Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G238300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YL47
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G253600 OsFBL18 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
2 Sobic.004G093100 protein kinase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.010G010201 - -
4 Sobic.001G135800 pentatricopeptide, putative, expressed -
5 Sobic.006G115700 WRKY35, expressed K18835: WRKY transcription factor 2
6 Sobic.007G142801 - -
7 Sobic.010G142401 - -
8 Sobic.008G071400 no apical meristem protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G066100 conserved hypothetical protein -
10 Sobic.001G172100 - -
11 Sobic.002G121450 - -
12 Sobic.008G165401 - -
13 Sobic.001G432200 pleckstrin homology domain-containing protein-related taxo, putative, expressed -
14 Sobic.003G297100 expressed protein -
15 Sobic.001G110250 - -
16 Sobic.004G136100 - -
17 Sobic.002G158401 - -
18 Sobic.004G149500 expressed protein -
19 Sobic.008G055200 dirigent, putative, expressed -
20 Sobic.009G242200 CGMC_MAPKCMGC_2.3 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K04371: ERK, mitogen-activated protein kinase 1/3


Gene co-expression network
sample Sobic010G238300 Sobic010G238300 Sobic010G253600 Sobic010G253600 Sobic010G238300--Sobic010G253600 Sobic004G093100 Sobic004G093100 Sobic010G238300--Sobic004G093100 Sobic010G010201 Sobic010G010201 Sobic010G238300--Sobic010G010201 Sobic001G135800 Sobic001G135800 Sobic010G238300--Sobic001G135800 Sobic006G115700 Sobic006G115700 Sobic010G238300--Sobic006G115700 Sobic007G142801 Sobic007G142801 Sobic010G238300--Sobic007G142801 Sobic010G142401 Sobic010G142401 Sobic010G238300--Sobic010G142401 Sobic008G071400 Sobic008G071400 Sobic010G238300--Sobic008G071400 Sobic006G066100 Sobic006G066100 Sobic010G238300--Sobic006G066100 Sobic010G253600--Sobic010G238300 Sobic010G253600--Sobic001G135800 Sobic010G253600--Sobic007G142801 Sobic010G253600--Sobic010G142401 Sobic010G253600--Sobic006G115700 Sobic010G253600--Sobic010G010201 Sobic001G172100 Sobic001G172100 Sobic010G253600--Sobic001G172100 Sobic003G297100 Sobic003G297100 Sobic010G253600--Sobic003G297100 Sobic005G002100 Sobic005G002100 Sobic010G253600--Sobic005G002100 Sobic004G093100--Sobic008G071400 Sobic004G093100--Sobic010G238300 Sobic004G093100--Sobic010G253600 Sobic004G093100--Sobic006G115700 Sobic004G093100--Sobic010G010201 Sobic002G084700 Sobic002G084700 Sobic004G093100--Sobic002G084700 Sobic004G093100--Sobic001G135800 Sobic001G432200 Sobic001G432200 Sobic004G093100--Sobic001G432200 Sobic006G204500 Sobic006G204500 Sobic004G093100--Sobic006G204500 Sobic010G128350 Sobic010G128350 Sobic010G010201--Sobic010G128350 Sobic010G010201--Sobic001G432200 Sobic010G010201--Sobic010G253600 Sobic010G010201--Sobic007G142801 Sobic002G088600 Sobic002G088600 Sobic010G010201--Sobic002G088600 Sobic003G093100 Sobic003G093100 Sobic010G010201--Sobic003G093100 Sobic001G165901 Sobic001G165901 Sobic010G010201--Sobic001G165901 Sobic010G010201--Sobic001G135800 Sobic010G010201--Sobic001G172100 Sobic001G135800--Sobic006G115700 Sobic001G135800--Sobic007G142801 Sobic001G135800--Sobic003G297100 Sobic001G135800--Sobic001G172100 Sobic005G026700 Sobic005G026700 Sobic001G135800--Sobic005G026700 Sobic003G164400 Sobic003G164400 Sobic001G135800--Sobic003G164400 Sobic002G000200 Sobic002G000200 Sobic001G135800--Sobic002G000200 Sobic001G135800--Sobic005G002100 Sobic009G061500 Sobic009G061500 Sobic001G135800--Sobic009G061500 Sobic006G115700--Sobic003G297100 Sobic006G115700--Sobic007G142801 Sobic006G115700--Sobic001G135800 Sobic002G364700 Sobic002G364700 Sobic006G115700--Sobic002G364700 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic006G115700--Sobic009G061601 Sobic006G115700--Sobic001G432200 Sobic005G176700 Sobic005G176700 Sobic006G115700--Sobic005G176700 Sobic006G115700--Sobic006G204500 Sobic001G370400 Sobic001G370400 Sobic006G115700--Sobic001G370400 Sobic007G142801--Sobic001G172100 Sobic007G142801--Sobic003G297100 Sobic007G142801--Sobic005G026700 Sobic007G142801--Sobic005G002100 Sobic007G142801--Sobic003G164400 Sobic007G142801--Sobic002G000200 Sobic007G131000 Sobic007G131000 Sobic007G142801--Sobic007G131000 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic007G142801--Sobic005G214800 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic007G142801--Sobic001G246001 Sobic010G142401--Sobic007G142801 Sobic010G142401--Sobic001G172100 Sobic010G142401--Sobic005G002100 Sobic010G142401--Sobic005G026700 Sobic010G142401--Sobic003G164400 Sobic010G142401--Sobic002G000200 Sobic010G142401--Sobic003G297100 Sobic005G187600 Sobic005G187600 Sobic010G142401--Sobic005G187600 Sobic003G111000 Sobic003G111000 Sobic010G142401--Sobic003G111000 Sobic008G071400--Sobic002G084700 Sobic008G057800 Sobic008G057800 Sobic008G071400--Sobic008G057800 Sobic009G167201 Sobic009G167201 Sobic008G071400--Sobic009G167201 Sobic004G136100 Sobic004G136100 Sobic008G071400--Sobic004G136100 Sobic004G080800 Sobic004G080800 Sobic008G071400--Sobic004G080800 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic008G071400--Sobic006G173400 Sobic008G071400--Sobic004G093100 Sobic006G234400 Sobic006G234400 Sobic008G071400--Sobic006G234400 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic008G071400--Sobic002G225800 Sobic006G066100--Sobic007G142801 Sobic009G242200 Sobic009G242200 Sobic006G066100--Sobic009G242200 Sobic006G066100--Sobic001G172100 Sobic006G066100--Sobic005G026700 Sobic006G066100--Sobic003G297100 Sobic006G066100--Sobic005G002100 Sobic005G170400 Sobic005G170400 Sobic006G066100--Sobic005G170400 Sobic010G111000 Sobic010G111000 Sobic006G066100--Sobic010G111000 Sobic006G066100--Sobic003G164400
Octagon: transcription factors


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