Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G430000.1
Synonym Sb01g040450
Functional annotation basic helix-loop-helix, putative, expressed
UniProt A0A1Z5SAC2
Pfam PF00010
Panther DB PTHR12565 PTHR12565:SF77
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G68810 : basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g15440.1 : basic helix-loop-helix, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001683 , Zm00025a052825
Brachypodium KQK22480
Barley HORVU4Hr1G061760.2 , HORVU4Hr1G061760.3 , HORVU4Hr1G061760.1 , HORVU4Hr1G061760.6 , HORVU4Hr1G061760.4 , HORVU4Hr1G061760.5
Wheat TraesCS4B02G217400 , TraesCS4D02G217700 , TraesCS4A02G087000 , TraesCS5B02G229000
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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20 Sobic.001G216800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G430000 Sobic001G430000 Sobic007G224800 Sobic007G224800 Sobic001G430000--Sobic007G224800 Sobic002G359800 Sobic002G359800 Sobic001G430000--Sobic002G359800 Sobic010G036200 Sobic010G036200 Sobic001G430000--Sobic010G036200 Sobic002G184800 Sobic002G184800 Sobic001G430000--Sobic002G184800 Sobic003G184500 Sobic003G184500 Sobic001G430000--Sobic003G184500 Sobic008G037200 Sobic008G037200 Sobic001G430000--Sobic008G037200 Sobic003G201300 Sobic003G201300 Sobic001G430000--Sobic003G201300 Sobic003G023666 Sobic003G023666 Sobic001G430000--Sobic003G023666 Sobic008G127200 Sobic008G127200 Sobic001G430000--Sobic008G127200 Sobic007G224800--Sobic003G201300 Sobic008G078600 Sobic008G078600 Sobic007G224800--Sobic008G078600 Sobic009G116766 Sobic009G116766 Sobic007G224800--Sobic009G116766 Sobic007G224800--Sobic001G430000 Sobic007G224800--Sobic010G036200 Sobic005G087600 Sobic005G087600 Sobic007G224800--Sobic005G087600 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic007G224800--Sobic001G361500 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic007G224800--Sobic009G164200 Sobic003G026100 Sobic003G026100 Sobic007G224800--Sobic003G026100 Sobic002G359800--Sobic002G184800 Sobic002G359800--Sobic001G430000 Sobic001G038400 Sobic001G038400 Sobic002G359800--Sobic001G038400 Sobic002G359800--Sobic003G184500 Sobic010G260600 Sobic010G260600 Sobic002G359800--Sobic010G260600 Sobic004G129700 Sobic004G129700 Sobic002G359800--Sobic004G129700 Sobic002G359800--Sobic010G036200 Sobic009G165300 Sobic009G165300 Sobic002G359800--Sobic009G165300 Sobic002G359800--Sobic008G037200 Sobic010G036200--Sobic007G224800 Sobic010G036200--Sobic001G430000 Sobic010G036200--Sobic008G078600 Sobic010G036200--Sobic003G201300 Sobic010G036200--Sobic001G038400 Sobic010G036200--Sobic002G359800 Sobic010G036200--Sobic009G116766 Sobic010G036200--Sobic008G037200 Sobic010G036200--Sobic008G127200 Sobic002G184800--Sobic002G359800 Sobic002G184800--Sobic001G038400 Sobic002G184800--Sobic001G430000 Sobic002G184800--Sobic010G260600 Sobic002G184800--Sobic003G184500 Sobic002G184800--Sobic009G165300 Sobic001G403200 Sobic001G403200 Sobic002G184800--Sobic001G403200 Sobic002G184800--Sobic004G129700 Sobic002G184800--Sobic010G036200 Sobic003G184500--Sobic001G430000 Sobic001G399400 Sobic001G399400 Sobic003G184500--Sobic001G399400 Sobic008G107600 Sobic008G107600 Sobic003G184500--Sobic008G107600 Sobic006G271100 Sobic006G271100 Sobic003G184500--Sobic006G271100 Sobic003G184500--Sobic002G359800 Sobic003G184500--Sobic002G184800 Sobic003G399400 Sobic003G399400 Sobic003G184500--Sobic003G399400 Sobic002G219500 Sobic002G219500 Sobic003G184500--Sobic002G219500 Sobic003G184500--Sobic003G023666 Sobic008G037200--Sobic001G038400 Sobic008G037200--Sobic001G430000 Sobic004G025200 Sobic004G025200 Sobic008G037200--Sobic004G025200 Sobic008G037200--Sobic007G224800 Sobic008G037200--Sobic003G023666 Sobic001G413700 Sobic001G413700 Sobic008G037200--Sobic001G413700 Sobic008G037200--Sobic010G036200 Sobic008G037200--Sobic002G359800 Sobic008G037200--Sobic003G184500 Sobic003G201300--Sobic008G078600 Sobic003G201300--Sobic001G361500 Sobic003G201300--Sobic009G164200 Sobic003G201300--Sobic009G116766 Sobic003G201300--Sobic007G224800 Sobic009G167300 Sobic009G167300 Sobic003G201300--Sobic009G167300 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic003G201300--Sobic006G209100 Sobic003G201300--Sobic005G087600 Sobic010G231400 Sobic010G231400 Sobic003G201300--Sobic010G231400 Sobic003G023666--Sobic001G430000 Sobic003G023666--Sobic008G037200 Sobic004G049800 Sobic004G049800 Sobic003G023666--Sobic004G049800 Sobic003G023666--Sobic003G184500 Sobic003G023666--Sobic007G224800 Sobic001G511200 Sobic001G511200 Sobic003G023666--Sobic001G511200 Sobic004G077100 Sobic004G077100 Sobic003G023666--Sobic004G077100 Sobic006G069500 Sobic006G069500 Sobic003G023666--Sobic006G069500 Sobic003G273800 Sobic003G273800 Sobic003G023666--Sobic003G273800 Sobic002G356700 Sobic002G356700 Sobic008G127200--Sobic002G356700 Sobic010G145200 Sobic010G145200 Sobic008G127200--Sobic010G145200 Sobic008G127200--Sobic003G201300 Sobic008G127200--Sobic001G511200 Sobic008G127200--Sobic007G224800 Sobic003G178200 Sobic003G178200 Sobic008G127200--Sobic003G178200 Sobic008G127200--Sobic008G078600 Sobic008G127200--Sobic009G116766 Sobic003G364700 Sobic003G364700 Sobic008G127200--Sobic003G364700
Octagon: transcription factors


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