Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G050900.1
Synonym Sb08g004290
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YSM5
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g54759.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G039100 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G176000 membrane protein, putative, expressed -
3 Sobic.005G074300 - -
4 Sobic.003G133201 - -
5 Sobic.005G144000 glycosyltransferase, putative, expressed -
6 Sobic.005G201501 - -
7 Sobic.006G070564 - K01193: INV, beta-fructofuranosidase
8 Sobic.005G077001 - -
9 Sobic.002G381500 uncharacterized glycosyl hydrolase Rv2006/MT2062, putative, expressed K01087: trehalose 6-phosphate phosphatase
10 Sobic.002G404600 expressed protein -
11 Sobic.009G110600 OsFBX422 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
13 Sobic.006G170500 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
14 Sobic.002G266500 - -
15 Sobic.002G308900 ubiquitin fusion protein, putative, expressed K02927: RP-L40e, RPL40, ubiquitin-large subunit ribosomal protein L40e
16 Sobic.004G217100 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.007G196700 expressed protein -
18 Sobic.005G110505 - -
19 Sobic.001G357400 emp24/gp25L/p24 family protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G050900 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G050900 Sobic008G050900 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic008G050900--Sobic001G039100 Sobic002G176000 Sobic002G176000 Sobic008G050900--Sobic002G176000 Sobic005G074300 Sobic005G074300 Sobic008G050900--Sobic005G074300 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic008G050900--Sobic003G133201 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic008G050900--Sobic005G144000 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic008G050900--Sobic005G201501 Sobic006G070564 Sobic006G070564 Sobic008G050900--Sobic006G070564 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic008G050900--Sobic005G077001 Sobic002G381500 Sobic002G381500 Sobic008G050900--Sobic002G381500 Sobic002G404600 Sobic002G404600 Sobic001G039100--Sobic002G404600 Sobic007G196700 Sobic007G196700 Sobic001G039100--Sobic007G196700 Sobic001G039100--Sobic002G381500 Sobic002G308900 Sobic002G308900 Sobic001G039100--Sobic002G308900 Sobic009G110600 Sobic009G110600 Sobic001G039100--Sobic009G110600 Sobic006G105100 Sobic006G105100 Sobic001G039100--Sobic006G105100 Sobic002G380300 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Octagon: transcription factors


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