Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G190700.1
Synonym Sb08g023090
Functional annotation pentatricopeptide, putative, expressed
UniProt C5YT25
Pfam PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF268
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G18900 : Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g44170.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004871
Brachypodium KQJ85602 , KQJ85601
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G068500 expressed protein -
2 Sobic.008G025800 - -
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18 Sobic.002G320900 patatin-like phospholipase family protein, expressed -
19 Sobic.003G120400 expressed protein -
20 Sobic.003G440400 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G190700 Sobic008G190700 Sobic002G068500 Sobic002G068500 Sobic008G190700--Sobic002G068500 Sobic008G025800 Sobic008G025800 Sobic008G190700--Sobic008G025800 Sobic010G261300 Sobic010G261300 Sobic008G190700--Sobic010G261300 Sobic009G225300 Sobic009G225300 Sobic008G190700--Sobic009G225300 Sobic010G254801 Sobic010G254801 Sobic008G190700--Sobic010G254801 Sobic007G175701 Sobic007G175701 Sobic008G190700--Sobic007G175701 Sobic009G198400 Sobic009G198400 Sobic008G190700--Sobic009G198400 Sobic007G224600 Sobic007G224600 Sobic008G190700--Sobic007G224600 Sobic001G130900 Sobic001G130900 Sobic008G190700--Sobic001G130900 Sobic002G068500--Sobic009G225300 Sobic004G225450 Sobic004G225450 Sobic002G068500--Sobic004G225450 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic002G068500--Sobic001G537600 Sobic001G308450 Sobic001G308450 Sobic002G068500--Sobic001G308450 Sobic010G242100 Sobic010G242100 Sobic002G068500--Sobic010G242100 Sobic001G410800 Sobic001G410800 Sobic002G068500--Sobic001G410800 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic002G068500--Sobic006G146400 Sobic010G106400 Sobic010G106400 Sobic002G068500--Sobic010G106400 Sobic006G065200 Sobic006G065200 Sobic002G068500--Sobic006G065200 Sobic001G139750 Sobic001G139750 Sobic008G025800--Sobic001G139750 Sobic008G025800--Sobic007G175701 Sobic003G136700 Sobic003G136700 Sobic008G025800--Sobic003G136700 Sobic001G213400 Sobic001G213400 Sobic008G025800--Sobic001G213400 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic008G025800--Sobic009G082400 Sobic008G025800--Sobic009G198400 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic008G025800--Sobic004G354800 Sobic008G025800--Sobic001G130900 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic008G025800--Sobic009G163500 Sobic010G261300--Sobic009G225300 Sobic010G261300--Sobic009G198400 Sobic010G261300--Sobic007G175701 Sobic010G261300--Sobic001G130900 Sobic010G261300--Sobic007G224600 Sobic007G093400 Sobic007G093400 Sobic010G261300--Sobic007G093400 Sobic010G261300--Sobic001G213400 Sobic003G065001 Sobic003G065001 Sobic010G261300--Sobic003G065001 Sobic003G120400 Sobic003G120400 Sobic010G261300--Sobic003G120400 Sobic001G220200 Sobic001G220200 Sobic009G225300--Sobic001G220200 Sobic009G225300--Sobic007G224600 Sobic010G158766 Sobic010G158766 Sobic009G225300--Sobic010G158766 Sobic001G115900 Sobic001G115900 Sobic009G225300--Sobic001G115900 Sobic009G225300--Sobic009G198400 Sobic003G126400 Sobic003G126400 Sobic009G225300--Sobic003G126400 Sobic009G225300--Sobic003G065001 Sobic009G225300--Sobic004G225450 Sobic004G357033 Sobic004G357033 Sobic009G225300--Sobic004G357033 Sobic010G254801--Sobic001G139750 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic010G254801--Sobic005G076100 Sobic006G166601 Sobic006G166601 Sobic010G254801--Sobic006G166601 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic010G254801--Sobic002G326200 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic010G254801--Sobic007G174100 Sobic010G254801--Sobic007G175701 Sobic010G254801--Sobic004G354800 Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic010G254801--Sobic009G152901 Sobic010G254801--Sobic003G136700 Sobic007G175701--Sobic001G130900 Sobic007G175701--Sobic001G213400 Sobic007G175701--Sobic007G093400 Sobic007G122300 Sobic007G122300 Sobic007G175701--Sobic007G122300 Sobic003G367401 Sobic003G367401 Sobic007G175701--Sobic003G367401 Sobic007G175701--Sobic003G120400 Sobic010G201000 Sobic010G201000 Sobic007G175701--Sobic010G201000 Sobic001G525000 Sobic001G525000 Sobic007G175701--Sobic001G525000 Sobic007G175701--Sobic009G198400 Sobic009G198400--Sobic007G175701 Sobic009G198400--Sobic001G130900 Sobic009G198400--Sobic007G093400 Sobic009G198400--Sobic003G367401 Sobic009G198400--Sobic001G213400 Sobic009G198400--Sobic003G065001 Sobic009G198400--Sobic001G115900 Sobic009G198400--Sobic003G120400 Sobic009G198400--Sobic003G126400 Sobic001G519300 Sobic001G519300 Sobic007G224600--Sobic001G519300 Sobic002G320900 Sobic002G320900 Sobic007G224600--Sobic002G320900 Sobic002G284901 Sobic002G284901 Sobic007G224600--Sobic002G284901 Sobic007G221800 Sobic007G221800 Sobic007G224600--Sobic007G221800 Sobic002G210200 Sobic002G210200 Sobic007G224600--Sobic002G210200 Sobic007G224600--Sobic001G130900 Sobic003G200501 Sobic003G200501 Sobic007G224600--Sobic003G200501 Sobic007G224600--Sobic007G093400 Sobic006G065700 Sobic006G065700 Sobic007G224600--Sobic006G065700 Sobic001G130900--Sobic003G120400 Sobic001G130900--Sobic007G093400 Sobic001G130900--Sobic007G175701 Sobic001G130900--Sobic001G525000 Sobic001G130900--Sobic003G200501 Sobic001G130900--Sobic002G320900 Sobic001G130900--Sobic003G367401 Sobic001G130900--Sobic002G210200 Sobic001G130900--Sobic007G122300
Octagon: transcription factors


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