Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G204400.1
Synonym ATMYB87, Sb01g018060, MYB87
Functional annotation MYB family transcription factor, putative, expressed
UniProt A0A1B6QJZ3
Pfam PF00249
Panther DB PTHR10641 PTHR10641:SF666
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G37780 : myb domain protein 87
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g35660.1 : MYB family transcription factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT67643 , PNT67644
Barley HORVU1Hr1G051980.2 , HORVU1Hr1G045090.1
Wheat TraesCS1D02G204500 , TraesCS1A02G169400 , TraesCS1B02G215500 , TraesCS1A02G201100
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G336300 C2 domain containing protein, putative, expressed -
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3 Sobic.002G375600 expressed protein -
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17 Sobic.001G380100 DUF623 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G399800 Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure.(PubMedID : 23755192)@expressed protein -
19 Sobic.006G269300 - -
20 Sobic.004G310400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K11982: E3 ubiquitin-protein ligase RNF115/126


Gene co-expression network
sample Sobic001G204400 Sobic001G204400 Sobic003G336300 Sobic003G336300 Sobic001G204400--Sobic003G336300 Sobic009G192933 Sobic009G192933 Sobic001G204400--Sobic009G192933 Sobic002G375600 Sobic002G375600 Sobic001G204400--Sobic002G375600 Sobic002G266250 Sobic002G266250 Sobic001G204400--Sobic002G266250 Sobic001G460150 Sobic001G460150 Sobic001G204400--Sobic001G460150 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic001G204400--Sobic009G049100 Sobic004G258450 Sobic004G258450 Sobic001G204400--Sobic004G258450 Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic001G204400--Sobic008G024700 Sobic007G031000 Sobic007G031000 Sobic001G204400--Sobic007G031000 Sobic003G336300--Sobic009G049100 Sobic003G336300--Sobic004G258450 Sobic003G336300--Sobic001G460150 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic003G336300--Sobic004G310400 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic003G336300--Sobic004G144300 Sobic003G336300--Sobic008G024700 Sobic006G121200 Sobic006G121200 Sobic003G336300--Sobic006G121200 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic003G336300--Sobic003G298000 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic003G336300--Sobic003G399800 Sobic002G085600 Sobic002G085600 Sobic009G192933--Sobic002G085600 Sobic001G113400 Sobic001G113400 Sobic009G192933--Sobic001G113400 Sobic009G192933--Sobic004G144300 Sobic001G019601 Sobic001G019601 Sobic009G192933--Sobic001G019601 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic009G192933--Sobic002G001500 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic009G192933--Sobic003G362800 Sobic003G001650 Sobic003G001650 Sobic009G192933--Sobic003G001650 Sobic004G305300 Sobic004G305300 Sobic009G192933--Sobic004G305300 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic009G192933--Sobic002G274000 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic002G375600--Sobic002G429200 Sobic002G375600--Sobic007G031000 Sobic005G230600 Sobic005G230600 Sobic002G375600--Sobic005G230600 Sobic003G292800 Sobic003G292800 Sobic002G375600--Sobic003G292800 Sobic009G005750 Sobic009G005750 Sobic002G375600--Sobic009G005750 Sobic002G189350 Sobic002G189350 Sobic002G375600--Sobic002G189350 Sobic002G295550 Sobic002G295550 Sobic002G375600--Sobic002G295550 Sobic004G071401 Sobic004G071401 Sobic002G375600--Sobic004G071401 Sobic002G003900 Sobic002G003900 Sobic002G375600--Sobic002G003900 Sobic007G174200 Sobic007G174200 Sobic002G266250--Sobic007G174200 Sobic002G227100 Sobic002G227100 Sobic002G266250--Sobic002G227100 Sobic002G266250--Sobic009G192933 Sobic002G280001 Sobic002G280001 Sobic002G266250--Sobic002G280001 Sobic002G266250--Sobic001G204400 Sobic002G266250--Sobic004G305300 Sobic004G203600 Sobic004G203600 Sobic002G266250--Sobic004G203600 Sobic003G079600 Sobic003G079600 Sobic002G266250--Sobic003G079600 Sobic001G350300 Sobic001G350300 Sobic002G266250--Sobic001G350300 Sobic001G460150--Sobic009G049100 Sobic001G460150--Sobic008G024700 Sobic001G460150--Sobic004G258450 Sobic001G460150--Sobic003G336300 Sobic010G084900 Sobic010G084900 Sobic001G460150--Sobic010G084900 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic001G460150--Sobic004G190800 Sobic001G460150--Sobic004G144300 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic001G460150--Sobic007G046600 Sobic001G460150--Sobic003G298000 Sobic009G049100--Sobic008G024700 Sobic009G049100--Sobic001G460150 Sobic009G049100--Sobic003G336300 Sobic009G049100--Sobic004G190800 Sobic009G049100--Sobic004G144300 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic009G049100--Sobic009G252500 Sobic009G049100--Sobic003G298000 Sobic009G049100--Sobic004G310400 Sobic009G049100--Sobic007G046600 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic004G258450--Sobic004G237900 Sobic004G258450--Sobic003G399800 Sobic004G258450--Sobic003G336300 Sobic004G258450--Sobic001G460150 Sobic004G258450--Sobic009G049100 Sobic004G258450--Sobic003G298000 Sobic004G258450--Sobic002G429200 Sobic004G258450--Sobic004G144300 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic004G258450--Sobic004G070150 Sobic008G024700--Sobic009G049100 Sobic008G024700--Sobic001G460150 Sobic008G024700--Sobic004G190800 Sobic008G024700--Sobic006G121200 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic008G024700--Sobic002G360701 Sobic008G024700--Sobic003G336300 Sobic001G513900 Sobic001G513900 Sobic008G024700--Sobic001G513900 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic008G024700--Sobic001G487250 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic008G024700--Sobic004G223350 Sobic007G031000--Sobic002G375600 Sobic007G031000--Sobic009G005750 Sobic007G031000--Sobic002G295550 Sobic007G031000--Sobic002G429200 Sobic001G227601 Sobic001G227601 Sobic007G031000--Sobic001G227601 Sobic003G192801 Sobic003G192801 Sobic007G031000--Sobic003G192801 Sobic007G031000--Sobic005G230600 Sobic007G031000--Sobic003G292800 Sobic002G427201 Sobic002G427201 Sobic007G031000--Sobic002G427201
Octagon: transcription factors


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