Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G348200.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WXM3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g27690.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G082100 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
2 Sobic.005G079400 histone deacetylase 19, putative, expressed K06067: histone deacetylase 1/2
3 Sobic.003G240500 glycosyl transferase, group 1 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G102000 - -
5 Sobic.001G349200 sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase, decarboxylating, putative, expressed -
6 Sobic.001G506700 exostosin family domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G106100 GCRP9 - Glycine and cysteine rich family protein precursor, expressed -
8 Sobic.005G066300 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
9 Sobic.003G287200 WRKY23, expressed -
10 Sobic.002G163200 - -
11 Sobic.005G110514 - -
12 Sobic.006G209000 Protein transferase (Os)(PubMedID : 27208977)@transferase family domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G526500 transmembrane 9 superfamily member, putative, expressed K17086: transmembrane 9 superfamily member 2/4
14 Sobic.006G117500 polygalacturonase inhibitor 1 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.010G096700 leaf senescence related protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G170150 - -
17 Sobic.009G015166 - -
18 Sobic.005G177400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./middle senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
19 Sobic.005G110508 - -
20 Sobic.001G341400 nodulation-signaling pathway 1 protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G348200 Sobic001G348200 Sobic010G082100 Sobic010G082100 Sobic001G348200--Sobic010G082100 Sobic005G079400 Sobic005G079400 Sobic001G348200--Sobic005G079400 Sobic003G240500 Sobic003G240500 Sobic001G348200--Sobic003G240500 Sobic001G102000 Sobic001G102000 Sobic001G348200--Sobic001G102000 Sobic001G349200 Sobic001G349200 Sobic001G348200--Sobic001G349200 Sobic001G506700 Sobic001G506700 Sobic001G348200--Sobic001G506700 Sobic009G106100 Sobic009G106100 Sobic001G348200--Sobic009G106100 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic001G348200--Sobic005G066300 Sobic003G287200 Sobic003G287200 Sobic001G348200--Sobic003G287200 Sobic010G082100--Sobic003G240500 Sobic001G506500 Sobic001G506500 Sobic010G082100--Sobic001G506500 Sobic007G007300 Sobic007G007300 Sobic010G082100--Sobic007G007300 Sobic005G110514 Sobic005G110514 Sobic010G082100--Sobic005G110514 Sobic010G082100--Sobic009G106100 Sobic006G266800 Sobic006G266800 Sobic010G082100--Sobic006G266800 Sobic004G308500 Sobic004G308500 Sobic010G082100--Sobic004G308500 Sobic001G274400 Sobic001G274400 Sobic010G082100--Sobic001G274400 Sobic010G170150 Sobic010G170150 Sobic010G082100--Sobic010G170150 Sobic005G110508 Sobic005G110508 Sobic005G079400--Sobic005G110508 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G079400--Sobic005G066366 Sobic005G079400--Sobic005G066300 Sobic005G197400 Sobic005G197400 Sobic005G079400--Sobic005G197400 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G079400--Sobic005G197350 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic005G079400--Sobic005G110511 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic005G079400--Sobic002G081850 Sobic002G376100 Sobic002G376100 Sobic005G079400--Sobic002G376100 Sobic005G079400--Sobic009G106100 Sobic003G240500--Sobic010G082100 Sobic003G240500--Sobic007G007300 Sobic003G240500--Sobic006G266800 Sobic003G240500--Sobic005G110514 Sobic003G240500--Sobic004G308500 Sobic004G322000 Sobic004G322000 Sobic003G240500--Sobic004G322000 Sobic003G240500--Sobic001G506500 Sobic002G166150 Sobic002G166150 Sobic003G240500--Sobic002G166150 Sobic003G240500--Sobic001G506700 Sobic001G102000--Sobic010G082100 Sobic001G102000--Sobic001G348200 Sobic006G180300 Sobic006G180300 Sobic001G102000--Sobic006G180300 Sobic001G102000--Sobic003G240500 Sobic001G102000--Sobic010G170150 Sobic002G199200 Sobic002G199200 Sobic001G102000--Sobic002G199200 Sobic001G102000--Sobic001G506700 Sobic003G141200 Sobic003G141200 Sobic001G102000--Sobic003G141200 Sobic001G102000--Sobic001G349200 Sobic001G349200--Sobic009G106100 Sobic006G209000 Sobic006G209000 Sobic001G349200--Sobic006G209000 Sobic008G077900 Sobic008G077900 Sobic001G349200--Sobic008G077900 Sobic006G205500 Sobic006G205500 Sobic001G349200--Sobic006G205500 Sobic010G096700 Sobic010G096700 Sobic001G349200--Sobic010G096700 Sobic003G001300 Sobic003G001300 Sobic001G349200--Sobic003G001300 Sobic001G349200--Sobic001G274400 Sobic005G093101 Sobic005G093101 Sobic001G349200--Sobic005G093101 Sobic002G235800 Sobic002G235800 Sobic001G349200--Sobic002G235800 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic001G506700--Sobic002G411000 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic001G506700--Sobic005G065700 Sobic002G019100 Sobic002G019100 Sobic001G506700--Sobic002G019100 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic001G506700--Sobic005G071900 Sobic001G506600 Sobic001G506600 Sobic001G506700--Sobic001G506600 Sobic001G506700--Sobic006G209000 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic001G506700--Sobic006G009700 Sobic001G506700--Sobic005G066300 Sobic001G503000 Sobic001G503000 Sobic001G506700--Sobic001G503000 Sobic003G083800 Sobic003G083800 Sobic009G106100--Sobic003G083800 Sobic010G152500 Sobic010G152500 Sobic009G106100--Sobic010G152500 Sobic004G009200 Sobic004G009200 Sobic009G106100--Sobic004G009200 Sobic003G382200 Sobic003G382200 Sobic009G106100--Sobic003G382200 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic009G106100--Sobic005G106300 Sobic007G111800 Sobic007G111800 Sobic009G106100--Sobic007G111800 Sobic002G391900 Sobic002G391900 Sobic009G106100--Sobic002G391900 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic009G106100--Sobic005G216600 Sobic009G106100--Sobic005G197400 Sobic005G066300--Sobic002G411000 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic005G066300--Sobic004G312500 Sobic005G066300--Sobic001G506700 Sobic005G066300--Sobic005G071900 Sobic005G066300--Sobic010G096700 Sobic005G066300--Sobic005G197350 Sobic005G066300--Sobic006G209000 Sobic005G066300--Sobic002G081850 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic005G066300--Sobic005G066500 Sobic006G183900 Sobic006G183900 Sobic003G287200--Sobic006G183900 Sobic006G229100 Sobic006G229100 Sobic003G287200--Sobic006G229100 Sobic001G002800 Sobic001G002800 Sobic003G287200--Sobic001G002800 Sobic001G360500 Sobic001G360500 Sobic003G287200--Sobic001G360500 Sobic003G287200--Sobic001G503000 Sobic007G090472 Sobic007G090472 Sobic003G287200--Sobic007G090472 Sobic003G287200--Sobic010G096700 Sobic007G170300 Sobic007G170300 Sobic003G287200--Sobic007G170300 Sobic006G117500 Sobic006G117500 Sobic003G287200--Sobic006G117500
Octagon: transcription factors


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