Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G183900.1
Synonym Sb10g023450
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YL41
Pfam -
Panther DB PTHR34537 PTHR34537:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G02180 : ferredoxin-related
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g58740.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022714
Brachypodium KQK02194
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G004901 - -
2 Sobic.002G375600 expressed protein -
3 Sobic.001G227601 - -
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7 Sobic.008G024700 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
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9 Sobic.004G258450 - -
10 Sobic.002G429200 expressed protein -
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13 Sobic.007G031000 X8 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G513900 - -
15 Sobic.003G336300 C2 domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.009G049100 - -
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18 Sobic.001G460150 - -
19 Sobic.004G084800 - -
20 Sobic.002G262500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@osFTL4 FT-Like4 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T


Gene co-expression network
sample Sobic010G183900 Sobic010G183900 Sobic001G004901 Sobic001G004901 Sobic010G183900--Sobic001G004901 Sobic002G375600 Sobic002G375600 Sobic010G183900--Sobic002G375600 Sobic001G227601 Sobic001G227601 Sobic010G183900--Sobic001G227601 Sobic002G208301 Sobic002G208301 Sobic010G183900--Sobic002G208301 Sobic001G204400 Sobic001G204400 Sobic010G183900--Sobic001G204400 Sobic002G427201 Sobic002G427201 Sobic010G183900--Sobic002G427201 Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic010G183900--Sobic008G024700 Sobic004G341500 Sobic004G341500 Sobic010G183900--Sobic004G341500 Sobic004G258450 Sobic004G258450 Sobic010G183900--Sobic004G258450 Sobic001G004901--Sobic002G427201 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic001G004901--Sobic002G262500 Sobic003G396400 Sobic003G396400 Sobic001G004901--Sobic003G396400 Sobic003G292800 Sobic003G292800 Sobic001G004901--Sobic003G292800 Sobic001G004901--Sobic002G375600 Sobic001G004901--Sobic010G183900 Sobic002G189350 Sobic002G189350 Sobic001G004901--Sobic002G189350 Sobic001G065400 Sobic001G065400 Sobic001G004901--Sobic001G065400 Sobic001G004901--Sobic004G341500 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic002G375600--Sobic002G429200 Sobic007G031000 Sobic007G031000 Sobic002G375600--Sobic007G031000 Sobic005G230600 Sobic005G230600 Sobic002G375600--Sobic005G230600 Sobic002G375600--Sobic003G292800 Sobic009G005750 Sobic009G005750 Sobic002G375600--Sobic009G005750 Sobic002G375600--Sobic002G189350 Sobic002G295550 Sobic002G295550 Sobic002G375600--Sobic002G295550 Sobic004G071401 Sobic004G071401 Sobic002G375600--Sobic004G071401 Sobic002G003900 Sobic002G003900 Sobic002G375600--Sobic002G003900 Sobic001G227601--Sobic009G005750 Sobic004G087900 Sobic004G087900 Sobic001G227601--Sobic004G087900 Sobic003G315900 Sobic003G315900 Sobic001G227601--Sobic003G315900 Sobic001G227601--Sobic007G031000 Sobic001G227601--Sobic002G208301 Sobic001G227601--Sobic002G375600 Sobic009G106300 Sobic009G106300 Sobic001G227601--Sobic009G106300 Sobic003G017300 Sobic003G017300 Sobic001G227601--Sobic003G017300 Sobic001G227601--Sobic004G258450 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic002G208301--Sobic003G399800 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic002G208301--Sobic009G049100 Sobic002G208301--Sobic001G227601 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic002G208301--Sobic002G107700 Sobic003G276400 Sobic003G276400 Sobic002G208301--Sobic003G276400 Sobic006G165501 Sobic006G165501 Sobic002G208301--Sobic006G165501 Sobic001G385132 Sobic001G385132 Sobic002G208301--Sobic001G385132 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic002G208301--Sobic004G237900 Sobic010G184201 Sobic010G184201 Sobic002G208301--Sobic010G184201 Sobic003G336300 Sobic003G336300 Sobic001G204400--Sobic003G336300 Sobic009G192933 Sobic009G192933 Sobic001G204400--Sobic009G192933 Sobic001G204400--Sobic002G375600 Sobic002G266250 Sobic002G266250 Sobic001G204400--Sobic002G266250 Sobic001G460150 Sobic001G460150 Sobic001G204400--Sobic001G460150 Sobic001G204400--Sobic009G049100 Sobic001G204400--Sobic004G258450 Sobic001G204400--Sobic008G024700 Sobic001G204400--Sobic007G031000 Sobic002G427201--Sobic002G262500 Sobic001G396550 Sobic001G396550 Sobic002G427201--Sobic001G396550 Sobic006G242600 Sobic006G242600 Sobic002G427201--Sobic006G242600 Sobic002G427201--Sobic001G004901 Sobic002G427201--Sobic003G396400 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic002G427201--Sobic010G217466 Sobic002G427201--Sobic002G375600 Sobic002G427201--Sobic002G429200 Sobic009G221701 Sobic009G221701 Sobic002G427201--Sobic009G221701 Sobic008G024700--Sobic009G049100 Sobic008G024700--Sobic001G460150 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic008G024700--Sobic004G190800 Sobic006G121200 Sobic006G121200 Sobic008G024700--Sobic006G121200 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic008G024700--Sobic002G360701 Sobic008G024700--Sobic003G336300 Sobic001G513900 Sobic001G513900 Sobic008G024700--Sobic001G513900 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic008G024700--Sobic001G487250 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic008G024700--Sobic004G223350 Sobic004G084800 Sobic004G084800 Sobic004G341500--Sobic004G084800 Sobic004G139201 Sobic004G139201 Sobic004G341500--Sobic004G139201 Sobic004G341500--Sobic001G004901 Sobic003G390600 Sobic003G390600 Sobic004G341500--Sobic003G390600 Sobic004G341500--Sobic010G183900 Sobic004G045100 Sobic004G045100 Sobic004G341500--Sobic004G045100 Sobic004G073700 Sobic004G073700 Sobic004G341500--Sobic004G073700 Sobic007G218550 Sobic007G218550 Sobic004G341500--Sobic007G218550 Sobic004G341500--Sobic002G427201 Sobic004G258450--Sobic004G237900 Sobic004G258450--Sobic003G399800 Sobic004G258450--Sobic003G336300 Sobic004G258450--Sobic001G460150 Sobic004G258450--Sobic009G049100 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic004G258450--Sobic003G298000 Sobic004G258450--Sobic002G429200 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic004G258450--Sobic004G144300 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic004G258450--Sobic004G070150
Octagon: transcription factors


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