Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G132100.1
Synonym Sb09g019860
Functional annotation OsFBX172 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5YXP3
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF102
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G67390 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g46300.1 : OsFBX172 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.009G132100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G182600 protein phosphatase 2C containing protein, expressed -
2 Sobic.001G422600 expressed protein -
3 Sobic.010G220700 aluminum-activated malate transporter, putative, expressed -
4 Sobic.003G019600 - -
5 Sobic.008G173800 K+ efflux antiporter 3(PubMedID : 26465154)@potasium efflux antiporter protein, putative, expressed -
6 Sobic.009G197901 - -
7 Sobic.005G186600 OsSCP28 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed -
8 Sobic.009G237300 - -
9 Sobic.004G046500 GTP-binding protein lepA, putative, expressed K03596: GTP-binding protein LepA
10 Sobic.007G129900 expressed protein -
11 Sobic.007G007200 - -
12 Sobic.004G193200 tRNA pseudouridine synthase family protein, putative, expressed K06173: truA, tRNA pseudouridine38-40 synthase
13 Sobic.001G470800 sulfate transporter, putative, expressed K17469: sulfate transporter 2, low-affinity
14 Sobic.004G271200 OsWAK17 - OsWAK short gene, expressed K14649: transcription initiation factor TFIID subunit 8
15 Sobic.001G177500 - -
16 Sobic.001G370100 R3H domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G206800 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G280600 - -
19 Sobic.003G245201 - -
20 Sobic.003G318650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G132100 Sobic009G132100 Sobic003G182600 Sobic003G182600 Sobic009G132100--Sobic003G182600 Sobic001G422600 Sobic001G422600 Sobic009G132100--Sobic001G422600 Sobic010G220700 Sobic010G220700 Sobic009G132100--Sobic010G220700 Sobic003G019600 Sobic003G019600 Sobic009G132100--Sobic003G019600 Sobic008G173800 Sobic008G173800 Sobic009G132100--Sobic008G173800 Sobic009G197901 Sobic009G197901 Sobic009G132100--Sobic009G197901 Sobic005G186600 Sobic005G186600 Sobic009G132100--Sobic005G186600 Sobic009G237300 Sobic009G237300 Sobic009G132100--Sobic009G237300 Sobic004G046500 Sobic004G046500 Sobic009G132100--Sobic004G046500 Sobic003G182600--Sobic009G132100 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic003G182600--Sobic008G001200 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic003G182600--Sobic007G116200 Sobic003G155100 Sobic003G155100 Sobic003G182600--Sobic003G155100 Sobic001G375100 Sobic001G375100 Sobic003G182600--Sobic001G375100 Sobic001G527800 Sobic001G527800 Sobic003G182600--Sobic001G527800 Sobic002G345700 Sobic002G345700 Sobic003G182600--Sobic002G345700 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic003G182600--Sobic001G194200 Sobic003G205200 Sobic003G205200 Sobic003G182600--Sobic003G205200 Sobic001G422600--Sobic010G220700 Sobic001G422600--Sobic008G173800 Sobic001G422600--Sobic009G132100 Sobic002G252600 Sobic002G252600 Sobic001G422600--Sobic002G252600 Sobic001G422600--Sobic009G197901 Sobic006G226900 Sobic006G226900 Sobic001G422600--Sobic006G226900 Sobic001G422600--Sobic003G019600 Sobic004G143100 Sobic004G143100 Sobic001G422600--Sobic004G143100 Sobic006G045200 Sobic006G045200 Sobic001G422600--Sobic006G045200 Sobic010G220700--Sobic001G422600 Sobic010G220700--Sobic009G132100 Sobic001G517100 Sobic001G517100 Sobic010G220700--Sobic001G517100 Sobic010G220700--Sobic008G173800 Sobic010G220700--Sobic006G226900 Sobic010G220700--Sobic003G182600 Sobic010G220700--Sobic006G045200 Sobic010G131000 Sobic010G131000 Sobic010G220700--Sobic010G131000 Sobic010G220700--Sobic003G019600 Sobic003G019600--Sobic005G186600 Sobic001G370100 Sobic001G370100 Sobic003G019600--Sobic001G370100 Sobic001G177500 Sobic001G177500 Sobic003G019600--Sobic001G177500 Sobic003G019600--Sobic009G237300 Sobic003G318650 Sobic003G318650 Sobic003G019600--Sobic003G318650 Sobic002G227800 Sobic002G227800 Sobic003G019600--Sobic002G227800 Sobic003G245201 Sobic003G245201 Sobic003G019600--Sobic003G245201 Sobic001G158966 Sobic001G158966 Sobic003G019600--Sobic001G158966 Sobic008G006900 Sobic008G006900 Sobic003G019600--Sobic008G006900 Sobic008G173800--Sobic004G046500 Sobic006G161500 Sobic006G161500 Sobic008G173800--Sobic006G161500 Sobic006G235400 Sobic006G235400 Sobic008G173800--Sobic006G235400 Sobic009G194500 Sobic009G194500 Sobic008G173800--Sobic009G194500 Sobic003G409700 Sobic003G409700 Sobic008G173800--Sobic003G409700 Sobic010G231300 Sobic010G231300 Sobic008G173800--Sobic010G231300 Sobic003G341300 Sobic003G341300 Sobic008G173800--Sobic003G341300 Sobic001G073300 Sobic001G073300 Sobic008G173800--Sobic001G073300 Sobic007G227100 Sobic007G227100 Sobic008G173800--Sobic007G227100 Sobic009G197901--Sobic009G237300 Sobic001G189800 Sobic001G189800 Sobic009G197901--Sobic001G189800 Sobic009G197901--Sobic001G177500 Sobic007G119400 Sobic007G119400 Sobic009G197901--Sobic007G119400 Sobic010G103300 Sobic010G103300 Sobic009G197901--Sobic010G103300 Sobic009G197901--Sobic005G186600 Sobic009G197901--Sobic001G370100 Sobic009G197901--Sobic001G158966 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic009G197901--Sobic001G234700 Sobic005G186600--Sobic009G237300 Sobic003G008100 Sobic003G008100 Sobic005G186600--Sobic003G008100 Sobic010G266000 Sobic010G266000 Sobic005G186600--Sobic010G266000 Sobic005G029866 Sobic005G029866 Sobic005G186600--Sobic005G029866 Sobic005G041700 Sobic005G041700 Sobic005G186600--Sobic005G041700 Sobic003G432600 Sobic003G432600 Sobic005G186600--Sobic003G432600 Sobic005G186600--Sobic010G103300 Sobic001G200400 Sobic001G200400 Sobic005G186600--Sobic001G200400 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic005G186600--Sobic004G184900 Sobic009G125700 Sobic009G125700 Sobic009G237300--Sobic009G125700 Sobic009G237300--Sobic001G234700 Sobic002G298800 Sobic002G298800 Sobic004G046500--Sobic002G298800 Sobic001G393300 Sobic001G393300 Sobic004G046500--Sobic001G393300 Sobic004G103300 Sobic004G103300 Sobic004G046500--Sobic004G103300 Sobic003G094100 Sobic003G094100 Sobic004G046500--Sobic003G094100 Sobic007G103400 Sobic007G103400 Sobic004G046500--Sobic007G103400 Sobic002G275300 Sobic002G275300 Sobic004G046500--Sobic002G275300 Sobic007G108900 Sobic007G108900 Sobic004G046500--Sobic007G108900 Sobic007G135800 Sobic007G135800 Sobic004G046500--Sobic007G135800 Sobic002G198300 Sobic002G198300 Sobic004G046500--Sobic002G198300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.