Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G181100.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PTA4
Pfam -
Panther DB PTHR35166 PTHR35166:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g10420.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G021401 - -
2 Sobic.006G053000 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G184500 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
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7 Sobic.010G278300 OsPOP15 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed K01354: oligopeptidase B
8 Sobic.010G150600 - -
9 Sobic.009G004500 expressed protein -
10 Sobic.001G361750 - -
11 Sobic.007G017300 endoglucanase, putative, expressed -
12 Sobic.001G007500 exosome complex exonuclease, putative, expressed K12590: RRP46, exosome complex component RRP46
13 Sobic.001G060200 - -
14 Sobic.005G155001 - -
15 Sobic.001G176800 - -
16 Sobic.001G212701 - -
17 Sobic.009G114900 - -
18 Sobic.009G004300 ECT protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G093500 protein binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G090406 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G181100 Sobic005G181100 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic005G181100--Sobic010G021401 Sobic006G053000 Sobic006G053000 Sobic005G181100--Sobic006G053000 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic005G181100--Sobic009G184500 Sobic001G527900 Sobic001G527900 Sobic005G181100--Sobic001G527900 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic005G181100--Sobic008G192800 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic005G181100--Sobic004G184500 Sobic010G278300 Sobic010G278300 Sobic005G181100--Sobic010G278300 Sobic010G150600 Sobic010G150600 Sobic005G181100--Sobic010G150600 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic005G181100--Sobic009G004500 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic010G021401--Sobic005G155001 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic010G021401--Sobic009G114900 Sobic010G021401--Sobic009G004500 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic010G021401--Sobic001G483200 Sobic010G021401--Sobic001G527900 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic010G021401--Sobic007G090406 Sobic002G252700 Sobic002G252700 Sobic010G021401--Sobic002G252700 Sobic008G185000 Sobic008G185000 Sobic010G021401--Sobic008G185000 Sobic010G021401--Sobic008G192800 Sobic006G229600 Sobic006G229600 Sobic006G053000--Sobic006G229600 Sobic002G271900 Sobic002G271900 Sobic006G053000--Sobic002G271900 Sobic003G230300 Sobic003G230300 Sobic006G053000--Sobic003G230300 Sobic010G155901 Sobic010G155901 Sobic006G053000--Sobic010G155901 Sobic006G058300 Sobic006G058300 Sobic006G053000--Sobic006G058300 Sobic003G400332 Sobic003G400332 Sobic006G053000--Sobic003G400332 Sobic006G069050 Sobic006G069050 Sobic006G053000--Sobic006G069050 Sobic003G149900 Sobic003G149900 Sobic006G053000--Sobic003G149900 Sobic006G110600 Sobic006G110600 Sobic006G053000--Sobic006G110600 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic009G184500--Sobic001G490600 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic009G184500--Sobic007G017300 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic009G184500--Sobic001G368000 Sobic009G184500--Sobic009G004500 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic009G184500--Sobic004G288900 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic009G184500--Sobic002G360701 Sobic009G184500--Sobic010G150600 Sobic009G184500--Sobic001G483200 Sobic009G184500--Sobic005G155001 Sobic001G527900--Sobic005G155001 Sobic001G527900--Sobic001G483200 Sobic001G527900--Sobic009G114900 Sobic002G314950 Sobic002G314950 Sobic001G527900--Sobic002G314950 Sobic001G527900--Sobic009G004500 Sobic001G527900--Sobic010G021401 Sobic001G060200 Sobic001G060200 Sobic001G527900--Sobic001G060200 Sobic001G527900--Sobic007G017300 Sobic001G527900--Sobic007G090406 Sobic008G192800--Sobic007G090406 Sobic008G192800--Sobic009G004500 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic008G192800--Sobic003G093500 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic008G192800--Sobic001G176800 Sobic008G192800--Sobic009G114900 Sobic008G192800--Sobic005G155001 Sobic008G192800--Sobic007G017300 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic008G192800--Sobic007G061500 Sobic008G192800--Sobic001G368000 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic004G184500--Sobic008G166250 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic004G184500--Sobic003G155350 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic004G184500--Sobic005G094500 Sobic004G184500--Sobic001G176800 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic004G184500--Sobic001G212701 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic004G184500--Sobic002G114600 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic004G184500--Sobic001G468200 Sobic003G202900 Sobic003G202900 Sobic004G184500--Sobic003G202900 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic004G184500--Sobic004G314750 Sobic006G093400 Sobic006G093400 Sobic010G278300--Sobic006G093400 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic010G278300--Sobic010G257300 Sobic010G253700 Sobic010G253700 Sobic010G278300--Sobic010G253700 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic010G278300--Sobic008G096900 Sobic004G012100 Sobic004G012100 Sobic010G278300--Sobic004G012100 Sobic009G072400 Sobic009G072400 Sobic010G278300--Sobic009G072400 Sobic010G278300--Sobic002G314950 Sobic010G278300--Sobic009G114900 Sobic010G278300--Sobic006G229600 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic010G150600--Sobic008G096150 Sobic010G150600--Sobic009G184500 Sobic010G150600--Sobic010G021401 Sobic010G150600--Sobic005G155001 Sobic009G004300 Sobic009G004300 Sobic010G150600--Sobic009G004300 Sobic010G150600--Sobic002G360701 Sobic010G150600--Sobic001G490600 Sobic003G082401 Sobic003G082401 Sobic010G150600--Sobic003G082401 Sobic001G309000 Sobic001G309000 Sobic010G150600--Sobic001G309000 Sobic009G004500--Sobic007G017300 Sobic009G004500--Sobic001G483200 Sobic009G004500--Sobic005G155001 Sobic009G004500--Sobic001G368000 Sobic009G004500--Sobic007G061500 Sobic001G028500 Sobic001G028500 Sobic009G004500--Sobic001G028500 Sobic009G004500--Sobic003G093500 Sobic009G004500--Sobic010G021401 Sobic009G004500--Sobic001G060200
Octagon: transcription factors


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