Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G158100.2,Sobic.005G158100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PSS7 , A0A1Z5RIS9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.005G158100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G170900 OsFBDUF64 - F-box and DUF domain containing protein -
2 Sobic.004G096801 - -
3 Sobic.006G215600 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
4 Sobic.010G050750 - -
5 Sobic.010G195701 - -
6 Sobic.002G115100 - -
7 Sobic.007G113400 - -
8 Sobic.010G037300 OsMKK1 - putative MAPKK based on amino acid sequence homology, expressed K04368: MAP2K1, mitogen-activated protein kinase kinase 1
9 Sobic.002G193400 lipase, putative, expressed K18875: enhanced disease susceptibility 1 protein
10 Sobic.004G092900 puromycin-sensitive aminopeptidase, putative, expressed K08776: puromycin-sensitive aminopeptidase
11 Sobic.006G269000 protein kinase, putative, expressed -
12 Sobic.001G333300 circadian clock coupling factor-related, putative, expressed -
13 Sobic.005G219300 resistance protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G421900 Homologous to Dof genes in Arabidopsis and rice.(PubMedID : 21161392)@expressed protein -
15 Sobic.003G080800 expressed protein -
16 Sobic.003G110400 inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G317300 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
18 Sobic.006G072601 - -
19 Sobic.004G210900 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
20 Sobic.002G115075 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G158100 Sobic005G158100 Sobic005G170900 Sobic005G170900 Sobic005G158100--Sobic005G170900 Sobic004G096801 Sobic004G096801 Sobic005G158100--Sobic004G096801 Sobic006G215600 Sobic006G215600 Sobic005G158100--Sobic006G215600 Sobic010G050750 Sobic010G050750 Sobic005G158100--Sobic010G050750 Sobic010G195701 Sobic010G195701 Sobic005G158100--Sobic010G195701 Sobic002G115100 Sobic002G115100 Sobic005G158100--Sobic002G115100 Sobic007G113400 Sobic007G113400 Sobic005G158100--Sobic007G113400 Sobic010G037300 Sobic010G037300 Sobic005G158100--Sobic010G037300 Sobic002G193400 Sobic002G193400 Sobic005G158100--Sobic002G193400 Sobic002G022200 Sobic002G022200 Sobic005G170900--Sobic002G022200 Sobic005G170900--Sobic005G158100 Sobic003G261733 Sobic003G261733 Sobic005G170900--Sobic003G261733 Sobic002G021700 Sobic002G021700 Sobic005G170900--Sobic002G021700 Sobic004G213900 Sobic004G213900 Sobic005G170900--Sobic004G213900 Sobic003G170400 Sobic003G170400 Sobic005G170900--Sobic003G170400 Sobic002G103100 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Octagon: transcription factors


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