Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G081800.1
Synonym Sb08g007740
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YTX8
Pfam -
Panther DB PTHR36707
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g12854.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025014
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G101100 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
2 Sobic.001G223550 - -
3 Sobic.003G416000 - -
4 Sobic.008G166550 - -
5 Sobic.001G459600 expressed protein -
6 Sobic.003G127001 - -
7 Sobic.007G202300 expressed protein -
8 Sobic.002G115050 - -
9 Sobic.004G034600 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
10 Sobic.004G070500 expressed protein -
11 Sobic.005G075100 rp3 protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G017500 expressed protein -
13 Sobic.005G133600 - -
14 Sobic.002G249300 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
15 Sobic.001G000300 - -
16 Sobic.002G124600 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
17 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
18 Sobic.005G089400 - -
19 Sobic.004G143475 - -
20 Sobic.001G248200 OsPOP22 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed K01303: acylaminoacyl-peptidase


Gene co-expression network
sample Sobic008G081800 Sobic008G081800 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic008G081800--Sobic008G101100 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic008G081800--Sobic001G223550 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic008G081800--Sobic003G416000 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic008G081800--Sobic008G166550 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic008G081800--Sobic001G459600 Sobic003G127001 Sobic003G127001 Sobic008G081800--Sobic003G127001 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic008G081800--Sobic007G202300 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic008G081800--Sobic002G115050 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic008G081800--Sobic004G034600 Sobic008G101100--Sobic003G416000 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic008G101100--Sobic004G253700 Sobic008G101100--Sobic008G166550 Sobic008G101100--Sobic001G223550 Sobic008G101100--Sobic007G202300 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic008G101100--Sobic009G248801 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic008G101100--Sobic005G133600 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic008G101100--Sobic005G089400 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic008G101100--Sobic002G017500 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic001G223550--Sobic010G145500 Sobic001G223550--Sobic004G034600 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic001G223550--Sobic002G249300 Sobic001G223550--Sobic005G133600 Sobic001G223550--Sobic008G101100 Sobic001G223550--Sobic005G089400 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic001G223550--Sobic001G233300 Sobic001G223550--Sobic008G081800 Sobic001G223550--Sobic001G459600 Sobic003G416000--Sobic002G017500 Sobic003G416000--Sobic008G101100 Sobic003G416000--Sobic008G166550 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic003G416000--Sobic002G244200 Sobic003G416000--Sobic005G089400 Sobic001G227900 Sobic001G227900 Sobic003G416000--Sobic001G227900 Sobic003G416000--Sobic007G202300 Sobic003G080700 Sobic003G080700 Sobic003G416000--Sobic003G080700 Sobic003G416000--Sobic005G133600 Sobic002G431500 Sobic002G431500 Sobic008G166550--Sobic002G431500 Sobic008G166550--Sobic007G202300 Sobic008G166550--Sobic002G244200 Sobic008G166550--Sobic003G416000 Sobic008G166550--Sobic008G101100 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic008G166550--Sobic005G095000 Sobic008G166550--Sobic002G017500 Sobic008G166550--Sobic002G115050 Sobic005G093800 Sobic005G093800 Sobic008G166550--Sobic005G093800 Sobic001G517800 Sobic001G517800 Sobic001G459600--Sobic001G517800 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic001G459600--Sobic001G000501 Sobic001G459600--Sobic004G034600 Sobic001G000700 Sobic001G000700 Sobic001G459600--Sobic001G000700 Sobic002G418800 Sobic002G418800 Sobic001G459600--Sobic002G418800 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic001G459600--Sobic008G084300 Sobic001G459600--Sobic008G166550 Sobic001G459600--Sobic001G223550 Sobic001G459600--Sobic005G133600 Sobic006G270700 Sobic006G270700 Sobic003G127001--Sobic006G270700 Sobic005G075100 Sobic005G075100 Sobic003G127001--Sobic005G075100 Sobic003G127001--Sobic002G115050 Sobic003G127001--Sobic007G202300 Sobic003G190000 Sobic003G190000 Sobic003G127001--Sobic003G190000 Sobic010G077400 Sobic010G077400 Sobic003G127001--Sobic010G077400 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic003G127001--Sobic002G173100 Sobic003G127001--Sobic002G244200 Sobic005G110532 Sobic005G110532 Sobic003G127001--Sobic005G110532 Sobic007G202300--Sobic008G166550 Sobic007G202300--Sobic002G244200 Sobic001G000300 Sobic001G000300 Sobic007G202300--Sobic001G000300 Sobic007G202300--Sobic009G248801 Sobic007G202300--Sobic008G101100 Sobic007G202300--Sobic002G017500 Sobic007G202300--Sobic003G416000 Sobic007G202300--Sobic005G093800 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic007G202300--Sobic007G185300 Sobic002G115050--Sobic005G075100 Sobic010G141966 Sobic010G141966 Sobic002G115050--Sobic010G141966 Sobic002G115050--Sobic005G093800 Sobic002G115050--Sobic008G166550 Sobic002G097700 Sobic002G097700 Sobic002G115050--Sobic002G097700 Sobic002G115075 Sobic002G115075 Sobic002G115050--Sobic002G115075 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic002G115050--Sobic004G038800 Sobic004G181600 Sobic004G181600 Sobic002G115050--Sobic004G181600 Sobic002G115050--Sobic003G127001 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic004G034600--Sobic005G149700 Sobic004G034600--Sobic002G249300 Sobic004G034600--Sobic001G517800 Sobic009G011600 Sobic009G011600 Sobic004G034600--Sobic009G011600 Sobic002G266000 Sobic002G266000 Sobic004G034600--Sobic002G266000 Sobic004G034600--Sobic001G459600 Sobic003G322700 Sobic003G322700 Sobic004G034600--Sobic003G322700 Sobic004G034600--Sobic001G223550 Sobic004G261900 Sobic004G261900 Sobic004G034600--Sobic004G261900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.