Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G151700.2
Synonym Sb07g022560
Functional annotation plant viral response family protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RA16
Pfam PF04819
Panther DB PTHR16007 PTHR16007:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G49470 : Family of unknown function (DUF716)
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g36040.1 : plant viral response family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G227900 STIGL3 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, putative, expressed -
2 Sobic.K044402 - -
3 Sobic.004G041600 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed -
4 Sobic.008G076700 protein kinase, putative, expressed -
5 Sobic.007G055400 expressed protein -
6 Sobic.002G185400 transporter-related, putative, expressed -
7 Sobic.009G215700 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@late embryogenesis abundant protein, group 3, putative, expressed -
8 Sobic.010G170150 - -
9 Sobic.008G085600 - -
10 Sobic.006G118500 OsFBDUF36 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
11 Sobic.009G052901 - -
12 Sobic.005G129748 - -
13 Sobic.003G015700 endoglucanase precursor, putative, expressed -
14 Sobic.006G112900 heavy metal transport/detoxification protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G492000 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@embryonic protein DC-8, putative, expressed -
16 Sobic.010G158601 - -
17 Sobic.001G075300 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
18 Sobic.007G088300 late embryogenesis abundant group 1, putative, expressed -
19 Sobic.009G168700 ammonium transporter protein, putative, expressed K03320: amt, AMT, ammonium transporter, Amt family
20 Sobic.006G138966 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G151700 Sobic007G151700 Sobic005G227900 Sobic005G227900 Sobic007G151700--Sobic005G227900 SobicK044402 SobicK044402 Sobic007G151700--SobicK044402 Sobic004G041600 Sobic004G041600 Sobic007G151700--Sobic004G041600 Sobic008G076700 Sobic008G076700 Sobic007G151700--Sobic008G076700 Sobic007G055400 Sobic007G055400 Sobic007G151700--Sobic007G055400 Sobic002G185400 Sobic002G185400 Sobic007G151700--Sobic002G185400 Sobic009G215700 Sobic009G215700 Sobic007G151700--Sobic009G215700 Sobic010G170150 Sobic010G170150 Sobic007G151700--Sobic010G170150 Sobic008G085600 Sobic008G085600 Sobic007G151700--Sobic008G085600 Sobic005G227900--Sobic004G041600 Sobic005G227900--SobicK044402 Sobic003G015700 Sobic003G015700 Sobic005G227900--Sobic003G015700 Sobic008G014601 Sobic008G014601 Sobic005G227900--Sobic008G014601 Sobic005G227900--Sobic007G055400 Sobic007G115600 Sobic007G115600 Sobic005G227900--Sobic007G115600 Sobic001G423900 Sobic001G423900 Sobic005G227900--Sobic001G423900 Sobic007G176300 Sobic007G176300 Sobic005G227900--Sobic007G176300 Sobic002G342901 Sobic002G342901 Sobic005G227900--Sobic002G342901 SobicK044402--Sobic007G055400 Sobic009G227650 Sobic009G227650 SobicK044402--Sobic009G227650 SobicK044402--Sobic005G227900 Sobic010G158601 Sobic010G158601 SobicK044402--Sobic010G158601 SobicK044402--Sobic008G085600 SobicK044402--Sobic002G185400 Sobic003G363600 Sobic003G363600 SobicK044402--Sobic003G363600 Sobic010G262650 Sobic010G262650 SobicK044402--Sobic010G262650 Sobic004G067850 Sobic004G067850 SobicK044402--Sobic004G067850 Sobic004G041600--Sobic005G227900 Sobic004G041600--Sobic003G015700 Sobic004G041600--Sobic010G170150 Sobic004G041600--Sobic007G151700 Sobic004G041600--SobicK044402 Sobic002G373700 Sobic002G373700 Sobic004G041600--Sobic002G373700 Sobic004G041600--Sobic003G363600 Sobic004G041600--Sobic008G014601 Sobic004G041600--Sobic007G115600 Sobic008G076700--Sobic010G170150 Sobic001G075300 Sobic001G075300 Sobic008G076700--Sobic001G075300 Sobic004G029300 Sobic004G029300 Sobic008G076700--Sobic004G029300 Sobic009G150600 Sobic009G150600 Sobic008G076700--Sobic009G150600 Sobic002G334200 Sobic002G334200 Sobic008G076700--Sobic002G334200 Sobic010G082100 Sobic010G082100 Sobic008G076700--Sobic010G082100 Sobic001G396700 Sobic001G396700 Sobic008G076700--Sobic001G396700 Sobic007G021800 Sobic007G021800 Sobic008G076700--Sobic007G021800 Sobic001G349200 Sobic001G349200 Sobic008G076700--Sobic001G349200 Sobic007G055400--SobicK044402 Sobic003G143401 Sobic003G143401 Sobic007G055400--Sobic003G143401 Sobic007G055400--Sobic004G067850 Sobic008G032850 Sobic008G032850 Sobic007G055400--Sobic008G032850 Sobic001G001132 Sobic001G001132 Sobic007G055400--Sobic001G001132 Sobic007G055400--Sobic009G227650 Sobic007G055400--Sobic008G085600 Sobic007G055400--Sobic010G262650 Sobic007G055400--Sobic010G158601 Sobic001G084200 Sobic001G084200 Sobic002G185400--Sobic001G084200 Sobic002G185400--Sobic001G001132 Sobic009G168700 Sobic009G168700 Sobic002G185400--Sobic009G168700 Sobic006G138966 Sobic006G138966 Sobic002G185400--Sobic006G138966 Sobic005G073101 Sobic005G073101 Sobic002G185400--Sobic005G073101 Sobic001G192750 Sobic001G192750 Sobic002G185400--Sobic001G192750 Sobic002G185400--Sobic004G067850 Sobic002G185400--Sobic008G032850 Sobic002G342200 Sobic002G342200 Sobic002G185400--Sobic002G342200 Sobic001G492000 Sobic001G492000 Sobic009G215700--Sobic001G492000 Sobic002G151200 Sobic002G151200 Sobic009G215700--Sobic002G151200 Sobic001G109000 Sobic001G109000 Sobic009G215700--Sobic001G109000 Sobic006G269501 Sobic006G269501 Sobic009G215700--Sobic006G269501 Sobic001G354800 Sobic001G354800 Sobic009G215700--Sobic001G354800 Sobic001G200700 Sobic001G200700 Sobic009G215700--Sobic001G200700 Sobic002G132500 Sobic002G132500 Sobic009G215700--Sobic002G132500 Sobic006G118500 Sobic006G118500 Sobic009G215700--Sobic006G118500 Sobic006G104000 Sobic006G104000 Sobic009G215700--Sobic006G104000 Sobic010G170150--Sobic001G075300 Sobic010G170150--Sobic010G082100 Sobic010G170150--Sobic008G076700 Sobic010G170150--Sobic009G150600 Sobic010G170150--Sobic001G349200 Sobic001G348200 Sobic001G348200 Sobic010G170150--Sobic001G348200 Sobic010G170150--Sobic001G396700 Sobic010G170150--Sobic002G373700 Sobic006G209000 Sobic006G209000 Sobic010G170150--Sobic006G209000 Sobic008G085600--Sobic002G342200 Sobic009G066850 Sobic009G066850 Sobic008G085600--Sobic009G066850 Sobic009G147100 Sobic009G147100 Sobic008G085600--Sobic009G147100 Sobic004G048600 Sobic004G048600 Sobic008G085600--Sobic004G048600 Sobic003G291050 Sobic003G291050 Sobic008G085600--Sobic003G291050 Sobic002G302400 Sobic002G302400 Sobic008G085600--Sobic002G302400 Sobic008G085600--Sobic010G158601 Sobic008G085600--Sobic010G262650 Sobic007G100275 Sobic007G100275 Sobic008G085600--Sobic007G100275
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.