Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G222800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PU28
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G088000 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G069000 transferase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.008G106200 cytochrome P450, putative, expressed -
4 Sobic.003G210801 - -
5 Sobic.001G301500 expansin precursor, putative, expressed -
6 Sobic.003G445100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K13195: cold-inducible RNA-binding protein
7 Sobic.005G222700 OsWAK104 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
8 Sobic.003G069100 regulator of ribonuclease, putative, expressed -
9 Sobic.006G180432 - -
10 Sobic.006G134400 protein FAM133, putative, expressed -
11 Sobic.010G015800 zinc RING finger protein, putative, expressed K19045: E3 ubiquitin-protein ligase BIG BROTHER and related proteins
12 Sobic.003G118800 - -
13 Sobic.005G154100 OsWAK98 - OsWAK receptor-like cytoplasmic kinase OsWAK-RLCK, expressed -
14 Sobic.003G404900 regulatory protein, putative, expressed -
15 Sobic.008G175300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@OsFBX3 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G383300 RNA polymerase III RPC4 domain containing protein, expressed K03026: RPC4, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4
17 Sobic.004G094600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G342300 dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed -
19 Sobic.008G067200 inhibitor I family protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G143400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G222800 Sobic005G222800 Sobic008G088000 Sobic008G088000 Sobic005G222800--Sobic008G088000 Sobic003G069000 Sobic003G069000 Sobic005G222800--Sobic003G069000 Sobic008G106200 Sobic008G106200 Sobic005G222800--Sobic008G106200 Sobic003G210801 Sobic003G210801 Sobic005G222800--Sobic003G210801 Sobic001G301500 Sobic001G301500 Sobic005G222800--Sobic001G301500 Sobic003G445100 Sobic003G445100 Sobic005G222800--Sobic003G445100 Sobic005G222700 Sobic005G222700 Sobic005G222800--Sobic005G222700 Sobic003G069100 Sobic003G069100 Sobic005G222800--Sobic003G069100 Sobic006G180432 Sobic006G180432 Sobic005G222800--Sobic006G180432 Sobic008G088000--Sobic003G069100 Sobic009G196800 Sobic009G196800 Sobic008G088000--Sobic009G196800 Sobic008G088000--Sobic003G069000 Sobic003G342300 Sobic003G342300 Sobic008G088000--Sobic003G342300 Sobic007G171600 Sobic007G171600 Sobic008G088000--Sobic007G171600 Sobic004G143400 Sobic004G143400 Sobic008G088000--Sobic004G143400 Sobic010G109200 Sobic010G109200 Sobic008G088000--Sobic010G109200 Sobic006G134400 Sobic006G134400 Sobic008G088000--Sobic006G134400 Sobic008G067200 Sobic008G067200 Sobic008G088000--Sobic008G067200 Sobic010G183100 Sobic010G183100 Sobic003G069000--Sobic010G183100 Sobic003G069000--Sobic007G171600 Sobic004G035700 Sobic004G035700 Sobic003G069000--Sobic004G035700 Sobic006G051300 Sobic006G051300 Sobic003G069000--Sobic006G051300 Sobic003G069000--Sobic003G069100 Sobic008G081200 Sobic008G081200 Sobic003G069000--Sobic008G081200 Sobic003G069000--Sobic003G342300 Sobic002G000500 Sobic002G000500 Sobic003G069000--Sobic002G000500 Sobic003G069000--Sobic006G134400 Sobic001G189100 Sobic001G189100 Sobic008G106200--Sobic001G189100 Sobic003G237600 Sobic003G237600 Sobic008G106200--Sobic003G237600 Sobic009G254600 Sobic009G254600 Sobic008G106200--Sobic009G254600 Sobic001G355600 Sobic001G355600 Sobic008G106200--Sobic001G355600 Sobic003G036100 Sobic003G036100 Sobic008G106200--Sobic003G036100 Sobic008G106200--Sobic004G035700 Sobic008G106200--Sobic010G183100 Sobic001G068400 Sobic001G068400 Sobic008G106200--Sobic001G068400 Sobic005G222900 Sobic005G222900 Sobic003G210801--Sobic005G222900 Sobic006G249050 Sobic006G249050 Sobic003G210801--Sobic006G249050 Sobic001G269300 Sobic001G269300 Sobic003G210801--Sobic001G269300 Sobic005G036600 Sobic005G036600 Sobic003G210801--Sobic005G036600 Sobic003G386600 Sobic003G386600 Sobic003G210801--Sobic003G386600 Sobic002G031600 Sobic002G031600 Sobic003G210801--Sobic002G031600 Sobic003G383300 Sobic003G383300 Sobic003G210801--Sobic003G383300 Sobic003G107800 Sobic003G107800 Sobic003G210801--Sobic003G107800 Sobic003G210801--Sobic006G180432 Sobic001G301600 Sobic001G301600 Sobic001G301500--Sobic001G301600 Sobic001G301500--Sobic005G222800 Sobic001G301500--Sobic003G069100 Sobic001G300800 Sobic001G300800 Sobic001G301500--Sobic001G300800 Sobic003G404900 Sobic003G404900 Sobic001G301500--Sobic003G404900 Sobic001G301500--Sobic001G355600 Sobic008G105850 Sobic008G105850 Sobic001G301500--Sobic008G105850 Sobic001G215600 Sobic001G215600 Sobic001G301500--Sobic001G215600 Sobic001G208100 Sobic001G208100 Sobic001G301500--Sobic001G208100 Sobic003G445100--Sobic003G383300 Sobic004G175600 Sobic004G175600 Sobic003G445100--Sobic004G175600 Sobic001G532700 Sobic001G532700 Sobic003G445100--Sobic001G532700 Sobic007G171950 Sobic007G171950 Sobic003G445100--Sobic007G171950 Sobic010G005600 Sobic010G005600 Sobic003G445100--Sobic010G005600 Sobic007G225800 Sobic007G225800 Sobic003G445100--Sobic007G225800 Sobic004G296500 Sobic004G296500 Sobic003G445100--Sobic004G296500 Sobic006G059200 Sobic006G059200 Sobic003G445100--Sobic006G059200 Sobic007G201650 Sobic007G201650 Sobic003G445100--Sobic007G201650 Sobic005G212500 Sobic005G212500 Sobic005G222700--Sobic005G212500 Sobic004G195700 Sobic004G195700 Sobic005G222700--Sobic004G195700 Sobic001G056300 Sobic001G056300 Sobic005G222700--Sobic001G056300 Sobic010G242300 Sobic010G242300 Sobic005G222700--Sobic010G242300 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic005G222700--Sobic005G054600 Sobic004G164650 Sobic004G164650 Sobic005G222700--Sobic004G164650 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic005G222700--Sobic006G132200 Sobic005G054000 Sobic005G054000 Sobic005G222700--Sobic005G054000 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic005G222700--Sobic008G108900 Sobic003G069100--Sobic007G171600 Sobic003G069100--Sobic008G067200 Sobic010G276400 Sobic010G276400 Sobic003G069100--Sobic010G276400 Sobic004G026300 Sobic004G026300 Sobic003G069100--Sobic004G026300 Sobic003G069100--Sobic002G000500 Sobic010G019700 Sobic010G019700 Sobic003G069100--Sobic010G019700 Sobic003G069100--Sobic001G068400 Sobic001G379700 Sobic001G379700 Sobic003G069100--Sobic001G379700 Sobic003G057900 Sobic003G057900 Sobic003G069100--Sobic003G057900 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic006G180432--Sobic003G057800 Sobic006G180432--Sobic001G269300 Sobic007G052900 Sobic007G052900 Sobic006G180432--Sobic007G052900 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic006G180432--Sobic001G479500 Sobic001G497200 Sobic001G497200 Sobic006G180432--Sobic001G497200 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic006G180432--Sobic001G046600 Sobic005G187200 Sobic005G187200 Sobic006G180432--Sobic005G187200 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic006G180432--Sobic004G016500 Sobic006G048775 Sobic006G048775 Sobic006G180432--Sobic006G048775
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.