Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G002000.1
Synonym Sb07g000380
Functional annotation heavy metal-associated domain containing protein, expressed
UniProt C5YLD8
Pfam PF00403
Panther DB PTHR22814 PTHR22814:SF47
NCBI CDD KOG1603; Copper chaperone
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71050 : Heavy metal transport/detoxification superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g32330.1 : heavy metal-associated domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040123 , Zm00025a033668
Brachypodium KQJ93393 , PNT65918
Barley HORVU3Hr1G049780.1 , HORVU3Hr1G049780.2 , HORVU2Hr1G071080.19
Wheat TraesCS2A02G287200 , TraesCS2D02G285700 , TraesCS5B02G242000 , TraesCS5D02G250700 , TraesCS3A02G206100 , TraesCS2B02G304100 , TraesCS5A02G244000 , TraesCS3D02G209500 , TraesCS3B02G238100
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cDNA sequences
Sobic.007G002000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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10 Sobic.007G129100 - -
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20 Sobic.K010000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G002000 Sobic007G002000 Sobic009G085400 Sobic009G085400 Sobic007G002000--Sobic009G085400 Sobic003G416100 Sobic003G416100 Sobic007G002000--Sobic003G416100 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic007G002000--Sobic008G125600 Sobic009G103600 Sobic009G103600 Sobic007G002000--Sobic009G103600 Sobic010G248600 Sobic010G248600 Sobic007G002000--Sobic010G248600 Sobic003G185100 Sobic003G185100 Sobic007G002000--Sobic003G185100 Sobic009G197000 Sobic009G197000 Sobic007G002000--Sobic009G197000 Sobic002G114700 Sobic002G114700 Sobic007G002000--Sobic002G114700 Sobic008G118000 Sobic008G118000 Sobic007G002000--Sobic008G118000 Sobic009G085400--Sobic003G416100 Sobic009G085400--Sobic010G248600 Sobic006G214400 Sobic006G214400 Sobic009G085400--Sobic006G214400 Sobic009G085400--Sobic002G114700 Sobic003G106200 Sobic003G106200 Sobic009G085400--Sobic003G106200 Sobic005G046500 Sobic005G046500 Sobic009G085400--Sobic005G046500 Sobic004G035000 Sobic004G035000 Sobic009G085400--Sobic004G035000 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Octagon: transcription factors


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