Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G164900.1
Synonym Sb07g023803
Functional annotation AP2 domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PI59
Pfam PF00847
Panther DB PTHR31190 PTHR31190:SF33
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G23230 : Integrase-type DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g44960.1 : AP2 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028188 , Zm00025a057002 , Zm00025a008746 , Zm00025a009843
Brachypodium PNT61818 , PNT62439 , KQJ86112
Barley HORVU0Hr1G010370.1 , HORVU0Hr1G010370.3 , HORVU0Hr1G010370.2 , HORVU5Hr1G017540.1 , HORVU4Hr1G013410.1 , HORVU5Hr1G018720.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.004G094900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G164900 Sobic007G164900 Sobic002G403966 Sobic002G403966 Sobic007G164900--Sobic002G403966 Sobic001G187400 Sobic001G187400 Sobic007G164900--Sobic001G187400 Sobic008G112900 Sobic008G112900 Sobic007G164900--Sobic008G112900 Sobic002G403833 Sobic002G403833 Sobic007G164900--Sobic002G403833 Sobic001G505700 Sobic001G505700 Sobic007G164900--Sobic001G505700 Sobic002G254000 Sobic002G254000 Sobic007G164900--Sobic002G254000 Sobic002G369301 Sobic002G369301 Sobic007G164900--Sobic002G369301 Sobic001G183401 Sobic001G183401 Sobic007G164900--Sobic001G183401 Sobic009G123733 Sobic009G123733 Sobic007G164900--Sobic009G123733 Sobic002G403966--Sobic002G403833 Sobic002G403966--Sobic002G254000 Sobic007G039500 Sobic007G039500 Sobic002G403966--Sobic007G039500 Sobic004G094900 Sobic004G094900 Sobic002G403966--Sobic004G094900 Sobic006G053900 Sobic006G053900 Sobic002G403966--Sobic006G053900 Sobic001G381400 Sobic001G381400 Sobic002G403966--Sobic001G381400 Sobic002G390000 Sobic002G390000 Sobic002G403966--Sobic002G390000 Sobic002G403966--Sobic008G112900 Sobic005G171001 Sobic005G171001 Sobic002G403966--Sobic005G171001 Sobic001G187500 Sobic001G187500 Sobic001G187400--Sobic001G187500 Sobic001G187400--Sobic002G369301 Sobic003G370600 Sobic003G370600 Sobic001G187400--Sobic003G370600 Sobic002G388800 Sobic002G388800 Sobic001G187400--Sobic002G388800 Sobic004G092800 Sobic004G092800 Sobic001G187400--Sobic004G092800 Sobic001G232500 Sobic001G232500 Sobic001G187400--Sobic001G232500 Sobic001G187400--Sobic007G039500 Sobic006G170000 Sobic006G170000 Sobic001G187400--Sobic006G170000 Sobic001G187400--Sobic009G123733 Sobic004G135000 Sobic004G135000 Sobic008G112900--Sobic004G135000 Sobic001G197300 Sobic001G197300 Sobic008G112900--Sobic001G197300 Sobic007G100032 Sobic007G100032 Sobic008G112900--Sobic007G100032 Sobic008G112900--Sobic004G094900 Sobic008G112900--Sobic002G403966 Sobic001G065900 Sobic001G065900 Sobic008G112900--Sobic001G065900 Sobic006G063400 Sobic006G063400 Sobic008G112900--Sobic006G063400 Sobic008G112900--Sobic001G381400 Sobic010G136400 Sobic010G136400 Sobic008G112900--Sobic010G136400 Sobic002G403833--Sobic002G403966 Sobic002G403833--Sobic007G039500 Sobic002G403833--Sobic002G254000 Sobic002G403833--Sobic006G053900 Sobic002G403833--Sobic004G094900 Sobic002G403833--Sobic001G381400 Sobic002G403833--Sobic002G390000 Sobic002G403833--Sobic005G171001 Sobic002G403833--Sobic001G187400 Sobic004G247700 Sobic004G247700 Sobic001G505700--Sobic004G247700 Sobic004G247500 Sobic004G247500 Sobic001G505700--Sobic004G247500 Sobic001G482800 Sobic001G482800 Sobic001G505700--Sobic001G482800 Sobic007G219500 Sobic007G219500 Sobic001G505700--Sobic007G219500 Sobic010G216400 Sobic010G216400 Sobic001G505700--Sobic010G216400 Sobic004G127000 Sobic004G127000 Sobic001G505700--Sobic004G127000 Sobic008G188400 Sobic008G188400 Sobic001G505700--Sobic008G188400 Sobic001G365700 Sobic001G365700 Sobic001G505700--Sobic001G365700 Sobic002G113200 Sobic002G113200 Sobic001G505700--Sobic002G113200 Sobic002G254000--Sobic002G403833 Sobic002G254000--Sobic002G403966 Sobic002G254000--Sobic007G039500 Sobic002G254000--Sobic006G053900 Sobic002G254000--Sobic004G094900 Sobic002G254000--Sobic001G197300 Sobic002G254000--Sobic008G112900 Sobic002G254000--Sobic001G187400 Sobic002G254000--Sobic001G381400 Sobic002G369301--Sobic001G187400 Sobic002G369301--Sobic004G092800 Sobic002G369301--Sobic003G370600 Sobic002G369301--Sobic006G170000 Sobic002G369301--Sobic001G232500 Sobic001G279701 Sobic001G279701 Sobic002G369301--Sobic001G279701 Sobic002G369301--Sobic001G187500 Sobic001G425500 Sobic001G425500 Sobic002G369301--Sobic001G425500 Sobic004G352000 Sobic004G352000 Sobic002G369301--Sobic004G352000 Sobic001G183401--Sobic008G112900 Sobic008G170100 Sobic008G170100 Sobic001G183401--Sobic008G170100 Sobic003G082200 Sobic003G082200 Sobic001G183401--Sobic003G082200 Sobic003G082100 Sobic003G082100 Sobic001G183401--Sobic003G082100 Sobic001G183401--Sobic007G164900 Sobic007G030400 Sobic007G030400 Sobic001G183401--Sobic007G030400 Sobic005G050032 Sobic005G050032 Sobic001G183401--Sobic005G050032 Sobic002G247900 Sobic002G247900 Sobic001G183401--Sobic002G247900 Sobic003G376300 Sobic003G376300 Sobic001G183401--Sobic003G376300 Sobic009G123733--Sobic004G092800 Sobic004G251800 Sobic004G251800 Sobic009G123733--Sobic004G251800 Sobic009G123733--Sobic001G187400 Sobic009G123733--Sobic005G050032 Sobic004G263100 Sobic004G263100 Sobic009G123733--Sobic004G263100 Sobic009G123733--Sobic002G388800 Sobic005G013400 Sobic005G013400 Sobic009G123733--Sobic005G013400 Sobic009G123733--Sobic002G390000 Sobic008G079500 Sobic008G079500 Sobic009G123733--Sobic008G079500
Octagon: transcription factors


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