Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G091200.1
Synonym Sb09g009570
Functional annotation ubiquitin fusion protein, putative, expressed
UniProt C5YVM9
Pfam PF00240
Panther DB PTHR10666
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G55060 : ubiquitin 12
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g27930.1 : ubiquitin fusion protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2A02G408500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G152500 - -
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11 Sobic.004G228600 - -
12 Sobic.003G183850 - -
13 Sobic.003G183850 - -
14 Sobic.003G183850 - -
15 Sobic.003G183850 - -
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20 Sobic.005G107500 peptide transporter PTR2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G091200 Sobic009G091200 Sobic005G152500 Sobic005G152500 Sobic009G091200--Sobic005G152500 Sobic007G018550 Sobic007G018550 Sobic009G091200--Sobic007G018550 Sobic009G111901 Sobic009G111901 Sobic009G091200--Sobic009G111901 Sobic005G089200 Sobic005G089200 Sobic009G091200--Sobic005G089200 Sobic009G015166 Sobic009G015166 Sobic009G091200--Sobic009G015166 Sobic005G079400 Sobic005G079400 Sobic009G091200--Sobic005G079400 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic009G091200--Sobic007G154100 Sobic005G149600 Sobic005G149600 Sobic009G091200--Sobic005G149600 Sobic006G108300 Sobic006G108300 Sobic009G091200--Sobic006G108300 Sobic003G015200 Sobic003G015200 Sobic005G152500--Sobic003G015200 Sobic005G152500--Sobic005G089200 Sobic004G108800 Sobic004G108800 Sobic005G152500--Sobic004G108800 Sobic005G152500--Sobic005G149600 Sobic006G117500 Sobic006G117500 Sobic005G152500--Sobic006G117500 Sobic007G156800 Sobic007G156800 Sobic005G152500--Sobic007G156800 Sobic010G170300 Sobic010G170300 Sobic005G152500--Sobic010G170300 Sobic005G152500--Sobic009G015166 Sobic007G058600 Sobic007G058600 Sobic005G152500--Sobic007G058600 Sobic001G396400 Sobic001G396400 Sobic007G018550--Sobic001G396400 Sobic010G035900 Sobic010G035900 Sobic007G018550--Sobic010G035900 Sobic007G018550--Sobic009G091200 Sobic009G027800 Sobic009G027800 Sobic007G018550--Sobic009G027800 Sobic001G132800 Sobic001G132800 Sobic007G018550--Sobic001G132800 Sobic005G115800 Sobic005G115800 Sobic007G018550--Sobic005G115800 Sobic002G112300 Sobic002G112300 Sobic007G018550--Sobic002G112300 Sobic005G121200 Sobic005G121200 Sobic007G018550--Sobic005G121200 Sobic004G257800 Sobic004G257800 Sobic007G018550--Sobic004G257800 Sobic009G111901--Sobic009G091200 Sobic003G183850 Sobic003G183850 Sobic009G111901--Sobic003G183850 Sobic002G041150 Sobic002G041150 Sobic009G111901--Sobic002G041150 Sobic001G358700 Sobic001G358700 Sobic009G111901--Sobic001G358700 Sobic006G256200 Sobic006G256200 Sobic009G111901--Sobic006G256200 Sobic010G007000 Sobic010G007000 Sobic009G111901--Sobic010G007000 Sobic005G089200--Sobic005G149600 Sobic005G089200--Sobic004G108800 Sobic001G026300 Sobic001G026300 Sobic005G089200--Sobic001G026300 Sobic005G089200--Sobic005G152500 Sobic005G089200--Sobic003G015200 Sobic005G089200--Sobic006G117500 Sobic005G089200--Sobic010G170300 Sobic005G089200--Sobic007G156800 Sobic004G034200 Sobic004G034200 Sobic005G089200--Sobic004G034200 Sobic001G238500 Sobic001G238500 Sobic009G015166--Sobic001G238500 Sobic009G015166--Sobic006G117500 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic009G015166--Sobic005G066300 Sobic009G015166--Sobic004G108800 Sobic005G104200 Sobic005G104200 Sobic009G015166--Sobic005G104200 Sobic004G126500 Sobic004G126500 Sobic009G015166--Sobic004G126500 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic009G015166--Sobic002G411000 Sobic004G156250 Sobic004G156250 Sobic009G015166--Sobic004G156250 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic009G015166--Sobic006G009700 Sobic005G110508 Sobic005G110508 Sobic005G079400--Sobic005G110508 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G079400--Sobic005G066366 Sobic005G079400--Sobic005G066300 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic005G079400--Sobic005G197400 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G079400--Sobic005G197350 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G079400--Sobic005G110511 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G079400--Sobic002G081850 Sobic002G376100 Sobic002G376100 Sobic005G079400--Sobic002G376100 Sobic009G106100 Sobic009G106100 Sobic005G079400--Sobic009G106100 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic007G154100--Sobic004G312500 Sobic006G209000 Sobic006G209000 Sobic007G154100--Sobic006G209000 Sobic007G154100--Sobic006G108300 Sobic004G009200 Sobic004G009200 Sobic007G154100--Sobic004G009200 Sobic010G152500 Sobic010G152500 Sobic007G154100--Sobic010G152500 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic007G154100--Sobic005G071900 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic007G154100--Sobic003G079100 Sobic007G154100--Sobic009G106100 Sobic005G182800 Sobic005G182800 Sobic007G154100--Sobic005G182800 Sobic005G149600--Sobic005G089200 Sobic005G149600--Sobic004G108800 Sobic005G149600--Sobic001G026300 Sobic005G149600--Sobic003G015200 Sobic005G149600--Sobic006G117500 Sobic005G149600--Sobic004G156250 Sobic005G149600--Sobic005G152500 Sobic005G149600--Sobic007G156800 Sobic005G149600--Sobic004G034200 Sobic006G108300--Sobic004G312500 Sobic006G108300--Sobic005G071900 Sobic006G108300--Sobic007G154100 Sobic006G108300--Sobic002G411000 Sobic006G108300--Sobic006G009700 Sobic006G108300--Sobic003G079100 Sobic006G108300--Sobic006G209000 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic006G108300--Sobic002G029600 Sobic002G019100 Sobic002G019100 Sobic006G108300--Sobic002G019100
Octagon: transcription factors


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