Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G245900.2
Synonym Sb09g029680
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R449
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085 PTHR33085:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g09020.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G141800 expressed protein -
2 Sobic.009G228400 lipase-related, putative, expressed -
3 Sobic.010G035801 - -
4 Sobic.006G239700 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G101100 OsFBX368 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.010G073600 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf and root, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@auxin response factor, putative, expressed -
7 Sobic.003G435400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
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9 Sobic.007G118050 - -
10 Sobic.005G156000 "Decreased expression levels by drought stress, up-regulated by silicon application under drought stress "(PubMedID : 24813726)@pyridoxal-dependent decarboxylase protein, putative, expressed K01581: E4.1.1.17, ODC1, speC, ornithine decarboxylase
11 Sobic.005G123400 expressed protein -
12 Sobic.004G111600 - -
13 Sobic.010G237650 - -
14 Sobic.003G397100 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -
15 Sobic.003G229400 CGMC_MAPKCMGC_2.4 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed -
16 Sobic.005G216800 RNA recognition motif containing protein, expressed -
17 Sobic.008G155400 ankyrin, putative, expressed -
18 Sobic.002G019750 - -
19 Sobic.006G215100 expressed protein -
20 Sobic.007G118075 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G245900 Sobic009G245900 Sobic006G141800 Sobic006G141800 Sobic009G245900--Sobic006G141800 Sobic009G228400 Sobic009G228400 Sobic009G245900--Sobic009G228400 Sobic010G035801 Sobic010G035801 Sobic009G245900--Sobic010G035801 Sobic006G239700 Sobic006G239700 Sobic009G245900--Sobic006G239700 Sobic005G101100 Sobic005G101100 Sobic009G245900--Sobic005G101100 Sobic010G073600 Sobic010G073600 Sobic009G245900--Sobic010G073600 Sobic003G435400 Sobic003G435400 Sobic009G245900--Sobic003G435400 Sobic003G402900 Sobic003G402900 Sobic009G245900--Sobic003G402900 Sobic007G118050 Sobic007G118050 Sobic009G245900--Sobic007G118050 Sobic010G063300 Sobic010G063300 Sobic006G141800--Sobic010G063300 Sobic006G141800--Sobic009G228400 Sobic001G321900 Sobic001G321900 Sobic006G141800--Sobic001G321900 Sobic006G215100 Sobic006G215100 Sobic006G141800--Sobic006G215100 Sobic006G141800--Sobic010G073600 Sobic006G130200 Sobic006G130200 Sobic006G141800--Sobic006G130200 Sobic003G070700 Sobic003G070700 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Octagon: transcription factors


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