Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G097800.1
Synonym RCAR14, Sb04g008040, PYL2
Functional annotation bet v I allergen family protein, putative, expressed
UniProt C5XYH3
Pfam PF10604
Panther DB PTHR31213 PTHR31213:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14496; abscisic acid receptor PYR/PYL family
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G26040 : PYR1-like 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g13330.1 : bet v I allergen family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020131
Brachypodium KQJ97910 , KQK17969 , KQK14503 , KQJ94110
Barley HORVU7Hr1G088140.1 , HORVU7Hr1G088140.2
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G224800 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
2 Sobic.010G036200 expressed protein -
3 Sobic.001G430000 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
4 Sobic.003G201300 hsp20/alpha crystallin family protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G116766 - -
6 Sobic.004G300701 - -
7 Sobic.001G038400 expressed protein -
8 Sobic.002G359800 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
9 Sobic.008G078600 NADP-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
10 Sobic.003G337100 expressed protein -
11 Sobic.004G129700 MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
12 Sobic.010G099400 metalloendoproteinase 1 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.005G087600 AP2 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G004300 expressed protein -
15 Sobic.010G241500 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
16 Sobic.009G167300 CCT motif family protein, expressed -
17 Sobic.008G037200 expressed protein -
18 Sobic.003G023666 - -
19 Sobic.007G085350 - -
20 Sobic.001G339900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G097800 Sobic004G097800 Sobic007G224800 Sobic007G224800 Sobic004G097800--Sobic007G224800 Sobic010G036200 Sobic010G036200 Sobic004G097800--Sobic010G036200 Sobic001G430000 Sobic001G430000 Sobic004G097800--Sobic001G430000 Sobic003G201300 Sobic003G201300 Sobic004G097800--Sobic003G201300 Sobic009G116766 Sobic009G116766 Sobic004G097800--Sobic009G116766 Sobic004G300701 Sobic004G300701 Sobic004G097800--Sobic004G300701 Sobic001G038400 Sobic001G038400 Sobic004G097800--Sobic001G038400 Sobic002G359800 Sobic002G359800 Sobic004G097800--Sobic002G359800 Sobic008G078600 Sobic008G078600 Sobic004G097800--Sobic008G078600 Sobic007G224800--Sobic003G201300 Sobic007G224800--Sobic008G078600 Sobic007G224800--Sobic009G116766 Sobic007G224800--Sobic001G430000 Sobic007G224800--Sobic010G036200 Sobic005G087600 Sobic005G087600 Sobic007G224800--Sobic005G087600 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic007G224800--Sobic001G361500 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic007G224800--Sobic009G164200 Sobic003G026100 Sobic003G026100 Sobic007G224800--Sobic003G026100 Sobic010G036200--Sobic007G224800 Sobic010G036200--Sobic001G430000 Sobic010G036200--Sobic008G078600 Sobic010G036200--Sobic003G201300 Sobic010G036200--Sobic001G038400 Sobic010G036200--Sobic002G359800 Sobic010G036200--Sobic009G116766 Sobic008G037200 Sobic008G037200 Sobic010G036200--Sobic008G037200 Sobic008G127200 Sobic008G127200 Sobic010G036200--Sobic008G127200 Sobic001G430000--Sobic007G224800 Sobic001G430000--Sobic002G359800 Sobic001G430000--Sobic010G036200 Sobic002G184800 Sobic002G184800 Sobic001G430000--Sobic002G184800 Sobic003G184500 Sobic003G184500 Sobic001G430000--Sobic003G184500 Sobic001G430000--Sobic008G037200 Sobic001G430000--Sobic003G201300 Sobic003G023666 Sobic003G023666 Sobic001G430000--Sobic003G023666 Sobic001G430000--Sobic008G127200 Sobic003G201300--Sobic008G078600 Sobic003G201300--Sobic001G361500 Sobic003G201300--Sobic009G164200 Sobic003G201300--Sobic009G116766 Sobic003G201300--Sobic007G224800 Sobic009G167300 Sobic009G167300 Sobic003G201300--Sobic009G167300 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic003G201300--Sobic006G209100 Sobic003G201300--Sobic005G087600 Sobic010G231400 Sobic010G231400 Sobic003G201300--Sobic010G231400 Sobic009G116766--Sobic009G164200 Sobic009G116766--Sobic003G201300 Sobic009G116766--Sobic001G361500 Sobic003G423100 Sobic003G423100 Sobic009G116766--Sobic003G423100 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic009G116766--Sobic006G090201 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic009G116766--Sobic004G330500 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic009G116766--Sobic006G185400 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic009G116766--Sobic003G245700 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic009G116766--Sobic005G189400 Sobic003G283500 Sobic003G283500 Sobic004G300701--Sobic003G283500 Sobic004G300701--Sobic007G224800 Sobic004G300701--Sobic001G430000 Sobic010G099400 Sobic010G099400 Sobic004G300701--Sobic010G099400 Sobic004G342900 Sobic004G342900 Sobic004G300701--Sobic004G342900 Sobic003G337100 Sobic003G337100 Sobic004G300701--Sobic003G337100 Sobic010G013100 Sobic010G013100 Sobic004G300701--Sobic010G013100 Sobic005G016600 Sobic005G016600 Sobic004G300701--Sobic005G016600 Sobic004G300701--Sobic003G201300 Sobic010G260600 Sobic010G260600 Sobic001G038400--Sobic010G260600 Sobic001G038400--Sobic002G184800 Sobic001G038400--Sobic002G359800 Sobic001G038400--Sobic008G037200 Sobic009G165300 Sobic009G165300 Sobic001G038400--Sobic009G165300 Sobic001G038400--Sobic001G430000 Sobic001G413700 Sobic001G413700 Sobic001G038400--Sobic001G413700 Sobic005G116300 Sobic005G116300 Sobic001G038400--Sobic005G116300 Sobic004G025200 Sobic004G025200 Sobic001G038400--Sobic004G025200 Sobic002G359800--Sobic002G184800 Sobic002G359800--Sobic001G430000 Sobic002G359800--Sobic001G038400 Sobic002G359800--Sobic003G184500 Sobic002G359800--Sobic010G260600 Sobic004G129700 Sobic004G129700 Sobic002G359800--Sobic004G129700 Sobic002G359800--Sobic010G036200 Sobic002G359800--Sobic009G165300 Sobic002G359800--Sobic008G037200 Sobic008G078600--Sobic003G201300 Sobic008G078600--Sobic001G361500 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic008G078600--Sobic003G343100 Sobic008G078600--Sobic009G164200 Sobic008G078600--Sobic005G189400 Sobic008G078600--Sobic004G330500 Sobic008G078600--Sobic006G090201 Sobic008G078600--Sobic006G185400 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic008G078600--Sobic007G152200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.