Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G168500.1
Synonym RPS3, RPM1
Functional annotation disease resistance protein RPM1, putative, expressed
UniProt A0A1B6PM90
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF640
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology K13457; RPM1, disease resistance protein RPM1
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G07040 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g46300.1 : disease resistance protein RPM1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G098100.1 , HORVU2Hr1G098100.2 , HORVU2Hr1G098100.3 , HORVU2Hr1G098100.4
Wheat TraesCS2D02G413600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G535500 folylpolyglutamate synthase(PubMedID : 33924915)@folylpolyglutamate synthase, mitochondrial precursor, putative, expressed K01930: folylpolyglutamate synthase
2 Sobic.004G208000 isochorismatase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.005G126900 - -
4 Sobic.008G064750 - -
5 Sobic.004G153800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
6 Sobic.003G344300 - -
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8 Sobic.005G167450 - -
9 Sobic.004G272500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
10 Sobic.003G089700 - -
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12 Sobic.002G275400 - -
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14 Sobic.001G217800 - -
15 Sobic.005G216900 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G412500 - -
17 Sobic.002G165200 - -
18 Sobic.003G097701 - -
19 Sobic.010G111900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@flavin-containing monooxygenase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G140050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G168500 Sobic006G168500 Sobic001G535500 Sobic001G535500 Sobic006G168500--Sobic001G535500 Sobic004G208000 Sobic004G208000 Sobic006G168500--Sobic004G208000 Sobic005G126900 Sobic005G126900 Sobic006G168500--Sobic005G126900 Sobic008G064750 Sobic008G064750 Sobic006G168500--Sobic008G064750 Sobic004G153800 Sobic004G153800 Sobic006G168500--Sobic004G153800 Sobic003G344300 Sobic003G344300 Sobic006G168500--Sobic003G344300 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic006G168500--Sobic003G160400 Sobic005G167450 Sobic005G167450 Sobic006G168500--Sobic005G167450 Sobic004G272500 Sobic004G272500 Sobic006G168500--Sobic004G272500 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic001G535500--Sobic001G217800 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic001G535500--Sobic005G101400 Sobic009G104850 Sobic009G104850 Sobic001G535500--Sobic009G104850 Sobic001G535500--Sobic004G272500 Sobic001G535500--Sobic005G167450 Sobic001G535500--Sobic003G160400 Sobic004G104200 Sobic004G104200 Sobic001G535500--Sobic004G104200 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic001G535500--Sobic005G167100 Sobic003G119750 Sobic003G119750 Sobic001G535500--Sobic003G119750 Sobic004G192001 Sobic004G192001 Sobic004G208000--Sobic004G192001 Sobic001G360300 Sobic001G360300 Sobic004G208000--Sobic001G360300 Sobic004G208000--Sobic008G064750 Sobic004G208000--Sobic005G126900 Sobic004G044401 Sobic004G044401 Sobic004G208000--Sobic004G044401 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic004G208000--Sobic007G099300 Sobic002G275400 Sobic002G275400 Sobic004G208000--Sobic002G275400 Sobic004G208000--Sobic001G217800 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic004G208000--Sobic003G249300 Sobic005G126900--Sobic004G044401 Sobic005G126900--Sobic005G101400 Sobic005G126900--Sobic004G272500 Sobic005G126900--Sobic005G167450 Sobic005G126900--Sobic001G217800 Sobic007G085966 Sobic007G085966 Sobic005G126900--Sobic007G085966 Sobic003G166400 Sobic003G166400 Sobic005G126900--Sobic003G166400 Sobic001G118600 Sobic001G118600 Sobic005G126900--Sobic001G118600 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic005G126900--Sobic009G069450 Sobic008G064750--Sobic004G208000 Sobic010G111900 Sobic010G111900 Sobic008G064750--Sobic010G111900 Sobic005G044900 Sobic005G044900 Sobic008G064750--Sobic005G044900 Sobic008G064750--Sobic005G167450 Sobic008G064750--Sobic003G249300 Sobic004G125600 Sobic004G125600 Sobic008G064750--Sobic004G125600 Sobic008G064750--Sobic005G126900 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic008G064750--Sobic001G302100 Sobic008G064750--Sobic001G217800 Sobic006G243900 Sobic006G243900 Sobic004G153800--Sobic006G243900 Sobic004G153800--Sobic004G208000 Sobic004G153800--Sobic003G249300 Sobic001G523932 Sobic001G523932 Sobic004G153800--Sobic001G523932 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic004G153800--Sobic001G540250 Sobic004G153800--Sobic002G275400 Sobic004G153800--Sobic005G101400 Sobic004G153800--Sobic001G217800 Sobic003G339300 Sobic003G339300 Sobic004G153800--Sobic003G339300 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic003G344300--Sobic003G168800 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G344300--Sobic002G165200 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic003G344300--Sobic004G019550 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic003G344300--Sobic010G035600 Sobic003G344300--Sobic003G119750 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic003G344300--Sobic001G154000 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic003G344300--Sobic010G185250 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic003G344300--Sobic001G293900 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic003G344300--Sobic006G192600 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic003G160400--Sobic007G085900 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic003G160400--Sobic005G216900 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic003G160400--Sobic003G160300 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic003G160400--Sobic003G160433 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic003G160400--Sobic001G128000 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic003G160400--Sobic001G054050 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic003G160400--Sobic002G390200 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic003G160400--Sobic008G140050 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic003G160400--Sobic006G057100 Sobic005G167450--Sobic001G217800 Sobic005G167450--Sobic005G101400 Sobic005G167450--Sobic009G104850 Sobic005G167450--Sobic003G249300 Sobic005G167450--Sobic004G272500 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic005G167450--Sobic010G225400 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic005G167450--Sobic004G234766 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic005G167450--Sobic010G107901 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic005G167450--Sobic006G093550 Sobic004G272500--Sobic009G104850 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic004G272500--Sobic008G160300 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic004G272500--Sobic010G107601 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic004G272500--Sobic004G337600 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic004G272500--Sobic003G172400 Sobic005G096500 Sobic005G096500 Sobic004G272500--Sobic005G096500 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic004G272500--Sobic003G169400 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic004G272500--Sobic003G168500 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic004G272500--Sobic003G171900
Octagon: transcription factors


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