Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G034800.2,Sobic.010G034800.1
Synonym Sb10g003150
Functional annotation transferase family protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0VR97 , A0A194YI54
Pfam PF02458
Panther DB PTHR31625 PTHR31625:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016747; transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G29670 : HXXXD-type acyl-transferase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g05320.1 : transferase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCSU02G046700 , TraesCS7D02G090900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G090460 - K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
2 Sobic.003G121100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
3 Sobic.005G170100 phosphoesterase family protein, putative, expressed K01114: phospholipase C
4 Sobic.001G502000 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter
5 Sobic.008G068300 transferase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G258600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
7 Sobic.004G348500 RING-H2 finger protein ATL5G, putative, expressed -
8 Sobic.005G088300 expressed protein -
9 Sobic.002G165020 - -
10 Sobic.004G299600 - -
11 Sobic.007G158800 patatin, putative, expressed -
12 Sobic.006G235200 expressed protein -
13 Sobic.009G052800 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G183700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@L-ascorbate oxidase precursor, putative, expressed -
15 Sobic.004G119600 expansin precursor, putative, expressed -
16 Sobic.002G311501 - -
17 Sobic.001G229000 xyloglucan galactosyltransferase KATAMARI1, putative, expressed -
18 Sobic.001G324100 leucoanthocyanidin dioxygenase, putative, expressed -
19 Sobic.006G089000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G228400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G034800 Sobic010G034800 Sobic007G090460 Sobic007G090460 Sobic010G034800--Sobic007G090460 Sobic003G121100 Sobic003G121100 Sobic010G034800--Sobic003G121100 Sobic005G170100 Sobic005G170100 Sobic010G034800--Sobic005G170100 Sobic001G502000 Sobic001G502000 Sobic010G034800--Sobic001G502000 Sobic008G068300 Sobic008G068300 Sobic010G034800--Sobic008G068300 Sobic001G258600 Sobic001G258600 Sobic010G034800--Sobic001G258600 Sobic004G348500 Sobic004G348500 Sobic010G034800--Sobic004G348500 Sobic005G088300 Sobic005G088300 Sobic010G034800--Sobic005G088300 Sobic002G165020 Sobic002G165020 Sobic010G034800--Sobic002G165020 Sobic010G088800 Sobic010G088800 Sobic007G090460--Sobic010G088800 Sobic006G103300 Sobic006G103300 Sobic007G090460--Sobic006G103300 Sobic005G110406 Sobic005G110406 Sobic007G090460--Sobic005G110406 Sobic002G183700 Sobic002G183700 Sobic007G090460--Sobic002G183700 Sobic006G225500 Sobic006G225500 Sobic007G090460--Sobic006G225500 Sobic002G085900 Sobic002G085900 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Octagon: transcription factors


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