Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G061601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5YT71
Pfam PF00249 PF01266
Panther DB PTHR13847 PTHR13847:SF184
NCBI CDD -
KEGG Orthology K11111; TERF2, telomeric repeat-binding factor 2
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G22650 : FAD-dependent oxidoreductase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g08290.1 : MYB family transcription factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041691 , Zm00025a015410 , Zm00025a041082 , Zm00025a049800
Brachypodium KQK19305 , PNT76377
Barley -
Wheat TraesCS7B02G047400 , TraesCS7A02G145200 , TraesCS7D02G146500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G010600 peroxidase precursor, putative, expressed -
2 Sobic.009G241966 - -
3 Sobic.001G490700 pentatricopeptide, putative, expressed -
4 Sobic.001G181900 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
5 Sobic.009G109101 - -
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9 Sobic.001G408500 alpha-taxilin, putative, expressed -
10 Sobic.009G196700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
11 Sobic.002G050500 type I inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase, putative, expressed -
12 Sobic.010G208500 - -
13 Sobic.002G094500 cytochrome P450, putative, expressed -
14 Sobic.005G203400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
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17 Sobic.009G026400 - -
18 Sobic.006G213200 expressed protein -
19 Sobic.007G029600 expressed protein -
20 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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