010G267650 - -
3 Sobic.005G076650 - -
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7 Sobic.003G284500 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22, putative, expressed K15139: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22
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17 Sobic.010G152700 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
18 Sobic.010G061100 DUF292 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G377200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.004G131100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G262500 Sobic001G262500 Sobic006G212600 Sobic006G212600 Sobic001G262500--Sobic006G212600 Sobic010G267650 Sobic010G267650 Sobic001G262500--Sobic010G267650 Sobic005G076650 Sobic005G076650 Sobic001G262500--Sobic005G076650 Sobic005G130001 Sobic005G130001 Sobic001G262500--Sobic005G130001 Sobic004G043200 Sobic004G043200 Sobic001G262500--Sobic004G043200 Sobic007G016000 Sobic007G016000 Sobic001G262500--Sobic007G016000 Sobic003G284500 Sobic003G284500 Sobic001G262500--Sobic003G284500 Sobic007G072400 Sobic007G072400 Sobic001G262500--Sobic007G072400 Sobic001G516200 Sobic001G516200 Sobic001G262500--Sobic001G516200 Sobic006G212600--Sobic001G262500 Sobic003G001550 Sobic003G001550 Sobic006G212600--Sobic003G001550 Sobic009G088401 Sobic009G088401 Sobic006G212600--Sobic009G088401 Sobic006G212600--Sobic007G072400 Sobic005G098200 Sobic005G098200 Sobic006G212600--Sobic005G098200 Sobic006G212600--Sobic004G043200 Sobic006G212600--Sobic007G016000 Sobic006G212600--Sobic003G284500 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic006G212600--Sobic003G173032 Sobic005G003900 Sobic005G003900 Sobic010G267650--Sobic005G003900 Sobic003G128500 Sobic003G128500 Sobic010G267650--Sobic003G128500 Sobic010G267650--Sobic001G262500 Sobic006G111500 Sobic006G111500 Sobic010G267650--Sobic006G111500 Sobic007G090448 Sobic007G090448 Sobic010G267650--Sobic007G090448 Sobic009G230400 Sobic009G230400 Sobic010G267650--Sobic009G230400 Sobic006G073001 Sobic006G073001 Sobic010G267650--Sobic006G073001 Sobic004G310700 Sobic004G310700 Sobic010G267650--Sobic004G310700 Sobic007G159800 Sobic007G159800 Sobic010G267650--Sobic007G159800 Sobic008G098098 Sobic008G098098 Sobic005G076650--Sobic008G098098 Sobic005G076650--Sobic007G016000 Sobic005G076650--Sobic009G088401 Sobic005G076650--Sobic004G043200 Sobic005G076650--Sobic007G072400 Sobic010G152700 Sobic010G152700 Sobic005G076650--Sobic010G152700 Sobic008G119200 Sobic008G119200 Sobic005G076650--Sobic008G119200 Sobic005G076650--Sobic001G516200 Sobic006G273500 Sobic006G273500 Sobic005G076650--Sobic006G273500 Sobic005G130001--Sobic001G262500 Sobic005G130001--Sobic004G310700 Sobic005G130001--Sobic001G516200 Sobic009G028600 Sobic009G028600 Sobic005G130001--Sobic009G028600 Sobic005G130001--Sobic007G072400 Sobic009G187500 Sobic009G187500 Sobic005G130001--Sobic009G187500 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic005G130001--Sobic007G183000 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic005G130001--Sobic002G048250 Sobic006G169300 Sobic006G169300 Sobic005G130001--Sobic006G169300 Sobic004G043200--Sobic009G088401 Sobic004G107400 Sobic004G107400 Sobic004G043200--Sobic004G107400 Sobic010G014900 Sobic010G014900 Sobic004G043200--Sobic010G014900 Sobic004G043200--Sobic007G072400 Sobic003G390300 Sobic003G390300 Sobic004G043200--Sobic003G390300 Sobic004G043200--Sobic005G076650 Sobic007G158400 Sobic007G158400 Sobic004G043200--Sobic007G158400 Sobic004G043200--Sobic009G028600 Sobic004G109500 Sobic004G109500 Sobic004G043200--Sobic004G109500 Sobic007G016000--Sobic008G098098 Sobic007G016000--Sobic009G088401 Sobic007G016000--Sobic008G119200 Sobic004G180600 Sobic004G180600 Sobic007G016000--Sobic004G180600 Sobic007G016000--Sobic007G072400 Sobic007G016000--Sobic010G152700 Sobic007G016000--Sobic003G173032 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic007G016000--Sobic006G171000 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic007G016000--Sobic008G023000 Sobic003G284500--Sobic003G128500 Sobic003G284500--Sobic007G072400 Sobic003G284500--Sobic004G109500 Sobic003G284500--Sobic009G088401 Sobic009G050100 Sobic009G050100 Sobic003G284500--Sobic009G050100 Sobic002G173600 Sobic002G173600 Sobic003G284500--Sobic002G173600 Sobic003G284500--Sobic004G107400 Sobic003G284500--Sobic003G390300 Sobic003G284500--Sobic010G152700 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic007G072400--Sobic001G527400 Sobic007G072400--Sobic006G171000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic007G072400--Sobic008G002100 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic007G072400--Sobic005G209800 Sobic007G072400--Sobic007G183000 Sobic007G072400--Sobic008G023000 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic007G072400--Sobic004G226300 Sobic007G072400--Sobic003G173032 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic007G072400--Sobic001G137200 Sobic003G191800 Sobic003G191800 Sobic001G516200--Sobic003G191800 Sobic005G102200 Sobic005G102200 Sobic001G516200--Sobic005G102200 Sobic001G516200--Sobic010G152700 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic001G516200--Sobic001G483700 Sobic001G516200--Sobic007G072400 Sobic001G516200--Sobic007G183000 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic001G516200--Sobic002G285525 Sobic001G516200--Sobic004G226300 Sobic007G139000 Sobic007G139000 Sobic001G516200--Sobic007G139000
Octagon: transcription factors


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