Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G074300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PQR9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G050900 expressed protein -
2 Sobic.001G039100 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.010G129450 - -
4 Sobic.002G381500 uncharacterized glycosyl hydrolase Rv2006/MT2062, putative, expressed K01087: trehalose 6-phosphate phosphatase
5 Sobic.003G133201 - -
6 Sobic.004G217100 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G414650 - K08678: UXS1, UDP-glucuronate decarboxylase
8 Sobic.002G382300 expressed protein -
9 Sobic.006G224400 ubiquitin family protein, putative, expressed K08770: ubiquitin C
K12158: ubiquitin-like protein Nedd8
K04551: ubiquitin B
10 Sobic.002G308900 ubiquitin fusion protein, putative, expressed K02927: RP-L40e, RPL40, ubiquitin-large subunit ribosomal protein L40e
11 Sobic.005G077001 - -
12 Sobic.010G196700 gp176, putative, expressed -
13 Sobic.006G170500 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
14 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
15 Sobic.009G060100 alliin lyase precursor, putative, expressed K16903: L-tryptophan---pyruvate aminotransferase
16 Sobic.009G110600 OsFBX422 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.007G110800 expressed protein -
18 Sobic.002G176000 membrane protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G003300 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -
20 Sobic.002G014300 OsFBX213 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G074300 Sobic005G074300 Sobic008G050900 Sobic008G050900 Sobic005G074300--Sobic008G050900 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic005G074300--Sobic001G039100 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic005G074300--Sobic010G129450 Sobic002G381500 Sobic002G381500 Sobic005G074300--Sobic002G381500 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic005G074300--Sobic003G133201 Sobic004G217100 Sobic004G217100 Sobic005G074300--Sobic004G217100 Sobic001G414650 Sobic001G414650 Sobic005G074300--Sobic001G414650 Sobic002G382300 Sobic002G382300 Sobic005G074300--Sobic002G382300 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic005G074300--Sobic006G224400 Sobic008G050900--Sobic001G039100 Sobic002G176000 Sobic002G176000 Sobic008G050900--Sobic002G176000 Sobic008G050900--Sobic005G074300 Sobic008G050900--Sobic003G133201 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic008G050900--Sobic005G144000 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic008G050900--Sobic005G201501 Sobic006G070564 Sobic006G070564 Sobic008G050900--Sobic006G070564 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic008G050900--Sobic005G077001 Sobic008G050900--Sobic002G381500 Sobic002G404600 Sobic002G404600 Sobic001G039100--Sobic002G404600 Sobic007G196700 Sobic007G196700 Sobic001G039100--Sobic007G196700 Sobic001G039100--Sobic002G381500 Sobic002G308900 Sobic002G308900 Sobic001G039100--Sobic002G308900 Sobic009G110600 Sobic009G110600 Sobic001G039100--Sobic009G110600 Sobic006G105100 Sobic006G105100 Sobic001G039100--Sobic006G105100 Sobic002G380300 Sobic002G380300 Sobic001G039100--Sobic002G380300 Sobic001G039100--Sobic001G414650 Sobic004G290500 Sobic004G290500 Sobic001G039100--Sobic004G290500 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic010G129450--Sobic009G060100 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic010G129450--Sobic001G136000 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic010G129450--Sobic005G058600 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic010G129450--Sobic007G082100 Sobic010G129450--Sobic003G133201 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic010G129450--Sobic003G191200 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic010G129450--Sobic010G123800 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic010G129450--Sobic005G058300 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic010G129450--Sobic007G081100 Sobic002G381500--Sobic002G404600 Sobic007G204200 Sobic007G204200 Sobic002G381500--Sobic007G204200 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic002G381500--Sobic007G197000 Sobic005G037700 Sobic005G037700 Sobic002G381500--Sobic005G037700 Sobic002G381500--Sobic009G110600 Sobic010G121700 Sobic010G121700 Sobic002G381500--Sobic010G121700 Sobic004G192600 Sobic004G192600 Sobic002G381500--Sobic004G192600 Sobic003G004000 Sobic003G004000 Sobic002G381500--Sobic003G004000 Sobic001G089400 Sobic001G089400 Sobic002G381500--Sobic001G089400 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic003G133201--Sobic004G050900 Sobic003G133201--Sobic005G058600 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic003G133201--Sobic009G110333 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic009G182100 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic003G133201--Sobic005G000900 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic003G133201--Sobic002G266500 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic009G047100 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic003G133201--Sobic007G031200 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic003G133201--Sobic006G017700 Sobic004G217100--Sobic006G224400 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic004G217100--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic004G217100--Sobic007G167950 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic004G217100--Sobic004G086900 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic004G217100--Sobic007G110800 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic004G217100--Sobic007G082300 Sobic004G217100--Sobic005G058300 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic004G217100--Sobic007G081800 Sobic004G217100--Sobic010G123800 Sobic001G357400 Sobic001G357400 Sobic001G414650--Sobic001G357400 Sobic001G414650--Sobic002G404600 Sobic008G055200 Sobic008G055200 Sobic001G414650--Sobic008G055200 Sobic001G414650--Sobic002G381500 Sobic007G070900 Sobic007G070900 Sobic001G414650--Sobic007G070900 Sobic001G414650--Sobic006G105100 Sobic004G054900 Sobic004G054900 Sobic001G414650--Sobic004G054900 Sobic001G414650--Sobic009G110600 Sobic001G337100 Sobic001G337100 Sobic001G414650--Sobic001G337100 Sobic006G170500 Sobic006G170500 Sobic002G382300--Sobic006G170500 Sobic002G382300--Sobic004G217100 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic002G382300--Sobic009G047900 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic002G382300--Sobic010G196700 Sobic008G155500 Sobic008G155500 Sobic002G382300--Sobic008G155500 Sobic002G382300--Sobic006G224400 Sobic002G382300--Sobic007G110800 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic002G382300--Sobic007G198900 Sobic002G382300--Sobic004G086900 Sobic006G224400--Sobic005G058300 Sobic006G224400--Sobic007G167950 Sobic006G224400--Sobic007G081800 Sobic006G224400--Sobic005G087732 Sobic006G224400--Sobic007G110800 Sobic006G224400--Sobic010G123800 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic006G224400--Sobic004G046700 Sobic006G224400--Sobic004G086900 Sobic006G224400--Sobic007G082300
Octagon: transcription factors


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