Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G035000.1
Synonym Sb08g003030
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt C5YRQ2
Pfam PF13639
Panther DB PTHR22763
NCBI CDD KOG1493; Anaphase-promoting complex (APC), subunit 11
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G60820 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g05270.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G383600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G035000 Sobic008G035000 Sobic005G068600 Sobic005G068600 Sobic008G035000--Sobic005G068600 Sobic006G209200 Sobic006G209200 Sobic008G035000--Sobic006G209200 Sobic003G252750 Sobic003G252750 Sobic008G035000--Sobic003G252750 Sobic001G173251 Sobic001G173251 Sobic008G035000--Sobic001G173251 Sobic003G251050 Sobic003G251050 Sobic008G035000--Sobic003G251050 Sobic002G071700 Sobic002G071700 Sobic008G035000--Sobic002G071700 Sobic010G048933 Sobic010G048933 Sobic008G035000--Sobic010G048933 Sobic003G383400 Sobic003G383400 Sobic008G035000--Sobic003G383400 Sobic002G363466 Sobic002G363466 Sobic008G035000--Sobic002G363466 Sobic005G068600--Sobic002G363466 Sobic005G068600--Sobic008G035000 Sobic005G068600--Sobic006G209200 Sobic005G068600--Sobic003G252750 Sobic004G121500 Sobic004G121500 Sobic005G068600--Sobic004G121500 Sobic010G092550 Sobic010G092550 Sobic005G068600--Sobic010G092550 Sobic002G417101 Sobic002G417101 Sobic005G068600--Sobic002G417101 Sobic002G175000 Sobic002G175000 Sobic005G068600--Sobic002G175000 Sobic005G068600--Sobic001G173251 Sobic006G209200--Sobic001G173251 Sobic004G093300 Sobic004G093300 Sobic006G209200--Sobic004G093300 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic006G209200--Sobic003G095301 Sobic006G209200--Sobic002G363466 Sobic001G476201 Sobic001G476201 Sobic006G209200--Sobic001G476201 Sobic003G123800 Sobic003G123800 Sobic006G209200--Sobic003G123800 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic006G209200--Sobic005G120466 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic006G209200--Sobic001G328850 Sobic009G185601 Sobic009G185601 Sobic006G209200--Sobic009G185601 Sobic003G252750--Sobic010G092550 Sobic003G252750--Sobic002G363466 Sobic003G252750--Sobic002G417101 Sobic003G095750 Sobic003G095750 Sobic003G252750--Sobic003G095750 Sobic001G020900 Sobic001G020900 Sobic003G252750--Sobic001G020900 Sobic003G252750--Sobic003G095301 Sobic003G252750--Sobic005G068600 Sobic003G252750--Sobic004G121500 Sobic002G400050 Sobic002G400050 Sobic003G252750--Sobic002G400050 Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic001G173251--Sobic007G086400 Sobic001G173251--Sobic006G209200 Sobic005G144900 Sobic005G144900 Sobic001G173251--Sobic005G144900 Sobic001G173251--Sobic003G095301 Sobic006G113100 Sobic006G113100 Sobic001G173251--Sobic006G113100 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic001G173251--Sobic004G123801 Sobic001G173251--Sobic005G120466 Sobic001G173251--Sobic004G121500 Sobic001G173251--Sobic002G363466 Sobic003G251050--Sobic005G144900 Sobic002G064450 Sobic002G064450 Sobic003G251050--Sobic002G064450 Sobic010G141700 Sobic010G141700 Sobic003G251050--Sobic010G141700 Sobic003G408700 Sobic003G408700 Sobic003G251050--Sobic003G408700 Sobic004G254200 Sobic004G254200 Sobic003G251050--Sobic004G254200 Sobic004G171350 Sobic004G171350 Sobic003G251050--Sobic004G171350 Sobic001G507933 Sobic001G507933 Sobic003G251050--Sobic001G507933 Sobic003G053001 Sobic003G053001 Sobic003G251050--Sobic003G053001 Sobic004G098650 Sobic004G098650 Sobic003G251050--Sobic004G098650 Sobic007G044000 Sobic007G044000 Sobic002G071700--Sobic007G044000 Sobic008G148900 Sobic008G148900 Sobic002G071700--Sobic008G148900 Sobic002G071700--Sobic010G048933 Sobic002G071700--Sobic010G141700 Sobic002G071700--Sobic003G408700 Sobic002G071700--Sobic004G254200 Sobic002G071700--Sobic001G507933 Sobic008G177700 Sobic008G177700 Sobic002G071700--Sobic008G177700 Sobic004G294000 Sobic004G294000 Sobic002G071700--Sobic004G294000 Sobic010G048933--Sobic004G294000 Sobic010G048933--Sobic007G044000 Sobic010G048933--Sobic002G071700 Sobic010G048933--Sobic010G141700 Sobic010G048933--Sobic003G408700 Sobic010G048933--Sobic004G254200 Sobic005G208801 Sobic005G208801 Sobic010G048933--Sobic005G208801 Sobic010G048933--Sobic008G148900 Sobic010G048933--Sobic001G507933 Sobic007G122866 Sobic007G122866 Sobic003G383400--Sobic007G122866 Sobic003G299100 Sobic003G299100 Sobic003G383400--Sobic003G299100 Sobic003G383400--Sobic003G252750 Sobic003G383400--Sobic005G068600 Sobic003G043550 Sobic003G043550 Sobic003G383400--Sobic003G043550 Sobic002G242100 Sobic002G242100 Sobic003G383400--Sobic002G242100 Sobic003G383400--Sobic002G363466 Sobic003G383400--Sobic001G020900 Sobic003G383400--Sobic008G035000 Sobic002G363466--Sobic006G209200 Sobic002G363466--Sobic001G173251 Sobic002G363466--Sobic003G095301 Sobic002G363466--Sobic004G093300 Sobic002G363466--Sobic010G092550 Sobic009G158200 Sobic009G158200 Sobic002G363466--Sobic009G158200 Sobic002G363466--Sobic002G175000 Sobic002G363466--Sobic004G121500 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic002G363466--Sobic007G181801
Octagon: transcription factors


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