Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G095432.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S4Z1
Pfam PF00646
Panther DB PTHR31111
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G16220 : F-box and associated interaction domains-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g07950.1 : OsFBX160 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G014100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
2 Sobic.003G005500 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.008G046200 PHD-finger family protein, expressed -
4 Sobic.003G423800 endonuclease, putative, expressed K08991: crossover junction endonuclease MUS81
5 Sobic.004G027150 - -
6 Sobic.009G214500 IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G010500 frigida, putative, expressed -
8 Sobic.008G180200 expressed protein -
9 Sobic.009G163400 growth regulator related protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G009700 OsFBX182 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.009G125800 expressed protein -
12 Sobic.008G141900 ZOS12-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
13 Sobic.009G012400 RPA1C - Putative single-stranded DNA binding complex subunit 1, expressed K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
14 Sobic.002G286632 - -
15 Sobic.006G189000 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K10577: UBE2I, ubiquitin-conjugating enzyme E2 I
16 Sobic.004G117400 expressed protein -
17 Sobic.007G102300 formin, putative, expressed -
18 Sobic.003G045450 - -
19 Sobic.005G210500 - K10901: BLM, RECQL3, bloom syndrome protein
20 Sobic.002G144600 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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