Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G050750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VRJ2
Pfam PF06485
Panther DB PTHR34556
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G08010 : RNA binding
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g39740.1 : psaB translation factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021213
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G193400 lipase, putative, expressed K18875: enhanced disease susceptibility 1 protein
2 Sobic.004G122100 - -
3 Sobic.003G003000 DNA-binding protein-related, putative, expressed K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
4 Sobic.009G128000 - -
5 Sobic.003G325500 ICE-like protease p20 domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G158100 - -
7 Sobic.003G402200 sensitivity to red light reduced protein 1, putative, expressed -
8 Sobic.010G012800 acyl CoA binding protein, putative, expressed K08762: DBI, diazepam-binding inhibitor (GABA receptor modulator, acyl-CoA-binding protein)
9 Sobic.001G233200 - -
10 Sobic.006G008900 TKL_IRAK_CrRLK1L-1.10 - The CrRLK1L-1 subfamily has homology to the CrRLK1L homolog, expressed -
11 Sobic.005G127100 expressed protein -
12 Sobic.010G195701 - -
13 Sobic.001G320700 prephenate dehydratase domain containing protein, expressed -
14 Sobic.004G018400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K01802: peptidylprolyl isomerase
15 Sobic.001G022600 glycine-rich RNA-binding protein 7, putative, expressed K12885: RBMX, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein G
16 Sobic.002G048800 expressed protein -
17 Sobic.004G209500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.001G128100 expressed protein -
19 Sobic.010G004701 - -
20 Sobic.001G416300 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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