Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G032550.1,Sobic.001G032550.3,Sobic.001G032550.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S4G8 , A0A1Z5S464
Pfam -
Panther DB PTHR13068 PTHR13068:SF17
NCBI CDD -
KEGG Orthology K15032; mTERF domain-containing protein, mitochondrial
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G07900 : Mitochondrial transcription termination factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g14130.1,LOC_Os11g10000.1 : mTERF family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008814 , Zm00025a008824
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2B02G093600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G306500 SNF7 domain containing protein, putative, expressed K12194: CHMP4, SNF7, charged multivesicular body protein 4
2 Sobic.003G124000 DNA methyltransferase protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G181400 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K13175: THO complex subunit 6
4 Sobic.009G166400 MCM8 - Putative minichromosome maintenance MCM family subunit 8, expressed K10737: DNA helicase MCM8
5 Sobic.003G107000 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
6 Sobic.009G166650 - -
7 Sobic.006G234500 OsFBD10 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
8 Sobic.009G241966 - -
9 Sobic.003G202700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
10 Sobic.001G221601 - -
11 Sobic.004G208800 expressed protein -
12 Sobic.009G118500 zinc finger protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G051900 high level expression during drought stress(PubMedID : 27006630)@RHsf 5(PubMedID : 27006630)@heat stress transcription factor, putative, expressed K09419: heat shock transcription factor, other eukaryote
14 Sobic.002G326900 expressed protein K16584: HAUS augmin-like complex subunit 1
15 Sobic.008G104350 - -
16 Sobic.001G377900 OsFBX9 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G226200 expressed protein -
18 Sobic.010G058400 expressed protein -
19 Sobic.001G170301 - -
20 Sobic.008G061601 - K11111: TERF2, telomeric repeat-binding factor 2


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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