Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G036200.1
Synonym Sb10g003245
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YH48
Pfam -
Panther DB PTHR33120
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g05420.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G224800 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
2 Sobic.001G430000 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
3 Sobic.008G078600 NADP-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
4 Sobic.003G201300 hsp20/alpha crystallin family protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G038400 expressed protein -
6 Sobic.002G359800 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G116766 - -
8 Sobic.008G037200 expressed protein -
9 Sobic.008G127200 expressed protein -
10 Sobic.010G241500 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
11 Sobic.002G184800 expressed protein -
12 Sobic.003G026100 expressed protein -
13 Sobic.003G236900 YUC4, putative, expressed K11816: indole-3-pyruvate monooxygenase
14 Sobic.004G097800 bet v I allergen family protein, putative, expressed K14496: abscisic acid receptor PYR/PYL family
15 Sobic.001G361500 expressed protein -
16 Sobic.005G087600 AP2 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G184500 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
18 Sobic.001G511200 expressed protein -
19 Sobic.009G164200 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11252: histone H2B
20 Sobic.004G330500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G036200 Sobic010G036200 Sobic007G224800 Sobic007G224800 Sobic010G036200--Sobic007G224800 Sobic001G430000 Sobic001G430000 Sobic010G036200--Sobic001G430000 Sobic008G078600 Sobic008G078600 Sobic010G036200--Sobic008G078600 Sobic003G201300 Sobic003G201300 Sobic010G036200--Sobic003G201300 Sobic001G038400 Sobic001G038400 Sobic010G036200--Sobic001G038400 Sobic002G359800 Sobic002G359800 Sobic010G036200--Sobic002G359800 Sobic009G116766 Sobic009G116766 Sobic010G036200--Sobic009G116766 Sobic008G037200 Sobic008G037200 Sobic010G036200--Sobic008G037200 Sobic008G127200 Sobic008G127200 Sobic010G036200--Sobic008G127200 Sobic007G224800--Sobic003G201300 Sobic007G224800--Sobic008G078600 Sobic007G224800--Sobic009G116766 Sobic007G224800--Sobic001G430000 Sobic007G224800--Sobic010G036200 Sobic005G087600 Sobic005G087600 Sobic007G224800--Sobic005G087600 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic007G224800--Sobic001G361500 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic007G224800--Sobic009G164200 Sobic003G026100 Sobic003G026100 Sobic007G224800--Sobic003G026100 Sobic001G430000--Sobic007G224800 Sobic001G430000--Sobic002G359800 Sobic001G430000--Sobic010G036200 Sobic002G184800 Sobic002G184800 Sobic001G430000--Sobic002G184800 Sobic003G184500 Sobic003G184500 Sobic001G430000--Sobic003G184500 Sobic001G430000--Sobic008G037200 Sobic001G430000--Sobic003G201300 Sobic003G023666 Sobic003G023666 Sobic001G430000--Sobic003G023666 Sobic001G430000--Sobic008G127200 Sobic008G078600--Sobic003G201300 Sobic008G078600--Sobic001G361500 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic008G078600--Sobic003G343100 Sobic008G078600--Sobic009G164200 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic008G078600--Sobic005G189400 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic008G078600--Sobic004G330500 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic008G078600--Sobic006G090201 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic008G078600--Sobic006G185400 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic008G078600--Sobic007G152200 Sobic003G201300--Sobic008G078600 Sobic003G201300--Sobic001G361500 Sobic003G201300--Sobic009G164200 Sobic003G201300--Sobic009G116766 Sobic003G201300--Sobic007G224800 Sobic009G167300 Sobic009G167300 Sobic003G201300--Sobic009G167300 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic003G201300--Sobic006G209100 Sobic003G201300--Sobic005G087600 Sobic010G231400 Sobic010G231400 Sobic003G201300--Sobic010G231400 Sobic010G260600 Sobic010G260600 Sobic001G038400--Sobic010G260600 Sobic001G038400--Sobic002G184800 Sobic001G038400--Sobic002G359800 Sobic001G038400--Sobic008G037200 Sobic009G165300 Sobic009G165300 Sobic001G038400--Sobic009G165300 Sobic001G038400--Sobic001G430000 Sobic001G413700 Sobic001G413700 Sobic001G038400--Sobic001G413700 Sobic005G116300 Sobic005G116300 Sobic001G038400--Sobic005G116300 Sobic004G025200 Sobic004G025200 Sobic001G038400--Sobic004G025200 Sobic002G359800--Sobic002G184800 Sobic002G359800--Sobic001G430000 Sobic002G359800--Sobic001G038400 Sobic002G359800--Sobic003G184500 Sobic002G359800--Sobic010G260600 Sobic004G129700 Sobic004G129700 Sobic002G359800--Sobic004G129700 Sobic002G359800--Sobic010G036200 Sobic002G359800--Sobic009G165300 Sobic002G359800--Sobic008G037200 Sobic009G116766--Sobic009G164200 Sobic009G116766--Sobic003G201300 Sobic009G116766--Sobic001G361500 Sobic003G423100 Sobic003G423100 Sobic009G116766--Sobic003G423100 Sobic009G116766--Sobic006G090201 Sobic009G116766--Sobic004G330500 Sobic009G116766--Sobic006G185400 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic009G116766--Sobic003G245700 Sobic009G116766--Sobic005G189400 Sobic008G037200--Sobic001G038400 Sobic008G037200--Sobic001G430000 Sobic008G037200--Sobic004G025200 Sobic008G037200--Sobic007G224800 Sobic008G037200--Sobic003G023666 Sobic008G037200--Sobic001G413700 Sobic008G037200--Sobic010G036200 Sobic008G037200--Sobic002G359800 Sobic008G037200--Sobic003G184500 Sobic002G356700 Sobic002G356700 Sobic008G127200--Sobic002G356700 Sobic010G145200 Sobic010G145200 Sobic008G127200--Sobic010G145200 Sobic008G127200--Sobic003G201300 Sobic001G511200 Sobic001G511200 Sobic008G127200--Sobic001G511200 Sobic008G127200--Sobic007G224800 Sobic003G178200 Sobic003G178200 Sobic008G127200--Sobic003G178200 Sobic008G127200--Sobic008G078600 Sobic008G127200--Sobic009G116766 Sobic003G364700 Sobic003G364700 Sobic008G127200--Sobic003G364700
Octagon: transcription factors


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