Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G211100.1
Synonym Sb10g025780
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z745
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G38465 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g44190.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051618
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G273500 endoglucanase, putative, expressed K01179: endoglucanase
2 Sobic.009G178500 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@LTPL67 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
3 Sobic.009G012300 phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative, expressed K01933: phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase
4 Sobic.004G038850 - -
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7 Sobic.003G198016 - -
8 Sobic.010G263300 expressed protein -
9 Sobic.003G198048 - -
10 Sobic.002G096201 - -
11 Sobic.007G133766 - -
12 Sobic.008G191700 - -
13 Sobic.006G034200 wax synthase, putative, expressed -
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15 Sobic.001G130600 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.009G103900 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G211200 ZOS6-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
18 Sobic.005G162800 expressed protein -
19 Sobic.004G040800 ZOS2-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
20 Sobic.003G275400 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G211100 Sobic010G211100 Sobic002G273500 Sobic002G273500 Sobic010G211100--Sobic002G273500 Sobic009G178500 Sobic009G178500 Sobic010G211100--Sobic009G178500 Sobic009G012300 Sobic009G012300 Sobic010G211100--Sobic009G012300 Sobic004G038850 Sobic004G038850 Sobic010G211100--Sobic004G038850 Sobic006G124600 Sobic006G124600 Sobic010G211100--Sobic006G124600 Sobic003G369600 Sobic003G369600 Sobic010G211100--Sobic003G369600 Sobic003G198016 Sobic003G198016 Sobic010G211100--Sobic003G198016 Sobic010G263300 Sobic010G263300 Sobic010G211100--Sobic010G263300 Sobic003G198048 Sobic003G198048 Sobic010G211100--Sobic003G198048 Sobic009G187700 Sobic009G187700 Sobic002G273500--Sobic009G187700 Sobic002G273500--Sobic010G211100 Sobic009G180300 Sobic009G180300 Sobic002G273500--Sobic009G180300 Sobic006G034200 Sobic006G034200 Sobic002G273500--Sobic006G034200 Sobic004G089400 Sobic004G089400 Sobic002G273500--Sobic004G089400 Sobic006G067300 Sobic006G067300 Sobic002G273500--Sobic006G067300 Sobic005G006701 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Octagon: transcription factors


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