Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G247700.1
Synonym Sb06g031290, SPL8, SbSBP12;liguleless1, lg1
Functional annotation Highest expression level in primordial inflorescence (PubMedID : 27501690)
- (PubMedID : 23108465)
OsSPL8 - SBP-box gene family member, expressed
UniProt I2AW88 , C5Y9I5
Pfam PF03110
Panther DB PTHR31251 PTHR31251:SF17
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005634; nucleus GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G02065 : squamosa promoter binding protein-like 8
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g56170.1 : OsSPL8 - SBP-box gene family member, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057255 , Zm00025a009466 , Zm00025a046113
Brachypodium KQJ85066
Barley -
Wheat TraesCS2A02G502300 , TraesCS2B02G530400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.006G237800 jp18, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G247700 Sobic006G247700 Sobic005G029700 Sobic005G029700 Sobic006G247700--Sobic005G029700 Sobic001G228100 Sobic001G228100 Sobic006G247700--Sobic001G228100 Sobic002G072700 Sobic002G072700 Sobic006G247700--Sobic002G072700 Sobic002G139800 Sobic002G139800 Sobic006G247700--Sobic002G139800 Sobic009G037300 Sobic009G037300 Sobic006G247700--Sobic009G037300 Sobic009G254500 Sobic009G254500 Sobic006G247700--Sobic009G254500 Sobic006G181600 Sobic006G181600 Sobic006G247700--Sobic006G181600 Sobic007G189400 Sobic007G189400 Sobic006G247700--Sobic007G189400 Sobic005G110900 Sobic005G110900 Sobic006G247700--Sobic005G110900 Sobic005G029700--Sobic001G228100 Sobic005G029700--Sobic006G247700 Sobic005G029700--Sobic002G072700 Sobic005G029700--Sobic007G189400 Sobic001G221900 Sobic001G221900 Sobic005G029700--Sobic001G221900 Sobic005G204100 Sobic005G204100 Sobic005G029700--Sobic005G204100 Sobic003G339600 Sobic003G339600 Sobic005G029700--Sobic003G339600 Sobic007G142900 Sobic007G142900 Sobic005G029700--Sobic007G142900 Sobic002G315000 Sobic002G315000 Sobic005G029700--Sobic002G315000 Sobic001G228100--Sobic005G029700 Sobic001G228100--Sobic002G072700 Sobic001G228100--Sobic006G247700 Sobic001G228100--Sobic009G037300 Sobic001G228100--Sobic001G221900 Sobic001G228100--Sobic007G189400 Sobic001G228100--Sobic009G254500 Sobic001G228100--Sobic003G339600 Sobic010G027700 Sobic010G027700 Sobic001G228100--Sobic010G027700 Sobic002G072700--Sobic007G189400 Sobic002G072700--Sobic001G228100 Sobic002G072700--Sobic005G029700 Sobic002G072700--Sobic005G204100 Sobic002G072700--Sobic002G139800 Sobic002G072700--Sobic007G142900 Sobic002G072700--Sobic001G221900 Sobic009G259500 Sobic009G259500 Sobic002G072700--Sobic009G259500 Sobic002G072700--Sobic006G247700 Sobic001G438500 Sobic001G438500 Sobic002G139800--Sobic001G438500 Sobic004G062100 Sobic004G062100 Sobic002G139800--Sobic004G062100 Sobic002G139800--Sobic009G254500 Sobic002G011000 Sobic002G011000 Sobic002G139800--Sobic002G011000 Sobic002G139800--Sobic007G189400 Sobic008G187400 Sobic008G187400 Sobic002G139800--Sobic008G187400 Sobic002G067500 Sobic002G067500 Sobic002G139800--Sobic002G067500 Sobic002G139800--Sobic002G072700 Sobic009G141300 Sobic009G141300 Sobic002G139800--Sobic009G141300 Sobic002G183800 Sobic002G183800 Sobic009G037300--Sobic002G183800 Sobic009G037300--Sobic010G027700 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic009G037300--Sobic008G012600 Sobic002G023700 Sobic002G023700 Sobic009G037300--Sobic002G023700 Sobic009G037300--Sobic005G110900 Sobic003G120600 Sobic003G120600 Sobic009G037300--Sobic003G120600 Sobic007G125400 Sobic007G125400 Sobic009G037300--Sobic007G125400 Sobic009G037300--Sobic009G254500 Sobic001G266100 Sobic001G266100 Sobic009G037300--Sobic001G266100 Sobic009G254500--Sobic002G011000 Sobic009G254500--Sobic008G012600 Sobic009G254500--Sobic009G141300 Sobic001G119200 Sobic001G119200 Sobic009G254500--Sobic001G119200 Sobic009G254500--Sobic001G438500 Sobic006G160800 Sobic006G160800 Sobic009G254500--Sobic006G160800 Sobic010G077700 Sobic010G077700 Sobic009G254500--Sobic010G077700 Sobic009G254500--Sobic004G062100 Sobic003G300400 Sobic003G300400 Sobic009G254500--Sobic003G300400 Sobic006G181600--Sobic002G139800 Sobic006G181600--Sobic007G189400 Sobic006G181600--Sobic001G228100 Sobic006G181600--Sobic002G072700 Sobic006G181600--Sobic009G254500 Sobic006G181600--Sobic006G247700 Sobic006G181600--Sobic001G438500 Sobic006G181600--Sobic009G141300 Sobic005G188500 Sobic005G188500 Sobic006G181600--Sobic005G188500 Sobic007G189400--Sobic002G072700 Sobic007G189400--Sobic005G188500 Sobic007G189400--Sobic009G254500 Sobic007G189400--Sobic003G339600 Sobic001G488400 Sobic001G488400 Sobic007G189400--Sobic001G488400 Sobic010G020600 Sobic010G020600 Sobic007G189400--Sobic010G020600 Sobic006G044200 Sobic006G044200 Sobic007G189400--Sobic006G044200 Sobic007G189400--Sobic001G119200 Sobic007G189400--Sobic002G139800 Sobic005G110900--Sobic008G012600 Sobic005G110900--Sobic001G266100 Sobic003G382400 Sobic003G382400 Sobic005G110900--Sobic003G382400 Sobic002G353100 Sobic002G353100 Sobic005G110900--Sobic002G353100 Sobic005G218000 Sobic005G218000 Sobic005G110900--Sobic005G218000 Sobic005G110900--Sobic006G160800 Sobic006G005800 Sobic006G005800 Sobic005G110900--Sobic006G005800 Sobic003G090650 Sobic003G090650 Sobic005G110900--Sobic003G090650 Sobic005G110900--Sobic002G183800
Octagon: transcription factors


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