Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G061800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PKI6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G270200 rhodanese-like domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G254100 expressed protein -
3 Sobic.010G181701 - -
4 Sobic.003G057050 - -
5 Sobic.004G077300 guanine nucleotide exchange family protein, putative, expressed K18442: ARFGEF, brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein
6 Sobic.009G007300 expressed protein -
7 Sobic.008G050900 expressed protein -
8 Sobic.009G113500 expressed protein -
9 Sobic.001G034200 60S ribosomal protein L36-2, putative, expressed K02920: RP-L36e, large subunit ribosomal protein L36e
10 Sobic.008G024100 AT hook motif family protein, expressed -
11 Sobic.005G201501 - -
12 Sobic.010G202800 - -
13 Sobic.010G014850 - -
14 Sobic.009G119600 powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed -
15 Sobic.003G075300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.006G080700 CSLH1 - cellulose synthase-like family H, expressed -
17 Sobic.003G110932 - -
18 Sobic.003G270900 expressed protein -
19 Sobic.010G158050 - -
20 Sobic.004G075250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G061800 Sobic006G061800 Sobic010G270200 Sobic010G270200 Sobic006G061800--Sobic010G270200 Sobic002G254100 Sobic002G254100 Sobic006G061800--Sobic002G254100 Sobic010G181701 Sobic010G181701 Sobic006G061800--Sobic010G181701 Sobic003G057050 Sobic003G057050 Sobic006G061800--Sobic003G057050 Sobic004G077300 Sobic004G077300 Sobic006G061800--Sobic004G077300 Sobic009G007300 Sobic009G007300 Sobic006G061800--Sobic009G007300 Sobic008G050900 Sobic008G050900 Sobic006G061800--Sobic008G050900 Sobic009G113500 Sobic009G113500 Sobic006G061800--Sobic009G113500 Sobic001G034200 Sobic001G034200 Sobic006G061800--Sobic001G034200 Sobic010G270200--Sobic009G007300 Sobic006G080700 Sobic006G080700 Sobic010G270200--Sobic006G080700 Sobic004G008200 Sobic004G008200 Sobic010G270200--Sobic004G008200 Sobic002G180800 Sobic002G180800 Sobic010G270200--Sobic002G180800 Sobic006G132600 Sobic006G132600 Sobic010G270200--Sobic006G132600 Sobic004G134900 Sobic004G134900 Sobic010G270200--Sobic004G134900 Sobic006G166400 Sobic006G166400 Sobic010G270200--Sobic006G166400 Sobic001G225800 Sobic001G225800 Sobic010G270200--Sobic001G225800 Sobic001G367301 Sobic001G367301 Sobic010G270200--Sobic001G367301 Sobic007G196700 Sobic007G196700 Sobic002G254100--Sobic007G196700 Sobic010G114200 Sobic010G114200 Sobic002G254100--Sobic010G114200 Sobic002G254100--Sobic001G225800 Sobic003G014200 Sobic003G014200 Sobic002G254100--Sobic003G014200 Sobic005G207700 Sobic005G207700 Sobic002G254100--Sobic005G207700 Sobic002G166000 Sobic002G166000 Sobic002G254100--Sobic002G166000 Sobic003G110932 Sobic003G110932 Sobic002G254100--Sobic003G110932 Sobic002G073600 Sobic002G073600 Sobic002G254100--Sobic002G073600 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic002G254100--Sobic009G177750 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic010G181701--Sobic001G251000 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic010G181701--Sobic005G200100 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic010G181701--Sobic004G348000 Sobic010G082300 Sobic010G082300 Sobic010G181701--Sobic010G082300 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic010G181701--Sobic009G125100 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic010G181701--Sobic009G176200 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic010G181701--Sobic004G059200 Sobic003G270900 Sobic003G270900 Sobic010G181701--Sobic003G270900 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic010G181701--Sobic010G026200 Sobic002G362500 Sobic002G362500 Sobic003G057050--Sobic002G362500 Sobic007G039200 Sobic007G039200 Sobic003G057050--Sobic007G039200 Sobic004G051600 Sobic004G051600 Sobic003G057050--Sobic004G051600 Sobic002G414800 Sobic002G414800 Sobic003G057050--Sobic002G414800 Sobic008G166100 Sobic008G166100 Sobic003G057050--Sobic008G166100 Sobic003G349900 Sobic003G349900 Sobic003G057050--Sobic003G349900 Sobic009G163100 Sobic009G163100 Sobic003G057050--Sobic009G163100 Sobic008G156600 Sobic008G156600 Sobic003G057050--Sobic008G156600 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic003G057050--Sobic002G389600 Sobic001G149000 Sobic001G149000 Sobic004G077300--Sobic001G149000 Sobic003G385300 Sobic003G385300 Sobic004G077300--Sobic003G385300 Sobic008G152700 Sobic008G152700 Sobic004G077300--Sobic008G152700 Sobic004G176200 Sobic004G176200 Sobic004G077300--Sobic004G176200 Sobic001G378800 Sobic001G378800 Sobic004G077300--Sobic001G378800 Sobic004G077300--Sobic006G080700 Sobic001G384200 Sobic001G384200 Sobic004G077300--Sobic001G384200 Sobic004G350700 Sobic004G350700 Sobic004G077300--Sobic004G350700 Sobic004G077300--Sobic002G180800 Sobic009G007300--Sobic006G080700 Sobic009G007300--Sobic001G225800 Sobic008G078200 Sobic008G078200 Sobic009G007300--Sobic008G078200 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic009G007300--Sobic004G064200 Sobic009G068400 Sobic009G068400 Sobic009G007300--Sobic009G068400 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic009G007300--Sobic007G198900 Sobic010G179600 Sobic010G179600 Sobic009G007300--Sobic010G179600 Sobic002G060000 Sobic002G060000 Sobic009G007300--Sobic002G060000 Sobic009G007300--Sobic010G114200 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic008G050900--Sobic001G039100 Sobic002G176000 Sobic002G176000 Sobic008G050900--Sobic002G176000 Sobic005G074300 Sobic005G074300 Sobic008G050900--Sobic005G074300 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic008G050900--Sobic003G133201 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic008G050900--Sobic005G144000 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic008G050900--Sobic005G201501 Sobic006G070564 Sobic006G070564 Sobic008G050900--Sobic006G070564 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic008G050900--Sobic005G077001 Sobic002G381500 Sobic002G381500 Sobic008G050900--Sobic002G381500 Sobic004G328500 Sobic004G328500 Sobic009G113500--Sobic004G328500 Sobic009G121200 Sobic009G121200 Sobic009G113500--Sobic009G121200 Sobic002G088600 Sobic002G088600 Sobic009G113500--Sobic002G088600 Sobic003G407700 Sobic003G407700 Sobic009G113500--Sobic003G407700 Sobic004G177900 Sobic004G177900 Sobic009G113500--Sobic004G177900 Sobic004G290600 Sobic004G290600 Sobic009G113500--Sobic004G290600 Sobic010G073900 Sobic010G073900 Sobic009G113500--Sobic010G073900 Sobic004G057300 Sobic004G057300 Sobic009G113500--Sobic004G057300 Sobic004G328200 Sobic004G328200 Sobic009G113500--Sobic004G328200 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic001G034200--Sobic002G080450 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic001G034200--Sobic010G266600 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic001G034200--Sobic010G038300 Sobic004G168900 Sobic004G168900 Sobic001G034200--Sobic004G168900 Sobic002G123300 Sobic002G123300 Sobic001G034200--Sobic002G123300 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic001G034200--Sobic010G129450 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic001G034200--Sobic007G063800 Sobic005G202901 Sobic005G202901 Sobic001G034200--Sobic005G202901 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic001G034200--Sobic001G136000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.