Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G095100.1,Sobic.001G095100.2
Synonym RR24, Sb01g008510, ARR24
Functional annotation response regulator receiver domain containing protein, expressed
UniProt C5X190 , A0A1Z5S5I6
Pfam PF00072
Panther DB PTHR24423 PTHR26402 PTHR26402:SF606
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0000160; phosphorelay signal transduction system


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G26594 : response regulator 24
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g53100.1 : response regulator receiver domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008094
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5A02G381600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G070100 tentative name(PubMedID : 31536532)@core histone H2A/H2B/H3/H4, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
2 Sobic.004G054600 porphobilinogen deaminase, chloroplast precursor, putative, expressed -
3 Sobic.004G024500 plant neutral invertase domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G454700 expressed protein -
5 Sobic.009G128400 peptide-N4-asparagine amidase A, putative, expressed -
6 Sobic.007G107800 expressed protein -
7 Sobic.006G244200 OsFBDUF42 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G332933 - -
9 Sobic.003G224900 - -
10 Sobic.004G145550 - -
11 Sobic.003G384750 - -
12 Sobic.006G143800 - -
13 Sobic.006G231900 SPRY-domain containing protein, putative, expressed K15047: HNRNPUL1, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 1
14 Sobic.001G520600 DNA topoisomerase 2, putative, expressed -
15 Sobic.001G462300 cyclin, putative, expressed K06627: cyclin-A
16 Sobic.009G180700 transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
17 Sobic.007G010100 expressed protein -
18 Sobic.001G488300 - -
19 Sobic.002G408400 beta-amylase, putative, expressed -
20 Sobic.003G092000 expressed protein K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1


Gene co-expression network
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Sobic007G010100 Sobic003G224900--Sobic007G010100
Octagon: transcription factors


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