Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G221700.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RB53
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G55820 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g38310.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G204400 kinesin motor protein-related, putative, expressed K11498: centromeric protein E
2 Sobic.004G306100 expressed protein -
3 Sobic.003G393100 chromosome segregation protein, putative, expressed K06674: structural maintenance of chromosome 2
4 Sobic.002G271400 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G021200 expressed protein K19001: HELLS, ATP-dependent DNA helicase
6 Sobic.003G315700 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G173400 expressed protein -
8 Sobic.003G411700 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
9 Sobic.008G148000 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10400: kinesin family member 15
10 Sobic.002G123600 expressed protein -
11 Sobic.009G158900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
12 Sobic.008G004900 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@expressed protein -
13 Sobic.008G131900 Candidate orthologue to the genomic region of wheat Hessian fy resistance gene H32(PubMedID : 28624908)@resistance protein LR10, putative, expressed -
14 Sobic.001G212600 a_IG002N01.7, putative, expressed -
15 Sobic.006G193100 zinc finger family protein, putative, expressed K18932: palmitoyltransferase
16 Sobic.001G377700 expressed protein K10895: fanconi anemia group I protein
17 Sobic.010G222800 expressed protein -
18 Sobic.002G290000 helicase, putative, expressed K15362: BRIP1, BACH1, fanconi anemia group J protein
19 Sobic.009G202801 - K10406: kinesin family member C2/C3
20 Sobic.007G121600 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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