Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G070300.1
Synonym
Functional annotation DNA binding protein, putative, expressed
UniProt A0A194YIU3
Pfam PF02485
Panther DB PTHR31042 PTHR31042:SF26
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0008375acetylglucosaminyltransferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G51770 : Core-2/I-branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g04220.1 : DNA binding protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G183700 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
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20 Sobic.004G009500 transporter, major facilitator family, putative, expressed K02575: NRT, narK, nrtP, MFS transporter, NNP family, nitrate/nitrite transporter


Gene co-expression network
sample Sobic010G070300 Sobic010G070300 Sobic001G183700 Sobic001G183700 Sobic010G070300--Sobic001G183700 Sobic007G047500 Sobic007G047500 Sobic010G070300--Sobic007G047500 Sobic010G113100 Sobic010G113100 Sobic010G070300--Sobic010G113100 Sobic006G251400 Sobic006G251400 Sobic010G070300--Sobic006G251400 Sobic008G164450 Sobic008G164450 Sobic010G070300--Sobic008G164450 Sobic004G029100 Sobic004G029100 Sobic010G070300--Sobic004G029100 Sobic002G385500 Sobic002G385500 Sobic010G070300--Sobic002G385500 Sobic002G042200 Sobic002G042200 Sobic010G070300--Sobic002G042200 Sobic004G119600 Sobic004G119600 Sobic010G070300--Sobic004G119600 Sobic001G183700--Sobic010G070300 Sobic001G360400 Sobic001G360400 Sobic001G183700--Sobic001G360400 Sobic004G009500 Sobic004G009500 Sobic001G183700--Sobic004G009500 Sobic003G015300 Sobic003G015300 Sobic001G183700--Sobic003G015300 Sobic001G183700--Sobic010G113100 Sobic001G375200 Sobic001G375200 Sobic001G183700--Sobic001G375200 Sobic003G152200 Sobic003G152200 Sobic001G183700--Sobic003G152200 Sobic001G183700--Sobic006G251400 Sobic001G183700--Sobic002G385500 Sobic007G047500--Sobic001G360400 Sobic007G047500--Sobic010G070300 Sobic007G047500--Sobic010G113100 Sobic007G030501 Sobic007G030501 Sobic007G047500--Sobic007G030501 Sobic004G212600 Sobic004G212600 Sobic007G047500--Sobic004G212600 Sobic010G206800 Sobic010G206800 Sobic007G047500--Sobic010G206800 Sobic003G351600 Sobic003G351600 Sobic007G047500--Sobic003G351600 Sobic010G204200 Sobic010G204200 Sobic007G047500--Sobic010G204200 Sobic007G021900 Sobic007G021900 Sobic007G047500--Sobic007G021900 Sobic002G101400 Sobic002G101400 Sobic010G113100--Sobic002G101400 Sobic010G028100 Sobic010G028100 Sobic010G113100--Sobic010G028100 Sobic006G092700 Sobic006G092700 Sobic010G113100--Sobic006G092700 Sobic010G113100--Sobic008G164450 Sobic006G135300 Sobic006G135300 Sobic010G113100--Sobic006G135300 Sobic007G057400 Sobic007G057400 Sobic010G113100--Sobic007G057400 Sobic002G216100 Sobic002G216100 Sobic010G113100--Sobic002G216100 Sobic001G506800 Sobic001G506800 Sobic010G113100--Sobic001G506800 Sobic001G360500 Sobic001G360500 Sobic010G113100--Sobic001G360500 Sobic006G251400--Sobic002G042200 Sobic006G122800 Sobic006G122800 Sobic006G251400--Sobic006G122800 Sobic001G058300 Sobic001G058300 Sobic006G251400--Sobic001G058300 Sobic006G174300 Sobic006G174300 Sobic006G251400--Sobic006G174300 Sobic007G050200 Sobic007G050200 Sobic006G251400--Sobic007G050200 Sobic006G251400--Sobic003G351600 Sobic006G251400--Sobic002G101400 Sobic004G164300 Sobic004G164300 Sobic006G251400--Sobic004G164300 Sobic006G251400--Sobic010G113100 Sobic009G181600 Sobic009G181600 Sobic008G164450--Sobic009G181600 Sobic008G164450--Sobic001G506800 Sobic008G164450--Sobic006G092700 Sobic002G146000 Sobic002G146000 Sobic008G164450--Sobic002G146000 Sobic008G164450--Sobic010G113100 Sobic008G164450--Sobic006G135300 Sobic008G164450--Sobic010G028100 Sobic006G003600 Sobic006G003600 Sobic008G164450--Sobic006G003600 Sobic007G037600 Sobic007G037600 Sobic008G164450--Sobic007G037600 Sobic004G322100 Sobic004G322100 Sobic004G029100--Sobic004G322100 Sobic002G183700 Sobic002G183700 Sobic004G029100--Sobic002G183700 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic004G029100--Sobic010G152400 Sobic007G158800 Sobic007G158800 Sobic004G029100--Sobic007G158800 Sobic003G000100 Sobic003G000100 Sobic004G029100--Sobic003G000100 Sobic007G008600 Sobic007G008600 Sobic004G029100--Sobic007G008600 Sobic001G502000 Sobic001G502000 Sobic004G029100--Sobic001G502000 Sobic003G182200 Sobic003G182200 Sobic004G029100--Sobic003G182200 Sobic008G019800 Sobic008G019800 Sobic004G029100--Sobic008G019800 Sobic002G385500--Sobic003G000100 Sobic002G385500--Sobic010G152400 Sobic002G385500--Sobic004G029100 Sobic009G088500 Sobic009G088500 Sobic002G385500--Sobic009G088500 Sobic006G003100 Sobic006G003100 Sobic002G385500--Sobic006G003100 Sobic002G385500--Sobic008G019800 Sobic008G068300 Sobic008G068300 Sobic002G385500--Sobic008G068300 Sobic002G385500--Sobic004G322100 Sobic006G089000 Sobic006G089000 Sobic002G385500--Sobic006G089000 Sobic006G197100 Sobic006G197100 Sobic002G042200--Sobic006G197100 Sobic004G139300 Sobic004G139300 Sobic002G042200--Sobic004G139300 Sobic002G261500 Sobic002G261500 Sobic002G042200--Sobic002G261500 Sobic005G065900 Sobic005G065900 Sobic002G042200--Sobic005G065900 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic002G042200--Sobic010G148800 Sobic004G202400 Sobic004G202400 Sobic002G042200--Sobic004G202400 Sobic003G157600 Sobic003G157600 Sobic002G042200--Sobic003G157600 Sobic002G042200--Sobic006G251400 Sobic004G209400 Sobic004G209400 Sobic002G042200--Sobic004G209400 Sobic004G119600--Sobic007G158800 Sobic004G119600--Sobic004G029100 Sobic004G119600--Sobic001G502000 Sobic004G119600--Sobic008G019800 Sobic004G119600--Sobic010G152400 Sobic004G119600--Sobic002G385500 Sobic004G119600--Sobic002G183700 Sobic004G119600--Sobic003G000100 Sobic001G229000 Sobic001G229000 Sobic004G119600--Sobic001G229000
Octagon: transcription factors


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